לדלג לתוכן

איגור אוליצקי

הוספת קישורים
מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית
איגור אוליצקי
Igor Ulitsky
לידה 26 באוגוסט 1980 (בן 45)
סנקט פטרבורג, ברית המועצות עריכת הנתון בוויקינתונים
מדינה ישראל
השכלה אוניברסיטת תל אביב
מנחה לדוקטורט רון שמיר
עיסוק גנטיקאי, ביואינפורמטיקן
מעסיק מכון ויצמן למדע
פרסים והוקרה פרס בלווטניק (2020)
תרומות עיקריות
חקר מולקולות רנ"א ארוכות לא-מקודדות: מבנה ותפקוד, מצבי פעולה ואבולוציה
לעריכה בוויקינתונים שמשמש מקור לחלק מהמידע בתבנית

איגור אוליצקי (נולד ב-26 באוגוסט 1980) הוא גנטיקאי וביואינפורמטיקן ישראלי, פרופסור מן המניין בפקולטה לביולוגיה במכון ויצמן למדע המכהן כדקאן הפקולטה. מומחה לחקר רנ"א ארוך לא-מקודד.

ביוגרפיה

[עריכת קוד מקור | עריכה]

איגור אוליצקי נולד בסנקט פטרבורג. בגיל 10 עלה לישראל עם משפחתו. סיים את לימודי התיכון בבית הספר להנדסאים ברמת אביב ב-1998 ואת שירותו בצה"ל עשה בחיל הטכנולוגיה והאחזקה.

למד לתואר ראשון בתוכנית הדו-חוגית במדעי המחשב ובמדעי החיים עם התמחות בביואינפורמטיקה באוניברסיטת תל אביב, אותו השלים בהצטיינות ב-2004. המשיך ללימודי תואר שלישי (במסלול ישיר) במדעי המחשב באוניברסיטת תל אביב.[1] עבודת הדוקטורט שלו, שבוצעה בהנחיית פרופ' רון שמיר ונשאה את הכותרת "אלגוריתמים מבוססי-רשת לניתוח מידע ביו-רפואי רבגוני", הוגשה ב-2009.[2] עם קבלת תואר הדוקטור יצא לארצות הברית ושהה כעמית בתר-דוקטורט במכון וייטהד למדעי הביו-רפואה המקושר למכון הטכנולוגי של מסצ'וסטס,[2] בהנחיית פרופ' דייוויד בארטל (אנ').

עם שובו לישראל ב-2013 הצטרף לסגל המחלקה לבקרה ביולוגית במכון ויצמן למדע, בדרגת מדען בכיר. בהמשך המחלקה הפכה למחלקה לאימונולוגיה וביולוגיה רגנרטיבית והוא הצטרף גם למחלקה לנוירוביולוגיה מולקולרית. ב-2020 מונה לפרופסור חבר.[1]

החל מ-2022 הוא מכהן כראש מרכז אביש-פרנקל לריפוי ברנ"א וכראש ועדת ההוראה לביולוגיה בבית הספר למחקר. ב-2016–2023 שימש חבר הוועד המנהל של החברה הישראלית לביולוגיה חישובית. שהה כחוקר אורח בשבתון במכון מקס פלאנק לגנטיקה מולקולרית בברלין. שימש לאורך השנים כיועץ חיצוני למספר חברות בתחומי הפארמה וההנדסה הגנטית.

בדצמבר 2025 החל אוליצקי את תפקידו כדקאן הפקולטה לביולוגיה.[3]

מחקר

[עריכת קוד מקור | עריכה]

לאורך השנים פרסם אוליצקי מעל 160 מאמרים ורשם שני פטנטים.

תפקודים של רנ"א ארוך לא-מקודד

[עריכת קוד מקור | עריכה]

כדי להבין את תפקוד מולקולות אלה (בראשי תיבות lncRNA), הקים אוליצקי מספר מערכות ניסוי שבהן ניתן לשבש או להפעיל ביטוי של llncRNA באמצעות RNAi, עריכת קריספר או שיבוש קריספר. לאורך השנים עסקה קבוצתו בהתמיינות תאי גזע עובריים אנושיים ועכבריים (ESCs) לתאי אב עצביים ולנוירונים;[4] התמיינות תאי גזע עובריים אנושיים לתאים שונים משושלת האנדודרם; [5] עכברים טרנסגניים (השבתה של lncRNA);[6][7] הפעלה והתחדשות עצבית בתרבית;[8] יצירת זיכרון במערכת העצבים המרכזית;[9] תגובת תאי סרטן השד לאותות חיצוניים.[10]

מצבי פעולה של רנ"א ארוך לא-מקודד

[עריכת קוד מקור | עריכה]

מטרת אפיק מחקר זה היא להבין את ה"קודים" המניעים את פעילות ה-lncRNA. פענוח הקודים הללו חשוב, למשל, כדי להבין את ההשפעה של מוטציות (שניתן כיום לזהות בקלות באמצעות ריצוף גנום מלא) על תפקוד ה-lncRNA וכדי לדרג וריאנטים שעשויים להיות בעלי השפעה ביולוגית משמעותית. מאחר שתפקוד ה-lncRNA עדיין אינו מובן היטב, קבוצתו של אוליצקי נוקטת גישה משולבת, שמטרתה להפיק תובנות לגבי מנגנוני הפעולה של lncRNA ממקורות שונים:

  • סריקות עתירות תפוקה (אנ') – שימוש בשיטות מבוססות-מאגר (pooled) ליצירה ולמוטגנזה של עשרות אלפי אתרים מ-lncRNA שונים ובדיקת יכולתם למלא תפקודים תאיים ומולקולריים מסוימים.[11]
  • חקירה מעמיקה של lncRNA ספציפיים – שימוש בקונסטרוקטים סינתטיים, מערכות ריפורטר והנדסה גנומית כדי לנתח את תרומת הרצף והמבנה לתפקוד של lncRNA שונים הנחקרים במעבדה.[12][13][14]
  • גנומיקה השוואתית – פיתוח שיטות חישוביות לזיהוי רצפים ומבנים שמורים ב-lncRNA על ידי השוואת רצפים הומולוגיים ממינים שונים.[15]

אבולוציה של הגנום הלא-מקודד

[עריכת קוד מקור | עריכה]

הניתוח ההשוואתי מילא תפקיד חשוב בהבנת הכללים המנחים את תפקוד החלבונים וה-microRNA, אך היה קשה ליישם שיטות קיימות לחקר lncRNA בשל מחסור באנוטציות והאבולוציה המהירה שלהם. כדי לבנות קטלוג של lncRNA בחולייתנים, אוליצקי וקבוצתו אספו נתוני RNA-seq ו-3P-seq ופיתחו שיטות אמינות לזיהוי lncRNA ב-17 מינים.[16] פותחו גם שיטות לזיהוי הומולוגים של lncRNA על בסיס דמיון רצף עדין ושימור של גנים סמוכים והקשר גנומי. באמצעות קטלוגים אלה נמצא כי המחזוריות המהירה של רוב גני ה-lncRNA מלווה בשימור מיקומי אצל חלקם ובשמירה על איים קצרים של רצף שמור אצל אחרים.

לאחר מכן הקבוצה התמקדה במקורות האבולוציוניים של אותם lncRNA שנמצאים רק ביונקים, ועקבה אחרי כ-5% מהם אל גנים מקודדי חלבון שאיבדו את פוטנציאל הקידוד שלהם לפני עליית היונקים.[17] ל-lncRNA שמקורם בפסאודוגנים מאפיינים ייחודיים המבדילים אותם מ-lncRNA אחרים, כגון תחומי ביטוי רחבים יותר. אוליצקי וקבוצתו מפתחים שיטות לכריית הרצפים של אותם lncRNA ששומרים על רצף או מיקום, ולזיהוי צירופים שמורים של רצפי משנה או מבנים שלא ניתנים לזיהוי באמצעות שיטות הקיימות לחקר גנים מקודדי חלבון.[18]

גורל מולקולות RNA ארוכות בתאים יונקים

[עריכת קוד מקור | עריכה]

מוקד נוסף של המחקר עוסק בתהליכים המתרחשים ברנ"א ארוך (mRNA ו-lncRNA) לאחר ששעתוקם מסתיים, וכיצד רצפיהם, מבני הרנ"א, ארכיטקטורת הגנים והמיקום הגנומי משפיעים על כך. בפרט, אוליצקי עוסק בשאלות הבאות: מדוע חלקם נשארים על הכרומטין, אחרים מתעכבים בגרעין, ואחרים יוצאים לציטוזול תוך דקות? ברגע שהם בציטוזול, מה קובע את יציבותם? בנוסף, הקבוצה עוסקת בתהליכים המתרחשים ברנ"א תרפויטי אקסוגני שמוחדר לתאים באמצעות ננו-חלקיקים ליפידיים, וכיצד ניתן להנדס את גורלו כדי לפתח טיפולי רנ"א יעילים ורב-תכליתיים.

פרסים והוקרה

[עריכת קוד מקור | עריכה]

חיים אישיים

[עריכת קוד מקור | עריכה]

אוליצקי נשוי לליעד ואב לארבעה, מתגורר במכון ויצמן.[1]

קישורים חיצוניים

[עריכת קוד מקור | עריכה]

הערות שוליים

[עריכת קוד מקור | עריכה]
  1. ^ 1 2 3 פרופ' איגור אוליצקי, באתר האקדמיה הצעירה הישראלית
  2. ^ 1 2 Igor Ulitsky, Network-based algorithms for analysis of heterogeneous biomedical data, tau.primo.exlibrisgroup.com, ‏2009
  3. ^ בית הספר למחקר – מכון ויצמן, הודעה על מינויו של אוליצקי לדקאן, באתר פייסבוק, ‏2 בספטמבר 2025
  4. ^ Hadas Hezroni, Rotem Ben‐Tov Perry, Noa Gil, Neta Degani, Igor Ulitsky, Regulation of neuronal commitment in mouse embryonic stem cells by the Reno1/Bahcc1 locus, EMBO reports 21, 2020-11-05, עמ' e51264 doi: 10.15252/embr.202051264
  5. ^ Neta Degani, Yoav Lubelsky, Rotem Ben-Tov Perry, Elena Ainbinder, Igor Ulitsky, Highly conserved and cis-acting lncRNAs produced from paralogous regions in the center of HOXA and HOXB clusters in the endoderm lineage, PLOS Genetics 17, 19 ביולי 2021, עמ' e1009681 doi: 10.1371/journal.pgen.1009681
  6. ^ Aviv Rom, Liliya Melamed, Noa Gil, Micah Jonathan Goldrich, Rotem Kadir, Matan Golan, Inbal Biton, Rotem Ben-Tov Perry, Igor Ulitsky, Regulation of CHD2 expression by the Chaserr long noncoding RNA gene is essential for viability, Nature Communications 10, 2019-11-08, עמ' 5092 doi: 10.1038/s41467-019-13075-8
  7. ^ Andrew S. Perry, Kaushik Amancherla, Xiaoning Huang, Michelle L. Lance, Eric Farber-Eger, Priya Gajjar, Junedh Amrute, Lindsey Stolze, Shilin Zhao, Quanhu Sheng, Cassandra M. Joynes, Zhongsheng Peng, Toshiko Tanaka, Stavros G. Drakos, Kory J. Lavine, Craig Selzman, Joseph R. Visker, Thirupura S. Shankar, Luigi Ferrucci, Saumya Das, Jane Wilcox, Ravi B. Patel, Ravi Kalhan, Sanjiv J. Shah, Keenan A. Walker, Quinn Wells, Nathan Tucker, Matthew Nayor, Ravi V. Shah, Sadiya S. Khan, Clinical-transcriptional prioritization of the circulating proteome in human heart failure, Cell Reports Medicine 5, 2024-09-17 doi: 10.1016/j.xcrm.2024.101704
  8. ^ Rotem Ben-Tov Perry, Hadas Hezroni, Micah Jonathan Goldrich, Igor Ulitsky, Regulation of Neuroregeneration by Long Noncoding RNAs, Molecular Cell 72, 2018-11-01, עמ' 553–567.e5 doi: 10.1016/j.molcel.2018.09.021
  9. ^ Rotem Ben-Tov Perry, Michael Tsoory, Michael Tolmasov, Igor Ulitsky, Silc1 long noncoding RNA is an immediate-early gene promoting efficient memory formation, Cell Reports 42, 2023-10-31 doi: 10.1016/j.celrep.2023.113168
  10. ^ Nishanth Belugali Nataraj, Ashish Noronha, Joo Sang Lee, Soma Ghosh, Harsha Raj Mohan Raju, Arunachalam Sekar, Binyamin Zuckerman, Moshit Lindzen, Emilio Tarcitano, Swati Srivastava, Michael Selitrennik, Ido Livneh, Diana Drago-Garcia, Oscar Rueda, Carlos Caldas, Sima Lev, Tamar Geiger, Aaron Ciechanover, Igor Ulitsky, Rony Seger, Eytan Ruppin, Yosef Yarden, Nucleoporin-93 reveals a common feature of aggressive breast cancers: robust nucleocytoplasmic transport of transcription factors, Cell Reports 38, 2022-02, עמ' 110418 doi: 10.1016/j.celrep.2022.110418
  11. ^ Yoav Lubelsky, Igor Ulitsky, Sequences enriched in Alu repeats drive nuclear localization of long RNAs in human cells, Nature 555, 2018-03, עמ' 107–111 doi: 10.1038/nature25757
  12. ^ Ailone Tichon, Noa Gil, Yoav Lubelsky, Tal Havkin Solomon, Doron Lemze, Shalev Itzkovitz, Noam Stern-Ginossar, Igor Ulitsky, A conserved abundant cytoplasmic long noncoding RNA modulates repression by Pumilio proteins in human cells, Nature Communications 7, 2016-07-13, עמ' 12209 doi: 10.1038/ncomms12209
  13. ^ Ailone Tichon, Rotem Ben-Tov Perry, Lovorka Stojic, Igor Ulitsky, SAM68 is required for regulation of Pumilio by the NORAD long noncoding RNA, Genes & Development 32, 2018-01-01, עמ' 70–78 doi: 10.1101/gad.309138.117
  14. ^ Svetlana Farberov, Igor Ulitsky, Systematic analysis of the target recognition and repression by the Pumilio proteins, Nucleic Acids Research 52, 2024-11-27, עמ' 13402–13418 doi: 10.1093/nar/gkae929
  15. ^ Catherine L. Peichel, Shaugnessy R. McCann, Joseph A. Ross, Alice F. S. Naftaly, James R. Urton, Jennifer N. Cech, Jane Grimwood, Jeremy Schmutz, Richard M. Myers, David M. Kingsley, Michael A. White, Assembly of the threespine stickleback Y chromosome reveals convergent signatures of sex chromosome evolution, Genome Biology 21, 2020-07-19, עמ' 177 doi: 10.1186/s13059-020-02097-x
  16. ^ Hadas Hezroni, David Koppstein, Matthew G. Schwartz, Alexandra Avrutin, David P. Bartel, Igor Ulitsky, Principles of Long Noncoding RNA Evolution Derived from Direct Comparison of Transcriptomes in 17 Species, Cell Reports 11, 2015-05-19, עמ' 1110–1122 doi: 10.1016/j.celrep.2015.04.023
  17. ^ Hadas Hezroni, Rotem Ben-Tov Perry, Zohar Meir, Gali Housman, Yoav Lubelsky, Igor Ulitsky, A subset of conserved mammalian long non-coding RNAs are fossils of ancestral protein-coding genes, Genome Biology 18, 2017-08-30, עמ' 162 doi: 10.1186/s13059-017-1293-0
  18. ^ Caroline Jane Ross, Aviv Rom, Amit Spinrad, Dikla Gelbard-Solodkin, Neta Degani, Igor Ulitsky, Uncovering deeply conserved motif combinations in rapidly evolving noncoding sequences, Genome Biology 22, 2021-01-11, עמ' 29 doi: 10.1186/s13059-020-02247-1
  19. ^ Edmond J. Safra Center for Bioinformatics, safrabio.cs.tau.ac.il
  20. ^ Fellowships, grants and career support – Young Investigator Programme – EMBO, ‏2020-08-20
  21. ^ RNA Society Mid- and Early-Career Awards, www.rnasociety.org
  22. ^ Igor Ulitsky | Blavatnik Awards for Young Scientists, blavatnikawards.org
  23. ^ Prof. Dr. Igor Ulitsky, www.humboldt-foundation.de
אוחזר מתוך "https://he.wikipedia.org/w/index.php?title=איגור_אוליצקי&oldid=42279119"