אלפא-סינוקלאין

מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית
ערך ללא מקורות
בערך זה אין מקורות ביבליוגרפיים כלל, לא ברור על מה מסתמך הכתוב וייתכן שמדובר במחקר מקורי.
אנא עזרו לשפר את אמינות הערך באמצעות הבאת מקורות לדברים ושילובם בגוף הערך בצורת קישורים חיצוניים והערות שוליים.
אם אתם סבורים כי ניתן להסיר את התבנית, ניתן לציין זאת בדף השיחה.
ערך ללא מקורות
בערך זה אין מקורות ביבליוגרפיים כלל, לא ברור על מה מסתמך הכתוב וייתכן שמדובר במחקר מקורי.
אנא עזרו לשפר את אמינות הערך באמצעות הבאת מקורות לדברים ושילובם בגוף הערך בצורת קישורים חיצוניים והערות שוליים.
אם אתם סבורים כי ניתן להסיר את התבנית, ניתן לציין זאת בדף השיחה.
יש לערוך ערך זה. ייתכן שהערך סובל מבעיות ניסוח, סגנון טעון שיפור או צורך בהגהה, או שיש לעצב אותו, או מפגמים טכניים כגון מיעוט קישורים פנימיים.
אתם מוזמנים לסייע ולערוך את הערך. אם לדעתכם אין צורך בעריכת הערך, ניתן להסיר את התבנית. ייתכן שתמצאו פירוט בדף השיחה.
יש לערוך ערך זה. ייתכן שהערך סובל מבעיות ניסוח, סגנון טעון שיפור או צורך בהגהה, או שיש לעצב אותו, או מפגמים טכניים כגון מיעוט קישורים פנימיים.
אתם מוזמנים לסייע ולערוך את הערך. אם לדעתכם אין צורך בעריכת הערך, ניתן להסיר את התבנית. ייתכן שתמצאו פירוט בדף השיחה.
SNCA
מבנים זמינים
בנק מידע החלבוניםחיפוש אורתולוגים: PDBe RCSB
רשימת מבנים

1XQ8, 2JN5, 2KKW, 2M55, 2X6M, 3Q25, 3Q26, 3Q27, 3Q28, 3Q29, 4BXL, 4R0U, 4R0W, 4RIK, 4RIL, 4ZNN, 5CRW, 2N0A

מזהים
שמות נוספיםSNCA, NACP, PARK1, PARK4, PD1, synuclein alpha
מזהים חיצונייםOMIM: 163890 MGI: 1277151 HomoloGene: 293 GeneCards: SNCA
מיקום הגן (באדם)
כרומוזום 4
כרומוזוםכרומוזום 4[1]
כרומוזום 4
מיקום גנומי עבור SNCA
מיקום גנומי עבור SNCA
עמדה4q22.1התחלה89,700,345 bp[1]
סוף89,838,315 bp[1]
מיקום הגן (בעכבר)
כרומוזום 6 (בעכבר)
כרומוזוםכרומוזום 6 (בעכבר)[2]
כרומוזום 6 (בעכבר)
מיקום גנומי עבור SNCA
מיקום גנומי עבור SNCA
עמדה6 B3|6 29.15 cMהתחלה60,708,559 bp[2]
סוף60,806,839 bp[2]
תבנית ביטוי RNA


נתוני התבטאות נוספים
אונטולוגיית גנים (GO)
תפקיד מולקולרי calcium ion binding
protein N-terminus binding
ferrous iron binding
phospholipid binding
קשירת יוני מתכת
fatty acid binding
oxidoreductase activity
magnesium ion binding
GO:0031493 histone binding
zinc ion binding
cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process
GO:0001948, GO:0016582 קשירת חלבונים
kinesin binding
tau protein binding
copper ion binding
microtubule binding
alpha-tubulin binding
phosphoprotein binding
phospholipase D inhibitor activity
beta-tubulin binding
קשירת חלבון דומה
dynein complex binding
Hsp70 protein binding
cuprous ion binding
enzyme binding
protein domain specific binding
phospholipase binding
actin binding
SNARE binding
מיקום בתא postsynapse
ציטופלזמה
ציטוזול
ממברנה
סינפסה
אזור חוץ תאי
מיטוכונדריון
actin cytoskeleton
perinuclear region of cytoplasm
שלד התא
גרעין התא
rough endoplasmic reticulum
ריבוזום
שלפוחית סינפטית
mitochondrial respiratory chain complex I
platelet alpha granule membrane
terminal bouton
ליזוזום
מערכת גולג'י
אברון תוך-תאי מוקף ממברנה
growth cone
קרום התא
אקסון
cell cortex
inclusion body
nuclear outer membrane
axon terminus
cell junction
cytoplasmic vesicle membrane
חלל חוץ תאי
supramolecular fiber
neuronal cell body
mitochondrial outer membrane
mitochondrial inner membrane
mitochondrial intermembrane space
mitochondrial matrix
קדם-סינפסה
synaptic vesicle membrane
תהליכים ביולוגיים GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
negative regulation of norepinephrine uptake
response to interleukin-1
response to interferon-gamma
regulation of glutamate secretion
response to magnesium ion
synaptic transmission, dopaminergic
regulation of reactive oxygen species biosynthetic process
positive regulation of protein serine/threonine kinase activity
cellular response to epinephrine stimulus
positive regulation of synaptic transmission
cellular response to copper ion
regulation of synaptic vesicle recycling
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
response to cocaine
positive regulation of glutathione peroxidase activity
negative regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
negative regulation of serotonin uptake
regulation of dopamine secretion
regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
response to iron(II) ion
behavioral response to cocaine
regulation of locomotion
adult locomotory behavior
positive regulation of neurotransmitter secretion
cellular response to fibroblast growth factor stimulus
positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation
regulation of acyl-CoA biosynthetic process
positive regulation of endocytosis
synaptic vesicle endocytosis
excitatory postsynaptic potential
regulation of neuronal synaptic plasticity
mitochondrial membrane organization
negative regulation of mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone
chemical synaptic transmission
GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
negative regulation of exocytosis
positive regulation of hydrogen peroxide catabolic process
negative regulation of microtubule polymerization
calcium ion homeostasis
mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport
positive regulation of inositol phosphate biosynthetic process
dopamine biosynthetic process
synapse organization
negative regulation of dopamine metabolic process
positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol
בקרה שלילית של תהליך אפופטוזה
GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process
regulation of neurotransmitter secretion
negative regulation of dopamine uptake involved in synaptic transmission
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
microglial cell activation
dopamine uptake involved in synaptic transmission
response to lipopolysaccharide
protein destabilization
neutral lipid metabolic process
negative regulation of thrombin-activated receptor signaling pathway
membrane organization
negative regulation of transporter activity
negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
regulation of phospholipase activity
negative regulation of chaperone-mediated autophagy
GO:0010260 הזדקנות
receptor internalization
negative regulation of monooxygenase activity
fatty acid metabolic process
dopamine metabolic process
regulation of neuron death
positive regulation of apoptotic process
synaptic vesicle transport
cellular response to oxidative stress
phospholipid metabolic process
negative regulation of histone acetylation
regulation of macrophage activation
positive regulation of receptor recycling
הגברה סינפטית ארוכת טווח
GO:0097285 אפופטוזה
supramolecular fiber organization
regulation of presynapse assembly
positive regulation of inflammatory response
positive regulation of neuron death
negative regulation of neuron death
response to desipramine
regulation of transmembrane transporter activity
regulation of norepinephrine uptake
synaptic vesicle exocytosis
SNARE complex assembly
positive regulation of exocytosis
protein complex oligomerization
protein tetramerization
synaptic vesicle priming
מקורות: Amigo / QuickGO
אורתולוגים
מיניםאדםעכבר
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)
NM_000345
NM_001146054
NM_001146055
NM_007308
NM_001375285

NM_001375286
NM_001375287
NM_001375288
NM_001375290

NM_001042451
NM_009221

RefSeq (חלבון)
NP_000336
NP_001139526
NP_001139527
NP_009292
NP_001362214

NP_001362215
NP_001362216
NP_001362217
NP_001362219

NP_001035916
NP_033247

מיקום (UCSC)Chr 4: 89.7 – 89.84 MbChr 6: 60.71 – 60.81 Mb
חיפוש PubMed[3][4]
ויקינתונים
צפייה/עריכה נתוני אדםצפייה/עריכה נתוני עכבר

אלפא-סינוקלאיןאנגלית: alpha-synuclein או α-synuclein) הוא חלבון ממשפחת הסינוקלאינים[5], הנמצא בכמות גדולה במוח האדם. כמויות קטנות יותר נמצאות בלב, בשרירים וברקמות אחרות. במוח, אלפא-סינוקלאין נמצא בעיקר בקצות תאי העצב, בתוך מבנים הנקראים "קצוות טרום-סינפטיים". שם הוא נכנס לאינטראקציה עם פוספוליפידים ועם חלבונים.

במסגרת תהליך של העברה סינפטית, הקצוות הטרום-סינפטיים משחררים חומרים הקרויים מוליכים עצביים מתוך שלפוחיות סינפטיות. תהליך זה משמש להעברת איתותים בין תאי העצב והוא חיוני לתפקוד התקין של המוח. על אף שתפקיד האלפא-סינוקלאין אינו מובן כהלכה, ישנם מחקרים לפיהם הוא ממלא תפקיד בשמירה על אספקת השלפוחיות הסינפטיות בקצוות הטרום-סינפטיים באמצעות היווצרותן של אשכולות (clustering) של שלפוחיות סינפטיות. הוא עשוי גם לסייע בבקרת השחרור של דופמין, סוג של מוליך עצבי שהוא חיוני, בין השאר, לבקרת התחלתן ועצירתן של תנועות בלתי רצוניות[6]. האלפא-סינוקלאין הוא גם המרכיב העיקרי של גופי לוי האופייניים למחלת פרקינסון[7].

חלבון האלפא-סינוקליאין האנושי מורכב מ-140 חומצות אמינו והוא מקוּדד על ידי הגן SNCA. נמצא כי אלפא-סינוקלאין הוא גם קודמן של המרכיב נון-א-בטא (NACP) (non- A-beta- component precursor) של העמילואיד האופייני למחלת אלצהיימר.

התבטאות ברקמות[עריכת קוד מקור | עריכה]

אלפא-סינוקלאין הוא חלבון מסוג סינוקלאין בעל תפקיד לא ידוע היטב הנמצא בעיקר ברקמת עצב והמהווה כ-1% מכלל החלבונים שבציטוזול של תאי המוח. נמצא בייחוד בנאוקורטקס, היפוקמפוס, החומר השחור, תלמוס ובמוחון. אלפא-סינוקלאין הוא בראש ובראשונה חלבון נוירונלי אך נמצא גם בתאי גלייה.[8] במלנוציטים התבטאות החלבון מווסתת על ידי הגורם MITF - Microphthalmia-associated transcription factor. הימצאות האלפא-סינוקלאין בגרעיני הנוירונים שבמוחות היונקים רומז על תפקיד האלפא-סינוקלאין בגרעין של התא. עם זאת הוא נמצא בעיקר בקצוות הטרום-סינפטיים, גם כשהוא חופשי וגם כשהוא קשור לקרום התאי. בכל רגע נתון 15% מאלפא-סינוקלאין שבנוירונים קשור לקרום התא. מאוחר יותר נמצא כי אלפא סינוקלאין ממוקם במיטוכונדריות הנוירונליות. הוא מתבטא בצורה מוגברת במיטוכונדריה של פקעת ההרחה (Olfactory bulb), ההיפוקמפוס, הסטריאטום ובתלמוס, אזורים שהם עתירים גם באלפא-סינוקלאין ציטוזולי. אולם קליפת המוח והמוחון מהווים יוצאים מן הכלל, בכך שמכילים הרבה מאוד אלפא-סינוקלאין ציטוזולי ורמות נמוכות מאוד של אלפא-סינוקלאין מיטוכונדרי. הוכח כי אלפא סינוקלאין מתמקם בקרום הפנימי של המיטוכונדריות ושההשפעה המעכבת של אלפא-סינוקלאין על הפעילות I המורכבת בשרשרת הנשימה היא תלוית מנה. כמו כן הועלתה הסברה שהאלפא-סינוקלאין במיטוכונדריות מתבטא באופן שונה באזורים מוחיים שונים ושרמות הרקע של האלפא- סינוקלאין עלולות להפריע לתפקוד המיטוכונדריה ולהביא נוירונים מסוימים לניוון.

לפחות שלושה איזופורמים של סינוקלאין נוצרים דרך שחבור חלופי. הצורה הנפוצה ביותר של החלבון והנחקרת ביותר, היא החלבון בעל אורך מלא של 140 חומצות אמינו. איזופורמים אמרים הם אלפא-סינוקלאין-126 החבר שאריות 41–54 עקב חוסר האקסון 3 (exon 3); ואלפא=סינוקלאין 112 החסר שארית 103–130 שנוצר עקב חוסר אקסון 5.

פעילות אוטופורטאוליטית[עריכת קוד מקור | עריכה]

בעזרת ספקטרומטריית מסה המבוססת על ניידות יונים (IMS-MS) בעלת רזולוציה גבוהה על אלפא-סינוקלאין מטוהר בעזרת HPLC in vitro נמצא כי אלפא -סינוקלאין יכול להיות אוטופרוטאוליטי, כלומר לפרק את עצמו תוך היווצרות מגוון של קטעים קטנים. ייתכן כי תוצרים אוטופרוטאוליטים כאלה ממלאים תפקיד כחומרי ביניים או קואנזימים בצבירת האלפא-סינוקלאין in vivo.

מבנה[עריכת קוד מקור | עריכה]

אלפא-סינוקלאין נחשב לחלבון בעל מבנה פנימי משובש, כלומר חסר מבנה תלת-ממדי יחיד ויציב. נכון לשנת 2014 דיווחים רבים רמזו על קיומם של מבנים חלקיים או של מצבים אוליגומריים מובנים בתוך מבנה התמיסה של אלפא-סינוקאלין, אפילו בהיעדרם של ליפידים. מגמה זו נתמכת גם על ידי מספר רב של מדידות של מולקולות בודדות באמצעות מלקחיים אופטיים על עותקים בודדים של אלפא-סינוקלאין מונומרי ועל דימרים או טטרמרים חלבוניים מחוזקים קוולנטית.

רצף[עריכת קוד מקור | עריכה]

המבנה הראשוני של אלפא-סינוקלאין מחולק בדרך כלל לשלושה מתחמים שונים:

  • שיירי 1–60 - עם זיקה חזקה לקרום התא:

קצה אמיני אמפיפאתי שבו בולטים ארבעה שיירי-11 חוזרים, הכוללים רצף הסכמה KTKEGV. לרצף זה נטייה מבנית לסליל אלפא, הדומה לזו של מתחמים המקשרים אפוליפיופרוטאינים.

  • שיירי 61–95: אזור מרכזי הידרופובי, הכולל את "המרכיב הלא-אמילואידדי בטא" (non-amyloid-β component (NAC, המעורב בצבירת חלבונים.
  • שיירי 96–140: אזור בעל חומציות גבוהה ועתיר-פרולין - ללא נטייה מבנית ייחודית

תפקיד[עריכת קוד מקור | עריכה]

באוכלוסייה בדידה של קצוות טרום- סינאפטיים במוח בעת תקופה של סידור סינפטי מחדש נמצא ויסות-מעלה של אלפא-סינוקלאין. מחקרים הצביעו על אינטראקציה משמעותית בין אלפא סינוקלאין לטובולין ואלפא-סינוקלאין מסוגל לפעול לפעמים כחלבון העשוי להלוות למיקרוטובולים, כמו חלבון טאו.

לפי מחקרים נוספים ייתכן כי אלפא-סינוקלאין יכול לפעול כחלבון סוכך ("שפרון" מולקולרי) ביצירת קומפלקסים SNARE. הוא נקשר בעיקר לפוספוליפידים של קרום התא דרך תחום הקצה האמיני ולסינפטוברווין-2 דרך הקצה הקרבוקסילי, ומעורבותו חשובה בפעילות הסינפטית. הצטברו עדויות כי אלפא-סינוקלאין מעורב בתפקוד מערכת גולג'י של הנוירון ובמעברי הבועיות. לכאורה אלפא-סינוקלאין הוא חיוני להתפתחות הנורמלית של התפקודים הקוגניטיביים. עכברי נוקאאוט עם אינאקטיבציה ממוקדת של התבטאות האלפא-סינוקלאין סובלים מפגיעה בלמידה המרחבית ובזיכרון העבודה.

אינטראקציות עם ליפידים[עריכת קוד מקור | עריכה]

מחד קיימים נתונים על האינטראקציה של אלפא-סינוקלאין עם קרום התא ועל מעורבותו בהרכב הקרום ומחזור שלו. מסריקת גנום השמרים נמצא כי מספר גנים המעורבים בחילופי החומרים הליפידים ממלאים תפקיד ברעילות של האלפא-סינוקלאין. מאידך, רמת ההתבטאות של אלפא-סינוקלאין משפיעה על צמיגות ועל הכמות היחסית של חומצות השומן בדו-השכבה הליפידית.

אלפא-סינוקלאין נקשר במישרין עם קרומי הליפידים, תוך התחברות לשטחים הטעונים שלילית של פוספוליפידים. הוא יוצר מבנה מורחב הליקלי על בועיות קטנות. חד-למלריות אלפא-סינוקלאין נראה יוצר חלקיקים דמויי-דיסקה ליפידיים הדומים לאפוליפופרוטאינים. היו מחקרים שתמכו באפשרות של פעילות נוגדת חימצון של האלפא-סינוקלאין בקרום.

אינטראקציות עם חלבונים[עריכת קוד מקור | עריכה]

הוכח שאלפא-סינוקלאין נכנס לאינטראקציה עם:

  • מוליך דופמין
  • ליגז "פרקין"
  • פוספוליפאז
  • SNCAIP
  • חלבוני טאו
  • אמילואיד בטא

משמעות קלינית[עריכת קוד מקור | עריכה]

מבחן אימונו-היסטוכימי לאלפא-סינוקלאין מצביע על צביעה חיובית (חומה) של גוף לוי תוך-עצבי בחומר השחור אצל חולה במחלת פרקינסון
אירועים במנגנון ההשפעה הרעילה של האלפא-סינוקלאין

בזמנו נחשב אלפא-סינוקלאין לחלבון מסיס בלתי מובנה. עם זאת צורות שלו שלא עברו מוטציה יוצרות טטרמר מקופל יציב עמיד בפני צבירה. אף על פי שנתון זה שוחזר והורחב בכמה מעבדות, הוא עדיין שנוי במחלוקת. עם זאת אלפא-סינוקלאין מצטבר כדי ליצור פיברילים (סיבונים) בלתי מסיסים במצבים פתולוגיים המתאפיינים בקיומם של גופי לוי, כדוגמת מחלת פרקינסון, הקהיון עם גופי לוי והאטרופיה המערכתית הנפוצה. הפרעות אלה נקראות סינוקלאינופאתיות. האלפא-סינוקלאין הוא המרכיב המבני הראשוני של סיבוני גופי לוי. לעיתים מכילים גופי לוי חלבון טאו. אולם אלפא-סינוקלאין והחלבון טאו מהווים קבוצות משנה שונות של פילמנטים (חוטונים) בתוך אותם גופי הסגר. ניתן למצוא פתולוגיה של אלפא-סינוקלאין גם במקרים ספורדיים ומשפחתיים של מחלת אלצהיימר.

מנגנון הצבירה של אלפא-סינוקלאין אינו ברור. קיימות הוכחות לצורת ביניים עתירת משטחי בטא היכולה לבשר את הצבירה ובסופו של דבר קודמן של גופי לוי. מחקר יחיד משנת 2008 רמז כי אלפא סינוקלאין קיים כתערובת באיזון של קונפורמר בלתי מובנים, של מבני סליל אלפא ועתירי משטח בטא. מוטציות או של בופר הידועים כמשפרים את הצבירה מגבירים בצורה ניכרת את כמות הקופנורמרים בטא. ממצא זה מצביע כי זו קונפורמציה הקשורה לצבירה פתולוגית. בין האסטרטגיות בטיפול הסינוקלאינופאתיות נשקל השימוש במעכבים של צבירת אלפא-סינוקלאין. הוכח למשל כי מולקולה קטנה של קומינאלדהיד מעכב פיברילציה של אלפא-סינוקלאין. במחלות אלה יש חשד במעורבות הנגיף אפשטיין בר.

במקרים נדירים של צורות משפחתיות של מחלת פרקינסון, קיימת מוטציה בגן המקודד את אלפא סינוקאלין. זוהו חמש מוטציות נקודתיות. דווח על השפעה של מוטציות מסוימות בשלבי ההתחלה וההגברה של תהליך הצבירה. דופליקציה וטריפליקציה של הגן נראות כסיבה נדירה של מחלת פרקינסון במשפחות אחרות, אך יותר שכיחה מהמוטציות הנקודתיות. מכאן ההשערה כי מוטציות מסוימות של אלפא סינוקלאין עלולות לגרום לפיברילים דמויי-אמילואיד התורמים להיווצרות מחלת פרקינסון.

ייתכן כי צורת פריונית של החלבון אלפא-סינוקלאין היא הסוכן הפתוגני של מחלת האטרופיה המערכתית הנפוצה.

ראו גם[עריכת קוד מקור | עריכה]

קישורים חיצוניים[עריכת קוד מקור | עריכה]

ויקישיתוף מדיה וקבצים בנושא אלפא-סינוקלאין בוויקישיתוף

Characterization of the human alpha-synuclein gene: Genomic structure, transcription start site, promoter region and polymorphisms

הערות שוליים[עריכת קוד מקור | עריכה]

  1. ^ 1 2 3 GRCh38: Ensembl גרסה 89: ENSG00000145335 - Ensembl, מאי 2017
  2. ^ 1 2 3 GRCm38: Ensembl גרסה 89: ENSMUSG00000025889 - Ensembl, מאי 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:".
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:".
  5. ^ קיימים גם סינוקאלין בטא וגאמא
  6. ^ על הגן SNCA באתר NIH והספרייה הלאומית לרפואה של ארצות הברית
  7. ^ Leonidas Stefanis, α-Synuclein in Parkinson’s Disease, Cold Spring Harbor – Perspectives in Medicine, ‏13 December 2011
  8. ^ Alice Filippini, Massimo Gennarelli, Isabella Russo, α-Synuclein and Glia in Parkinson’s Disease: A Beneficial or a Detrimental Duet for the Endo-Lysosomal System?, ResearchGate, ‏March 201

הבהרה: המידע בוויקיפדיה נועד להעשרה בלבד ואינו מהווה ייעוץ רפואי.