חנה מרגלית

מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית
חנה מרגלית
Margalit-pic-11-18.png
ענף מדעי ביואינפורמטיקה עריכת הנתון בוויקינתונים
מקום לימודים האוניברסיטה העברית בירושלים עריכת הנתון בוויקינתונים
מוסדות האוניברסיטה העברית בירושלים עריכת הנתון בוויקינתונים
מונחה לדוקטורט Esti Yeger-Lotem, Tommy Kaplan, Ariel Jaimovich, Naomi Habib עריכת הנתון בוויקינתונים
פרסים והוקרה
לעריכה בוויקינתונים שמשמש מקור לחלק מהמידע בתבנית OOjs UI icon info big.svg

חנה מרגלית היא פרופסור בפקולטה לרפואה באוניברסיטה העברית בירושלים.[1][2] מחקריה משלבים ביואינפורמטיקה, ביולוגיה חישובית וביולוגיה של מערכות, במיוחד בתחומי ויסות גנים בחיידקים ואאוקריוטים.

ביוגרפיה[עריכת קוד מקור | עריכה]

מרגלית קיבלה תואר ראשון במתמטיקה וביולוגיה בשנת 1974, ותואר שני בגנטיקה (בהצטיינות) בשנת 1977, מהאוניברסיטה העברית בירושלים.[1] בשנת 1985 סיימה את הדוקטורט שלה בביולוגיה מולקולרית חישובית בהנחיית נורמן גרובר, באוניברסיטה העברית בירושלים.

מרגלית השלימה פוסט-דוקטורט במכונים הלאומיים לבריאות (NIH) במעבדה לביולוגיה מתמטית בפיקוחו של צ'ארלס דליסי, שם פיתחה את האלגוריתם החישובי הראשון לחיזוי פפטידים אנטיגניים המוכרים על ידי תאי החיסון.[3] בשנת 1989 חזרה לישראל והקימה את קבוצת המחקר העצמאית שלה בפקולטה לרפואה, באוניברסיטה העברית בירושלים.

מחקריה המוקדמים כללו פיתוח אלגוריתמים חישוביים לחיזוי קשירת פפטידים אנטיגניים למולקולות MHC,[4] מודלים חישוביים של העדפות קשירת חלבון-DNA,[5] [6] גם בשיתוף פעולה עם ניר פרידמן,[7] זיהוי של זוגות דומיינים כאבני הבניין של רשתות אינטראקציה בין חלבון לחלבון, [8] ניתוח הרשת המשולבת של אינטראקציות בין חלבון לחלבון ובין חלבון ל-DNA[9] (בשיתוף פעולה עם אורי אלון), כמו גם מודלים חישוביים לחיזוי מולקולות RNA רגולטוריות קטנות בחיידקים,[10] אשר אומתו בניסויים בשיתוף פעולה עם שושי אלטוביה וגרהארט וגנר.

לאחרונה, המעבדה של מרגלית בחנה את הדינמיקה של ויסות על ידי RNAs קטן[11] (בשיתוף עופר ביהם), וחזתה בצורה חישובית שישנן מולקולות מיקרו-רנא נגיפיות המדכאות את מערכת החיסון האנושית, מנגנון שקיבל תוקף בניסוי שנערך בשיתוף עופר מנדלבוים. [12] מאז 2012 שילבה מרגלית מחקר ניסיוני וחישובי כדי לחקור וללמוד אינטראקציות קטנות של RNA עם חיידקים.[13]

מרגלית היא מחלוצי המחקר בביואינפורמטיקה וביולוגיה חישובית בישראל ובעולם. באוניברסיטה העברית היא הקימה את התוכנית "מדעי המחשב ומדעי החיים" בביואינפורמטיקה וביולוגיה חישובית (בשנת 1999) ואת תוכנית הבוגרים "גנומיקה וביואינפורמטיקה" (בשנת 2000). בשנת 2002 נבחרה לנשיאה הראשונה של האגודה הישראלית לביואינפורמטיקה וביולוגיה חישובית (2002–2004). הדריכה למעלה מ-50 סטודנטים לתארים מתקדמים, רבים מהם ממלאים תפקידים בפקולטה לביואינפורמטיקה בישראל ובחו"ל.[14]

פרסים והוקרה[עריכת קוד מקור | עריכה]

בשנת 2008 הוענק לה פרס לנדאו למדעים ולמחקר בביולוגיה של מערכות.[15]

בשנת 2018 נבחרה לעמיתה באגודה הבינלאומית לביולוגיה חישובית (ISCB) עבור תרומות יוצאות דופן לתחומי הביולוגיה החישובית והביואינפורמטיקה.[16]

בשנת 2020 זכתה בפרס רוטשילד בביולוגיה חישובית.[17] בהמשך אותה שנה זכתה בפרס למפעל חיים בחונכות במדע לשנת 2020 מטעם כתב העת המדעי Nature, בעקבות הישגיה בתחום ההדרכה המדעית.[18]

קישורים חיצוניים[עריכת קוד מקור | עריכה]

הערות שוליים[עריכת קוד מקור | עריכה]

  1. ^ 1 2 "Keynotes Details". www.iscb.org. בדיקה אחרונה ב-28 בנובמבר 2018. 
  2. ^ "Hanah Margalit's Lab". margalit.huji.ac.il. 
  3. ^ Margalit, H.; Spouge, J. L.; Cornette, J. L.; Cease, K. B.; Delisi, C.; Berzofsky, J. A. (1987). "Prediction of immunodominant helper T cell antigenic sites from the primary sequence". Journal of Immunology 138 (7): 2213–2229. ISSN 0022-1767. PMID 2435793. 
  4. ^ Altuvia, Y.; Schueler, O.; Margalit, H. (1995). "Ranking potential binding peptides to MHC molecules by a computational threading approach". Journal of Molecular Biology 249 (2): 244–250. ISSN 0022-2836. PMID 7540211. doi:10.1006/jmbi.1995.0293. 
  5. ^ Mandel-Gutfreund, Y.; Schueler, O.; Margalit, H. (1995). "Comprehensive analysis of hydrogen bonds in regulatory protein DNA-complexes: in search of common principles". Journal of Molecular Biology 253 (2): 370–382. ISSN 0022-2836. PMID 7563096. doi:10.1006/jmbi.1995.0559. 
  6. ^ Mandel-Gutfreund, Y.; Margalit, H. (1998). "Quantitative parameters for amino acid-base interaction: implications for prediction of protein-DNA binding sites". Nucleic Acids Research 26 (10): 2306–2312. ISSN 0305-1048. PMC 147552. PMID 9580679. doi:10.1093/nar/26.10.2306. 
  7. ^ Kaplan, Tommy; Friedman, Nir; Margalit, Hanah (2005). "Ab Initio Prediction of Transcription Factor Targets Using Structural Knowledge". PLoS Computational Biology (באנגלית) 1 (1): e1. Bibcode:2005PLSCB...1....1K. ISSN 1553-734X. PMC 1183507. PMID 16103898. doi:10.1371/journal.pcbi.0010001. 
  8. ^ Sprinzak, E.; Margalit, H. (24 באוגוסט 2001). "Correlated sequence-signatures as markers of protein-protein interaction". Journal of Molecular Biology 311 (4): 681–692. ISSN 0022-2836. PMID 11518523. doi:10.1006/jmbi.2001.4920. 
  9. ^ Yeger-Lotem, Esti; Sattath, Shmuel; Kashtan, Nadav; Itzkovitz, Shalev; Milo, Ron; Pinter, Ron Y.; Alon, Uri; Margalit, Hanah (2004). "Network motifs in integrated cellular networks of transcription-regulation and protein-protein interaction". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 101 (16): 5934–5939. Bibcode:2004PNAS..101.5934Y. ISSN 0027-8424. PMC 395901. PMID 15079056. doi:10.1073/pnas.0306752101. 
  10. ^ Argaman, L.; Hershberg, R.; Vogel, J.; Bejerano, G.; Wagner, E. G.; Margalit, H.; Altuvia, S. (26 ביוני 2001). "Novel small RNA-encoding genes in the intergenic regions of Escherichia coli". Current Biology 11 (12): 941–950. ISSN 0960-9822. PMID 11448770. doi:10.1016/s0960-9822(01)00270-6. 
  11. ^ Shimoni, Yishai; Friedlander, Gilgi; Hetzroni, Guy; Niv, Gali; Altuvia, Shoshy; Biham, Ofer; Margalit, Hanah (2007). "Regulation of gene expression by small non-coding RNAs: a quantitative view". Molecular Systems Biology 3: 138. ISSN 1744-4292. PMC 2013925. PMID 17893699. doi:10.1038/msb4100181. 
  12. ^ Stern-Ginossar, Noam; Elefant, Naama; Zimmermann, Albert; Wolf, Dana G.; Saleh, Nivin; Biton, Moshe; Horwitz, Elad; Prokocimer, Zafnat; Prichard, Mark (2007). "Host immune system gene targeting by a viral miRNA". Science 317 (5836): 376–381. Bibcode:2007Sci...317..376S. ISSN 1095-9203. PMC 4283197. PMID 17641203. doi:10.1126/science.1140956. 
  13. ^ Melamed, Sahar; Peer, Asaf; Faigenbaum-Romm, Raya; Gatt, Yair E.; Reiss, Niv; Bar, Amir; Altuvia, Yael; Argaman, Liron; Margalit, Hanah (2016). "Global Mapping of Small RNA-Target Interactions in Bacteria". Molecular Cell 63 (5): 884–897. ISSN 1097-4164. PMC 5145812. PMID 27588604. doi:10.1016/j.molcel.2016.07.026. 
  14. ^ "Hanah Margalit's Lab". margalit.huji.ac.il (באנגלית). בדיקה אחרונה ב-28 בנובמבר 2018. 
  15. ^ "קרן לנדאו - פרס למדעים ומחקר" (בעברית). 17 ביוני 2012. אורכב מ-המקור ב-2012-06-17. בדיקה אחרונה ב-28 בנובמבר 2018. 
  16. ^ Anon (2018). "ISCB Fellows". iscb.org. International Society for Computational Biology. אורכב מ-המקור ב-2015-04-15. בדיקה אחרונה ב-13 במרץ 2018. 
  17. ^ "The Rothschild Prize". The Rothschild Prize. בדיקה אחרונה ב-7 במרץ 2020. 
  18. ^ ערוץ 7, פרופ' מרגלית עוסקת במחקר שמשלב ביואינפורמטיקה, ביולוגיה חישובית וחקר מערכות ביולוגיות., באתר ערוץ 7, 22 בדצמבר 2020