איקריוטים – הבדלי גרסאות

מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
YoavRamon (שיחה | תרומות)
YoavRamon (שיחה | תרומות)
שורה 67: שורה 67:


==== החלוקה ה[[פילוגנטיקה|פילוגנטית]] המודרנית ====
==== החלוקה ה[[פילוגנטיקה|פילוגנטית]] המודרנית ====
בהתבסס על מספר עבודות מ2012-1016 <ref name="burki2014">{{cite journal|url=http://cshperspectives.cshlp.org/content/6/5/a016147.full|title=The eukaryotic tree of life from a global phylogenomic perspective|date=May 2014|journal=Cold Spring Harbor Perspectives in Biology|issue=5|doi=10.1101/cshperspect.a016147|volume=6|pages=a016147|pmc=3996474|pmid=24789819|vauthors=Burki F}}</ref><ref>{{cite journal|url=http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/283/1823/20152802|title=Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista|date=January 2016|journal=Proceedings: Biological Sciences|issue=1823|doi=10.1098/rspb.2015.2802|volume=283|pages=20152802|pmc=4795036|pmid=26817772|vauthors=Burki F, Kaplan M, Tikhonenkov DV, Zlatogursky V, Minh BQ, Radaykina LV, Smirnov A, Mylnikov AP, Keeling PJ}}</ref><ref>{{cite journal|url=http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S096098221731388X|title=A New Lineage of Eukaryotes Illuminates Early Mitochondrial Genome Reduction|date=December 2017|journal=Current Biology|issue=23|doi=10.1016/j.cub.2017.10.051|volume=27|pages=3717–3724.e5|pmid=29174886|vauthors=Janouškovec J, Tikhonenkov DV, Burki F, Howe AT, Rohwer FL, Mylnikov AP, Keeling PJ}}</ref><ref>{{cite journal|title=Did some red alga-derived plastids evolve via kleptoplastidy? A hypothesis|date=February 2018|journal=Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society|issue=1|doi=10.1111/brv.12340|volume=93|pages=201–222|pmid=28544184|vauthors=Bodył A}}</ref> נעשו נסיונות למקם את הקבוצות הקטנות בתוך קבוצת האם וגם למפות את הקשרים בין קבוצות האם השונות. כיום, למעט מספר שינויים נהוג לחלק את ה[[קלייד]] של האיקריוטים לארבעה ענפים עיקריים (על-קבוצת [[Archaeplastida]], [[על-קבוצת TSAR]], על-קבוצת [[Discoba]] ועל-קבוצת [[Amorphea]]) המכילים את רוב הקבוצות הידועות לנו כיום. ישנן כמה קבוצות שמיקומן בתוך ענפים אלו עוד נתון למחלוקת (בעיקר ה[[Haptista]] וה-[[Cryptista]] שלא ברור לגמרי אם הן שייכות לעל-קבוצת Archaeplastida וקרובות לצמחים או שלמעשה הן קרובות יותר לעל-קבוצת TSAR וגם המיקום של ה-Discoba כענף נפרד ומפוצל מהקבוצות האחרות). חלוקה זאת, שהיום היא הקונצנזוס המדעי, מוצגת באיור זה:
בהתבסס על מספר עבודות מ2012-1016 <ref name="burki2014">{{cite journal|url=http://cshperspectives.cshlp.org/content/6/5/a016147.full|title=The eukaryotic tree of life from a global phylogenomic perspective|date=May 2014|journal=Cold Spring Harbor Perspectives in Biology|issue=5|doi=10.1101/cshperspect.a016147|volume=6|pages=a016147|pmc=3996474|pmid=24789819|vauthors=Burki F}}</ref><ref>{{cite journal|url=http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/283/1823/20152802|title=Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista|date=January 2016|journal=Proceedings: Biological Sciences|issue=1823|doi=10.1098/rspb.2015.2802|volume=283|pages=20152802|pmc=4795036|pmid=26817772|vauthors=Burki F, Kaplan M, Tikhonenkov DV, Zlatogursky V, Minh BQ, Radaykina LV, Smirnov A, Mylnikov AP, Keeling PJ}}</ref><ref>{{cite journal|url=http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S096098221731388X|title=A New Lineage of Eukaryotes Illuminates Early Mitochondrial Genome Reduction|date=December 2017|journal=Current Biology|issue=23|doi=10.1016/j.cub.2017.10.051|volume=27|pages=3717–3724.e5|pmid=29174886|vauthors=Janouškovec J, Tikhonenkov DV, Burki F, Howe AT, Rohwer FL, Mylnikov AP, Keeling PJ}}</ref><ref>{{cite journal|title=Did some red alga-derived plastids evolve via kleptoplastidy? A hypothesis|date=February 2018|journal=Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society|issue=1|doi=10.1111/brv.12340|volume=93|pages=201–222|pmid=28544184|vauthors=Bodył A}}</ref> נעשו נסיונות למקם את הקבוצות הקטנות בתוך קבוצת האם וגם למפות את הקשרים בין קבוצות האם השונות. כיום, למעט מספר שינויים נהוג לחלק את ה[[קלייד]] של האיקריוטים לארבעה ענפים עיקריים (על-קבוצת [[Archaeplastida]], [[על-קבוצת TSAR]], על-קבוצת [[Discoba]] ועל-קבוצת [[Amorphea]]) המכילים את רוב הקבוצות הידועות לנו כיום. ישנן כמה קבוצות שמיקומן בתוך ענפים אלו עוד נתון למחלוקת (בעיקר ה[[Haptista]] וה-[[Cryptista]] שלא ברור לגמרי אם הן שייכות לעל-קבוצת Archaeplastida וקרובות לצמחים או שלמעשה הן קרובות יותר לעל-קבוצת TSAR וגם המיקום של ה-Discoba כענף נפרד ומפוצל מהקבוצות האחרות).

באיור זה מוצגת חלוקה זאת (המקובלת פחות או יותר כקונצנזוס מדעי מלבד ההסתייגויות הכתובות מעלה), כשבסוגריים כתובות הקבוצות הבולטות בכל ענף:


{{קלייד|{{קלייד
{{קלייד|{{קלייד
שורה 77: שורה 79:
| 1={{קלייד
| 1={{קלייד


| 1=[[אדומיות]] (Rhodophyta) [[File:Bangia.jpg|40 px]]
| 1=[[אדומיות]] ''Rhodophyta'' [[File:Bangia.jpg|40 px]]
| 2=[[picozoa]]
| 2=[[picozoa]]
}}
}}
שורה 83: שורה 85:
|1={{קלייד
|1={{קלייד
| 1=[[Glaucophyte]] [[File:Glaucocystis sp.jpg|60 px]]
| 1=[[Glaucophyte]] [[File:Glaucocystis sp.jpg|60 px]]
| תווית2=[[ממלכת הצומח]] (Viridiplantae)
| תווית2=[[ממלכת הצומח]] ''Viridiplantae''
| 2={{קלייד
| 2={{קלייד
|1=[[ירוקיות]] (Chlorophyta) [[File:Pediastrum (cropped).jpg|60 px]]
|1=[[ירוקיות]] ''Chlorophyta'' [[File:Pediastrum (cropped).jpg|60 px]]
|2=[[סטרפטופיטיים]] (Streptophyta) [[File:Cyperus_papyrus-pjt2.jpg|60 px]]
|2=[[סטרפטופיטיים]] ''Streptophyta'' [[File:Cyperus_papyrus-pjt2.jpg|60 px]]
}}
}}
}}
}}

גרסה מ־10:36, 11 באוקטובר 2018

קריאת טבלת מיוןאיקריוטים
מיון מדעי
על־ממלכה: איקריוטים
שם מדעי
Eukaryota
שטון, 1925

אֵיקַרְיוֹטִים (שם מדעי: Eukaryota, Eukarya, Eucarya; "בעלי גרעין") הם יצורים תאיים בעלי גרעין ואברונים, המהווים את העל-ממלכה המגוונת ביותר במיון עולם הטבע. הם כוללים חד-תאיים כמו פרוטוזואה, ריריות, אצות ופטריות חד-תאיות, וכן את הממלכות של הרב-תאיים: פטריות, צומח ובעלי חיים. שתי העל-ממלכות האחרות - חיידקים וארכאונים - כוללות את היצורים הפרוקריוטים.

תא איקריוטי מתאפיין בכך שקיימים אצלו גרעין התא והאברונים המתמחים, המופרדים מהציטופלזמה על ידי ממברנה ביולוגית, שלא כמו בפרוקריוטים, חסרי הגרעין והאברונים (פרו - לפני, קריוט - גרעין; "לפני הופעת הגרעין").

מבנה התא האיקריוטי

תאים איקריוטיים לרוב גדולים יותר מתאים פרוקריוטיים. המחשה לכך ניתן למצוא בהשוואה בין מסת התאים המרכיבים את גוף האדם, לבין מסת החיידקים השוכנים בו באופן תמידי. אף שמספר החיידקים ומספר תאי האדם הם בעלי אותו סדר גודל (), מסת החיידקים בגוף מסתכמת בכ-200 גרם בלבד[1]; הדבר מתאפשר בזכות ההבדל העצום בין גודלם של תאי הגוף (האיקריוטיים) וזה של החיידקים (הפרוקריוטיים).

תאים איקריוטיים מכילים מבנים שונים שניתן לכנותם באופן כללי בשם "אברונים". במרכז התא נמצא גרעין המוקף ממברנה כפולה ובה מעברים מיוחדים למעבר חומרים חיוניים. בתוך הגרעין נמצא החומר התורשתי של התא (ה-DNA) המאוחסן בכרומוזומים; משם מנוהלות פעילויות התא. כל מה שנמצא מחוץ לגרעין נקרא "ציטופלזמה". הציטופלזמה היא נוזל צמיג בו נמצאים כל שאר אברוני התא ובו מתבצע חלק מחילוף החומרים של התא. יציבות מבנה התא נשמרת על ידי שלד התא.

המיון המדעי של האיקריוטים

השוואה בין תא פרוקריוטי לתא איקריוטי
עיננית (שייכת לDiscoba)
אצות סרגסום (השייכות לחומיות, שנמצאות בעל קבוצה Stramenopiles)
Fuligo septica על בול עץ (שייכות לריריות, שנמצאות בעל-קבוצה של הAmoebozoa)
Armillaria ostoyae (פטריה השייכת לעל-קבוצה Holomycota)
סרטן סלעים אדום (בעל-חיים השייך לHoloza)
אירוס (צמח בעל-פרחים השייך לסטרפטופיטיים)

קארולוס ליניאוס חילק בחלוקתו המקורית את עולם הטבע לשתי ממלכות: בעלי החיים והצמחים. כאשר התחילו לגלות במאה ה-19 את החידקים החד-תאיים השונים הזיזו אותם פעמים רבות בין הצמחים לבין בעלי החיים עד שב1866 ארנסט הקל הציב אותם בממלכה משלהם. בהמשך במאה ה-20 זכו גם הפטריות להיות ממלכת משלהם ויצרו בעצם את ארבעת הממלכות המוכרות קיום:

מחקרים גנטיים מודרניים משנות ה-90 ומתחילת מהמאה ה-21 מראים שהחלוקה הקלאסית אינה תואמת בצורה טובה את המציאות הגנטית ואת הקרבה ההתפתחותית בין הקבוצות השונות. ב2005-2012 הוצאו מספר חלוקת[2] [3] שבסופן התקבעו חמש קבוצות עיקריות:

Archaeplastida צמחי היבשה, אצות ירוקיות, אצות, אדומיות וה-glaucophytes
על-קבוצת SAR Stramenopiles (חומיות, צורניות, וכו') Alveolata (ריסניות, רדיולרות, ועוד דמויי-אמבות) ו-Rhizaria (המכילה את החוריריות)
Excavata (שקולה לDiscoba) קבוצה האיחדה תת-קבוצות רבות ושונות של חד תאיים.
Amoebozoa המכילה את הריריות והאמבות
Opisthokonta בעיקר בעלי החיים, והפטריות

גם בחלוקה זאת היו בעיות רבות ובעיקר זה שהיא לא כללה כמה קבוצות קטנות יחסית (כמו Telonemia או Picozoa ואפילו הסוג הבודד Collodictyon). ובכך שהיא לא הראתה את הקשרים ההתפתחותיים בין כל הקבוצות הנ"ל.

החלוקה הפילוגנטית המודרנית

בהתבסס על מספר עבודות מ2012-1016 [4][5][6][7] נעשו נסיונות למקם את הקבוצות הקטנות בתוך קבוצת האם וגם למפות את הקשרים בין קבוצות האם השונות. כיום, למעט מספר שינויים נהוג לחלק את הקלייד של האיקריוטים לארבעה ענפים עיקריים (על-קבוצת Archaeplastida, על-קבוצת TSAR, על-קבוצת Discoba ועל-קבוצת Amorphea) המכילים את רוב הקבוצות הידועות לנו כיום. ישנן כמה קבוצות שמיקומן בתוך ענפים אלו עוד נתון למחלוקת (בעיקר הHaptista וה-Cryptista שלא ברור לגמרי אם הן שייכות לעל-קבוצת Archaeplastida וקרובות לצמחים או שלמעשה הן קרובות יותר לעל-קבוצת TSAR וגם המיקום של ה-Discoba כענף נפרד ומפוצל מהקבוצות האחרות).

באיור זה מוצגת חלוקה זאת (המקובלת פחות או יותר כקונצנזוס מדעי מלבד ההסתייגויות הכתובות מעלה), כשבסוגריים כתובות הקבוצות הבולטות בכל ענף:


איקריוטים
Diaphoretickes
Archaeplastida


אדומיות Rhodophyta



picozoa






Glaucophyte


ממלכת הצומח Viridiplantae

ירוקיות Chlorophyta



סטרפטופיטיים Streptophyta





Cryptista







Haptista (כוללת את הקוקוליתופורידים)



הסוג Ancoracysta



על-קבוצת TSAR

Telonemia


על-קבוצת SAR
Halvaria

Stramenopiles (כוללת את החומיות והדיאטומאות)



Alveolata (כוללת את הריסניות והנבגוניות)




Rhizaria (כוללת את החוריריות)







Discoba (כוללת את העינניות)


Amorphea

Amoebozoa (כוללת את האמבות והריריות)




הסדרה Apusomonadida


Opisthokonta

Holomycota (כוללת את הפטריות)



Holozoa (כוללת את בעלי חיים)







ראו גם

קישורים חיצוניים

ויקישיתוף מדיה וקבצים בנושא איקריוטים בוויקישיתוף

הערות שוליים

  1. ^ Ron Sender, Shai Fuchs, Ron Milo. "Revised Estimates for the Number of Human and Bacteria Cells in the Body". PLOS. August 19, 2016
  2. ^ Adl SM, Simpson AG, Farmer MA, Andersen RA, Anderson OR, Barta JR, et al. (2005). "The new higher level classification of eukaryotes with emphasis on the taxonomy of protists". The Journal of Eukaryotic Microbiology. 52 (5): 399–451. doi:10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x. PMID 16248873.
  3. ^ Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, et al., The revised classification of eukaryotes, The Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429–93, 2012
  4. ^ Burki F (במאי 2014). "The eukaryotic tree of life from a global phylogenomic perspective". Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 6 (5): a016147. doi:10.1101/cshperspect.a016147. PMC 3996474. PMID 24789819. {{cite journal}}: (עזרה)
  5. ^ Burki F, Kaplan M, Tikhonenkov DV, Zlatogursky V, Minh BQ, Radaykina LV, Smirnov A, Mylnikov AP, Keeling PJ (בינואר 2016). "Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista". Proceedings: Biological Sciences. 283 (1823): 20152802. doi:10.1098/rspb.2015.2802. PMC 4795036. PMID 26817772. {{cite journal}}: (עזרה)
  6. ^ Janouškovec J, Tikhonenkov DV, Burki F, Howe AT, Rohwer FL, Mylnikov AP, Keeling PJ (בדצמבר 2017). "A New Lineage of Eukaryotes Illuminates Early Mitochondrial Genome Reduction". Current Biology. 27 (23): 3717–3724.e5. doi:10.1016/j.cub.2017.10.051. PMID 29174886. {{cite journal}}: (עזרה)
  7. ^ Bodył A (בפברואר 2018). "Did some red alga-derived plastids evolve via kleptoplastidy? A hypothesis". Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society. 93 (1): 201–222. doi:10.1111/brv.12340. PMID 28544184. {{cite journal}}: (עזרה)