RNA פולימראז II

מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית
קפיצה אל: ניווט, חיפוש
RNA פולימראז II בשמר האפייה בקומפלקס עם אלפא אמניטין (באדום). המגנזיום באתר הפעיל מסומן בוורוד. העיגולים האפורים הם יוני אבץ.

RNA פולימראז II הוא אנזים הנמצא בתאים אאוקריוטים. הוא מזרז שעתוק של DNA לmRNA, snRNA ו-microRNA ראשוניים. קומפלקס בגודל 550 kDa המורכב מ-12 תת-יחידות, כאשר RNA פולימראז II הוא הנחקר ביותר. מספר רב של פקטורי שעתוק דרוש לקישור לפרומוטורים ולתחילת השעתוק.

תת-יחידות[עריכת קוד מקור | עריכה]

  • RPB1 - היחידה הגדולה ביותר של האנזים. בבנ"א מקודד על ידי הגן POLR2A. הוא חיוני לתפקודו של הפולימראז. יחד עם יחידות פולימראז נוספות, הוא יוצר את האזור קושר ה-DNA של הפולימראז, חריץ שבו ה-DNA משועתק לרנ"א, עם RPB8.
  • RPB2 - היחידה השנייה בגודלה שבשיתוף עם שתי יחידות פולימראז אחרות יוצרת מבנה בתוך הפולימראז השומר על הקשר בין ה-DNA לבין ה-RNA המסונתז באתר הפעיל של האנזים
  • RPB3 - תת-היחידה השלישית בגודלה. מתקיימת כהטרודימר עם יחידת פולימראז נוספת. באינטראקציה עם RPB1-5,7,10-12.
  • RPB4 - מקודד על ידי POLR2D. תת-היחידה הרביעית בגודלה וייתכן ויש לה תפקיד בהגנה מפני עקה.
  • RPB5 - בבנ"א מקודד על ידי POLR2E. שתי מולקולות של תת-היחידה נמצאות בכל RNA פולימראז II. נמצא באינטראקציה עם RPB1,3,6.
  • RPB6 - יוצר מבנה עם לפחות שתי תת-יחידות נוספות שמייצב את הפולימראז על ה-DNA.
  • RPB7 - מקודד על ידי POLR2G וייתכן ויש לו תפקיד בבקרה על פעילות הפולימראז
  • RPB8 - נמצא באינטראקציה עם תת-יחידות RPB1-3,5,7.
  • RPB9 - החריץ שבו ה-DNA משועתק ל-RNA בנוי מ-RPB9 ו-RPB1.
  • RPB10 - תוצר של הגן POLR2L. באינטראקציה עם RPB1-3, 5 ו-RPB3.
  • RPB11 - בנוי משלוש תת-יחידות בבנ"א.
  • RPB12 - מגיב עם RPB3.

CTD[עריכת קוד מקור | עריכה]

ב-RNA פולימראז נמצא מתחם קצה-C ‏(C-terminal domain; CTD) - חלק זה אחראי על תחילת השעתוק, על תהליך ה-capping בקצה ה-5' וקישור של ספלייסוזום עבור שחבור. הרצף מורכב לרוב מעד 52 רצפים חוזרים של חומצות האמינו Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser. ה-CTD הוא נקודת השקה בין מערכת השעתוק למערכת עיבוד ה-RNA - כאשר הודות למודיפקיציות זרחון שונות שלו מסוגלים להיקשר אליו פקטורים שונים המעורבים בתהליכי עיבוד RNA.