Deeper Well הופק ונכתב במשותף על ידי מאסגרייבס, עם דניאל טשיאן ואיאן פיצ'וק, למעט הרצועה "The Architect", אשר נוצרה עם שיין מקנאלי וג'וש אוסבורן.[2] מאסגרייבס הקליטה את האלבום באולפני Electric Lady בניו יורק, שלדעתה "יש לו את המוג'ו הטוב ביותר" בזמן שהיא "חיפשה אנרגיה סביבתית שונה".[3] האלבום משקף את השינויים וסדרי העדיפויות שהתרחשו בחייה לאחר גיל 27, שדורבן על ידי "הקוסמוס כשובו של שבתאי".[4] מאסגרייבס חשפה לראשונה את הפרויקט ב-4 בפברואר, במהלך פרסומת שנתית בטקס פרסי גראמי ה-66 בשם "שבתאי שלי חזר".[5] הסינגל המוביל בעל אותו השם יצא לאור לצד הכרזת האלבום ב-8 בפברואר 2024.[6] ההשראה לשיר הגיעה דרך שינוי ברגשות וברגשות שאולי מרתיע בהתחלה אבל מצייד אדם ב"תובנה חדשה ואהבה עמוקה יותר במקום אחר".[7]