משתמש:איתי5151/בוני ברגר
בוני אן ברגר (באנגלית: Bonnie Anne Berger; נולדה ב-1 בנובמבר 1961), היא מדענית מחשב ומתמטיקאית אמריקנית. ברגר היא פרופסור למתמטיקה במכון הטכנולוגי של מסצ'וסטס (MIT), בה היא בעלת מינוי משותף במדעי המחשב והנדסת חשמל. תחומי העבודה שלה עוסקים בעיצוב אלגוריתמים למטרת פענוח מידע ביולוגי ולהשגת תובנות ביולוגיות מכמויות מידע עצומות[1]. ברגר עובדת כראש קבוצת מחשוב וביולוגיה במעבדת מדעי המחשב והבינה המלאכותית של MIT. בנוסף לכך, היא חברת מועצה במדור המתמטיקה באגודה האמריקאית לקידום המדע (AAAS). ברגר השתתפה בכתיבה של למעלה מ-140 מאמרי מחקר מדעיים[2], תרמה רבות לתחומי הביו רפואה, הגנומיקה והביולוגיה החישובית, באמצעות חידושים אלגוריתמים. ברגר נבחרה לכהן בתפקידים רבים בעקבות בקיאותה בתחום, ועל הישגיה זכתה בפרסים רבים.
השכלה[עריכת קוד מקור | עריכה]
ברגר החלה את לימודיה האקדמיים באוניברסיטת ברנדייס, שם קיבלה את התואר הראשון שלה במדעי המחשב ב-1983[2]. לאחר מכן עברה ללמוד ב-MIT, שם קיבלה את התואר השני שלה במדעי המחשב ב-1986. ברגר המשיכה את לימודיה ב-MIT וב-1990 קיבלה את הדוקטורט שלה במדעי המחשב. תחת הנחייתו של סילביו מיכאלי סיימה פוסט דוקטורט במתמטיקה שימושית ב- 1992. ברגר זכתה במספר פרסים לאורך לימודיה.
קורות חיים[עריכת קוד מקור | עריכה]
ברגר נולדה ב- 1961 וגדלה במיאמי, פלורידה עם הוריה ואחיה הגדול. ברגר גילתה חיבה למתמטיקה עוד מילדותה ואהבה לפתור עם אביה בעיות מתמטיות, חידות שחמט ופאזלים[3]. 13 שנים לאחר שסיימה את התיכון, ברגר הייתה אחת הדמויות המובילות במתמטיקה שימושית. במהלך לימודיה ב-MIT ברגר התחתנה עם פרופסור למתמטיקה שימושית, פרנק ט. לייטון. לזוג שני ילדים, אלכס ורייצ'ל. תחומי העניין של ברגר מחוץ לעבודה הם ילדיה, טניס ושחייה. כיום היא מתגוררת עם משפחתה בניוטון, מסצ'וסטס.
פעילות מחקרית[עריכת קוד מקור | עריכה]
המחקר של ברגר עוסק בעיקרו בתחום הגנומיקה (תחום בגנטיקה החוקר את הגנומים בגוף חי) וביישומים של טכניקות מתמטיות לבעיות בביולוגיה מולקולרית. הבעיות שברגר חוקרת קשורות בעיקרן לניתוח נתונים בביולוגיה וגנומיקה[1]. מחקריה פורסמו בכתבי עת מדעיים ידועים, כגון סיינס [4](Science).
בין השנים 2012 - 2018 ברגר הייתה חברה בקבוצה שחקרה גנומיקה חישובית. המחקרים עסקו בפיתוח פרוטוקול לניתוח גנום בקנה מידה גדול תוך שמירת הסודיות של גנוטיפים ופנוטיפים. הוכח שהפרוטוקול יכול לנתח מידע מיותר ממליון איש תוך זמן קצר. השיטה מאפשרת לאנשים לתרום את הגנום שלהם למחקר מבלי להתפשר על הפרטיות[2].
בין השנים 2013 - 2015 ברגר פרסמה מספר מאמרים בנושא גנטיקה של אוכלוסיות. המחקרים עוסקים בפיתוחים סטטיסטים ואלגוריתמים בכדי לשפר את הכוח והמהירות של מבחני אסוציאציה. בכדי להדגים את השיפור, קבוצת המחקר ניתחה נתונים בגנום רחב שנדגם מ -56 אוכלוסיות. המחקר הראה כי כל קבוצות דרום מזרח אסיה שנבדקו, קשורות קשר הדוק יותר לאבוריג'ינים, יותר מאשר לכל אוכלוסייה מרכזית כיום, ובכך סייעו לפתור שאלה שנויה במחלוקת, במוצאם של אנשי דרום מזרח אסיה[2].
בין השנים 2018 - 2021 פרסמה ברגר מאמרים הקשורים לגנומיקה של תא בודד. המאמרים עסקו בפיתוח אלגוריתמים העובדים על למידת מכונה עבור הדמיה ופיתוח גאומטרי של רצפי RNA. העבודה זכתה להתעניינות רבה[2].
תפקידים ועמדות[עריכת קוד מקור | עריכה]
1990- 1992 מלגת מחקר לפוסט דוקטורט במתמטיקה שימושית מ-NSF.
1992 - 1993 מכון רדקליף באנטינג, חוקרת מדע.
1992 - חברה במדעי המחשב ומעבדת הבינה המלאכותית (CSail), MIT.
1992 - 1997 עוזרת פרופסור למתמטיקה יישומית, MIT.
1997- 1999 פרופסור חבר למתמטיקה יישומית, MIT.
1999- 2002 פרופסור חבר למתמטיקה יישומית, קבועה, MIT.
2002 - פרופסור למתמטיקה יישומית, MIT.
2004 - 2012 פקולטה משותפת, הרווארד - MIT מדעי בריאות וטכנולוגיה (HST).
2004 - פקולטה משולבת, ביולוגיה חישובית ומערכות (CSBI) ב- MIT.
2008 - ועד המשגיחים של בת' ישראל והוועדה המייעצת הרפואית.
2010 - מינוי משותף, מחלקת הנדסת חשמל ומדעי מחשב, MIT.
2010 - חבר עמית, המכון הרחב של MIT והרווארד.
2012 - סגל מתקשר, בית הספר לרפואה של הרווארד.
2014 - חבר סגל, הרווארד-MIT מדעי בריאות וטכנולוגיה.
2015 - חבר, המרכז עבור Informatics microbiome וטיפול.
2016 - סימונס פרופסור למתמטיקה, MIT.
2018 - 2019 ראש ביניים של מתמטיקה יישומית, MIT.
פרסים והוקרות[עריכת קוד מקור | עריכה]
1990 - תזת הדוקטורט זכתה לפרס ג'ורג' ספרוול על המחקר הטוב ביותר במדעי המחשב.
1995 - 1998 פרס קריירה מהקרן הלאומית למדע (NSF).
1999 - פרס דיווף של החברה הביופיזית למחקר (פרס אחד בשנה).
1999 - פרס טכנולוג'י רוויו (Technology Review) עבור 100 חדשנים צעירים למאה ה -21.
2004 - נבחרה כחברת האגודה למכונות מחשוב (ACM).
2010 - פרס מבחן הזמן עבור "קיפול חלבון במודל HP הוא NP מלא" מ-"RECOMB".
2012 - פרס מרגרט פיטמן מהמכון הלאומי לרפואה (NIH) עבור הישגים מדעיים מצטיינים & מרצות.
2012 - נבחרה כעמיתת החברה הבינלאומית לביולוגיה חישובית (ISCB).
2013 - נבחרה לאקדמיה האמריקאית לאמנות ולמדעים.
2013 - פרס אוניברסיטת ברנדייס לבוגרים הישגים.
2015 - דוקטורט כבוד מ-EPFL.
2016 - נבחרה למכון האמריקאי להנדסה רפואית וביולוגית (AIMBE).
2019 - פרס מבחן הזמן על פיתוח אלגוריתם Isorank מ-"RECOMB".
2019 - נבחרה כעמית של החברה המתמטית האמריקאית (AMS).
2019 - פרס מדען בכיר מ-ISCB (פרס 1 בשנה מ-2003).
2020 - פרס סוניה קובלבסקי מ-AWS/SIAM. 2020 נבחרה כחברה באקדמיה הלאומית למדעים (NAS)
הערות שוליים:[עריכת קוד מקור | עריכה]
- ^ 1 2 Bonnie Berger, Bonnie A. Berger ’83 (עמ' 1), Board of Trustees, April 2018 (באנגלית)
- ^ 1 2 3 4 5 Bonnie Berger, Biographical Information, Professor Bonnie Berger, 2021
- ^ Christiana N Fogg, Ron Shamir, Diane E Kovats, Bonnie Berger named ISCB 2019 ISCB Accomplishments by a Senior Scientist Award recipient, ISBC, 10 June 2019
- ^ THE MODENCODE CONSORTIUM, SUSHMITA ROY, Bonnie Berger, Identification of Functional Elements and Regulatory Circuits by Drosophila modENCODE, Science