אתר קישור

בביוכימיה אתר קישור הוא אזור בחלבון, RNA, או DNA שאליו נקשרות מולקולות או יונים ספציפיים אשר מכונים ליגנד. הליגנדים נקשרים לרוב בקישור לא קוולנטי, קישור חלש יחסית, אשר מאפשר להם היקשרות ושחרור.

מספר מודלים הוצעו לקישור בין אנזים וליגנד:

• מודל התאמה מושרית: לפי מודל זה, לאחר הקישור בין הסובסטרט לאנזים מתרחש שינוי קונפורמציה מקומי באתר הקישור באנזים אשר גורם להתאמה מבנית בין אתר הקישור לסובסטרט.
• מודל מנעול מפתח, אשר טוען כי האתר הקושר והסובסטרט התאימו אחד לשני עוד לפני התחברות הסובסטרט.

מודל ההתאמה המושרית הוא המודל המקובל היום.

מספר האתרים הקשורים מתוך סך האתרים בזמן נתון נקראים רוויה או סטורציה.

כאשר לאתר קישור ישנה זיקה ליותר מליגנד אחד עשויה להתרחש תחרות על מקום באתר הקישור, יש ספציפיות כימית לליגנדים אשר יקשרו באתר הקשירה וישנה זיקה (אפיניות) לכל ליגנד שמבטאת את החוזק של הקישור.

קיים מצב של שיווי משקל בין מספר האתרים הקשורים והלא קשורים לליגנד.

סוג נוסף של אתר קישור ספציפי הוא גורם שעתוק שנמצא ב-DNA. גורם שעתוק הוא חלבון הנקשר לרצף DNA ספציפי, הנמצא לפני החלק המקודד של הגן, ובכך משפיע על שעתוק הגן ל-mRNA. ביחד עם פרומוטורים להליקאז, גורמי שעתוק הם הבסיס לרשת הוויסות והבקרה הגנטית.