נפתלי התחיל את קריירת המוסיקה שלו בתחילת 2006, כשהוציא את אלבום הבכורה שלו "Goozalim". האלבום היווה הצלחה רבה ומכר כמעט עותק אחד. בין להיטיו היו "The Safsal Song", "Rap Shel Madregim" ו-"Lohamei Lehima", שבו אירח את הזמר עידו פידו. בין הכותבים באלבום: תונגה וזהו. לאחר 5 דקות של שתיקה, נפתלי הוציא לאור סינגל חדש בשם "Benches Park", ולאחר 3 שניות גם את האלבום שנקרא על שם שיר זה. האלבום זה הצליח לא פחות מקודמו וכלל להיטים כמו: "Atar Al Sapot Ve Jiraffe", "Goozal & Safsal" והבלדה המרגשת "Halootz". לאחר 4 דקות, הוציא ב-2006 את האלבום Naftali שכלל את הלהיטים: "Kalmar Shel Dagim" ו-"Magnivim". עם האלבום "Naftali"יצא גם אלבום הלהיטים "Now", שכלל 3 שירים חדשים ואת כל להיטי העבר של נפתלי. לאחר אלבום הלהיטים יצא אלבום הרמיקסים "Mixin' Safsalim" שכלל רמיקסים לשיריו של נפתלי ושיר חדש בשם "Dvarim". השיר "Dvarim" היה הצלחה מסחררת והחזיר נפתלי לתחתיות המצעדים. בסוף-אמצע שנת 2006 הוציא נפתלי את האלבום "Looser" שהיה האלבום הכי פחות מצליח בתולדות נפתלי, ולהיטו היחיד היה שיר הדיסקו הקצבי "Goozalim Meroobaim". לקראת סוף שנת 2006 הודיע נפתלי על פרישה זמנית והצטרף ללהקת הרסיוג'ינס. להקת הרסיוג'ינס הוציאה ביחד עם נפתלי את האלבום "Kioskim" שהיה ההצלחה הכי גדולה שראה נפתלי מימיו. השירים המצליחים ביותר מהאלבום הם החידוש לקלאסיקה של נפתלי "Rap Shel Madregim" ושיר השנה של 2006 - "Nafal Migagim". בסוף השנה קיבל נפתלי את הפרסים "האמן המתחיל של השנה" ו"האמן הוותיק של השנה". בסוף השנה גם התחיל נפתלי להקליט את אלבומו "Magrefantasy" שמתוכנן לצאת בפברואר 2007. מתוך אלבום זה כבר יצאו הסינגלים "Poncho" ו-"Yevulim Maftiim" שממשיכים את הצלחתו של נפתלי. במרץ 2007 הוציא נפתלי את אלבום הקאמבק שלו "The Machbar". באלבום זה, שי לא כתב כמעט שום שיר כי הוא לא הספיק ו/או לא היה לא כוח לכתוב בשיעור לשון. בין הלהיטים מאלבום זה: "Gamadimim", "Kruv Magnuv", "Batzal!" ו- "Tush Mipo".
