תבנית:עונת 1999 בליגת העל הרוסית/טבלת הליגה
| # | קבוצה | מש' | נצ' | תיקו | הפ' | ה"ש | יחס | נק' | הערות |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | ספרטק מוסקבה | 30 | 22 | 6 | 2 | 75 - 24 | +51 | 72 | שלב הבתים של ליגת האלופות |
| 2 | לוקומוטיב מוסקבה | 30 | 20 | 5 | 5 | 60 - 32 | +32 | 65 | שלב המוקדמות השלישי בליגת האלופות |
| 3 | צסק"א מוסקבה | 30 | 15 | 10 | 5 | 56 - 29 | +27 | 55 | שלב המוקדמות הראשון בגביע אופ"א |
| 4 | טורפדו מוסקבה | 30 | 13 | 11 | 6 | 38 - 33 | +5 | 50 | שלב המוקדמות הראשון בגביע אופ"א |
| 5 | דינמו מוסקבה | 30 | 12 | 8 | 10 | 44 - 41 | +3 | 44 | שלב המוקדמות הראשון בגביע אופ"א |
| 6 | אלניה ולדיקווקז | 30 | 12 | 7 | 11 | 54 - 45 | +9 | 43 | שלב המוקדמות הראשון בגביע אופ"א |
| 7 | רוסטסלמאש | 30 | 11 | 8 | 11 | 32 - 37 | -5 | 41 | שלב המוקדמות השלישי בגביע אופ"א |
| 8 | זניט סנקט פטרבורג | 30 | 9 | 12 | 9 | 36 - 34 | +2 | 39 | שלב המוקדמות השני בגביע אופ"א |
| 9 | אוראלאן אליסטה | 30 | 10 | 6 | 14 | 27 - 34 | -7 | 36 | |
| 10 | סאטורן ראמנסקו | 30 | 8 | 10 | 12 | 38 - 30 | -8 | 34 | |
| 11 | לוקומוטיב ניז'ני נובגורוד | 30 | 9 | 10 | 11 | 48 - 33 | -15 | 33 | |
| 12 | קריליה סובייטוב סמרה | 30 | 8 | 7 | 15 | 39 - 49 | -10 | 31 | |
| 13 | רוטור וולגוגרד | 30 | 7 | 10 | 13 | 36 - 51 | -15 | 31 | |
| 14 | צ'רנומורץ נובורוסיסק | 30 | 7 | 8 | 15 | 30 - 49 | -19 | 29 | |
| 15 | ז'מצ'וז'ינה סוצ'י | 30 | 5 | 11 | 14 | 29 - 55 | -26 | 26 | הדחה לליגת המשנה הרוסית |
| 16 | שיניק ירוסלבל | 30 | 5 | 9 | 16 | 21 - 45 | -24 | 24 | הדחה לליגת המשנה הרוסית |
מק' - מיקום; מש' - משחקים; נצ' - ניצחונות; הפ' - הפסדים; ש"ז -שערי זכות; ש"ח - שערי חובה; ה"ש - הפרש שערים; נק' - נקודות