משתמש:YoavRamon/Eukaryote

מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית

- סיווג הופק ב-2005 עבור החברה הבינלאומית של Protistologists,[1] אשר שיקפה את ההסכמה של הזמן, חילק את eukaryotes לשש כביכול monophyletic 'supergroups'. עם זאת, באותה שנה (2005), ספקות לידי ביטוי אם חלקם של אלה supergroups היו monophyletic, במיוחד Chromalveolata,[2] וביקורת בשנת 2006 ציינו את חוסר ראיות כמה אמור שש supergroups.[3] המתוקן סיווג ב-2012 מזהה חמש supergroups.

Archaeplastida (או Primoplantae) צמחי היבשה, ירוק, אצות, אצות, glaucophytes
SAR supergroup Stramenopiles (בראון אצות, צורניות, וכו'.), Alveolata, Rhizaria (Foraminifera, רדיו לריה, שונים אחרים amoeboid חד-תאיים).
Excavata שונים flagellate חד-תאיים
Amoebozoa רוב lobose amoeboids ואת הריריות
Opisthokonta בעלי החיים, פטריות, choanoflagellates, וכו'.

יש גם קבוצות קטנות יותר של eukaryotes אשר עמדה זה בטוח או נראה ליפול מחוץ קבוצות עיקריות — בפרט, Haptophyta, Cryptophyta, Centrohelida, Telonemia, Picozoa, Apusomonadida, Ancyromonadida, Breviatea, הסוג Collodictyon.[4] באופן כללי, נראה כי למרות התקדמות, יש עדיין מאוד משמעותית את חוסר הוודאות של ההיסטוריה האבולוציונית וסיווג של eukaryotes. כמו רוג ' ר & סימפסון אמר ב-2009 "עם הזרם קצב השינוי בהבנה שלנו של eukaryote עץ החיים, אנחנו צריכים להמשיך בזהירות."[5]

במאמר שפורסם בכתב הטבע מיקרוביולוגיה באפריל 2016 המחברים, "חיזק שוב את החיים שאנו רואים סביבנו – צמחים, חיות, בני אדם, מה שנקרא אחרים eukaryotes – מייצג את אחוז קטן של המגוון הביולוגי בעולם." הם מסווגים eukaryote ", המבוסס על הירושה שלהם מערכות מידע בניגוד השומנים או אחרים מבנים הסלולר." ג 'יליאן פ Banfield של האוניברסיטה של קליפורניה, ברקלי ואת עמיתיי המדענים השתמשו מחשב סופר, כדי ליצור תרשים חדש של עץ החיים, בהתבסס על דנ" א מ-3000 מינים כולל 2,072 מינים ידועים ו-1,011 לאחרונה דווח על אורגניזמים חיידקים, ה-DNA שלו הם אספו ממגוון סביבות.[6] כמו היכולת רצף הדנ " א הפך קל יותר, Banfield והצוות היו מסוגלים לעשות metagenomic רצף—"רצף קהילות שלמות של יצורים בבת אחת, לבחור את קבוצות בודדות בהתבסס על הגנים שלהם לבד."[7]

Phylogeny[עריכת קוד מקור | עריכה]

ה rRNA עצים שנבנו במהלך 1980 ו 1990 עזב ביותר eukaryotes ב בלתי פתורות "כתר" קבוצת (לא טכנית אמיתית כתר), אשר היה בדרך כלל מחולק בצורה של המיטוכונדריה cristae; ראה כתר eukaryotes. כמה קבוצות חוסר המיטוכונדריה מסועף בנפרד, וכך העדר האמין להיות פרימיטיבי, אבל זה נחשב כיום חפץ של זמן-סניף משיכה, והם ידועים לי שאיבדתי אותם שנית.[8][9]

החל מ-2011תבנית:As ofשם היא נפוצה הסכם זה את Rhizaria שייך עם Stramenopiles את Alveolata, clade המכונה SAR supergroup, כך Rhizaria הוא לא אחד הראשי eukaryote קבוצות; גם Amoebozoa ו Opisthokonta כל monophyletic, טופס clade, המכונה לעתים קרובות unikonts.[10][11][12][13][14] . מעבר זה, אינו מופיע להיות קונצנזוס.

זה כבר העריך כי ייתכן 75 ברורים שושלות של eukaryotes.[15] רוב אלה שושלות הם protists.

ידוע eukaryote הגנום בגדלים משתנים 8.2 megabases (Mb) Babesia בוביס כדי 112,000–220,050 Mb את dinoflagellate Prorocentrum micans, מראה כי הגנום של הקדמונים eukaryote עבר ניכרת וריאציה במהלך האבולוציה שלה. האחרונה אב קדמון משותף של כל eukaryotes הוא האמין להיות phagotrophic protist עם גרעין, לפחות אחד centriole ו cilium, facultatively אירובי המיטוכונדריה, סקס (מיוזה ו syngamy), רדום ציסטה עם קיר התא של chitin ו/או תאית ו peroxisomes. מאוחר יותר endosymbiosis הוביל את התפשטות plastids בכמה שושלות.

חמש supergroups[עריכת קוד מקור | עריכה]

נכון , et al. 2012 ו Burki 2014/2016 עם Cryptophyta ו picozoa שיש צמחו בתוך Archaeplastida.[16][17][18][19][20] דומה הכללת Glaucophyta, Cryptista (וגם, באופן יוצא דופן, Haptista) יש גם נעשו.

המלצות[עריכת קוד מקור | עריכה]

  1. ^ Adl SM, Simpson AG, Farmer MA, Andersen RA, Anderson OR, Barta JR, et al. (2005). "The new higher level classification of eukaryotes with emphasis on the taxonomy of protists". The Journal of Eukaryotic Microbiology. 52 (5): 399–451. doi:10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x. PMID 16248873.
  2. ^ Harper JT, Waanders E, Keeling PJ (בינואר 2005). "On the monophyly of chromalveolates using a six-protein phylogeny of eukaryotes" (PDF). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 55 (Pt 1): 487–96. doi:10.1099/ijs.0.63216-0. PMID 15653923. אורכב מ-המקור (PDF) ב-17 בדצמבר 2008. {{cite journal}}: (עזרה)
  3. ^ Parfrey LW, Barbero E, Lasser E, Dunthorn M, Bhattacharya D, Patterson DJ, Katz LA (בדצמבר 2006). "Evaluating support for the current classification of eukaryotic diversity". PLoS Genetics. 2 (12): e220. doi:10.1371/journal.pgen.0020220. PMC 1713255. PMID 17194223. {{cite journal}}: (עזרה)
  4. ^ Romari, Khadidja; Vaulot, Daniel (2004). "Composition and temporal variability of picoeukaryote communities at a coastal site of the English Channel from 18S rDNA sequences". Limnol Oceanogr. 49 (3): 784–98. Bibcode:2004LimOc..49..784R. doi:10.4319/lo.2004.49.3.0784. {{cite journal}}: פרמטר לא ידוע |name-list-format= (הצעה: |name-list-style=) (עזרה)
  5. ^ Roger AJ, Simpson AG (בפברואר 2009). "Evolution: revisiting the root of the eukaryote tree". Current Biology. 19 (4): R165–7. doi:10.1016/j.cub.2008.12.032. PMID 19243692. {{cite journal}}: (עזרה)
  6. ^ Hug LA, Baker BJ, Anantharaman K, Brown CT, Probst AJ, Castelle CJ, Butterfield CN, Hernsdorf AW, Amano Y, Ise K, Suzuki Y, Dudek N, Relman DA, Finstad KM, Amundson R, Thomas BC, Banfield JF (באפריל 2016). "A new view of the tree of life". Nature Microbiology. 1 (5): 16048. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48. PMID 27572647. {{cite journal}}: (עזרה)
  7. ^ Sanders, Robert (11 באפריל 2016). "Wealth of unsuspected new microbes expands tree of life". Berkeley News. נבדק ב-2016-04-11. {{cite web}}: (עזרה)
  8. ^ Tovar J, Fischer A, Clark CG (ביוני 1999). "The mitosome, a novel organelle related to mitochondria in the amitochondrial parasite Entamoeba histolytica". Molecular Microbiology. 32 (5): 1013–21. doi:10.1046/j.1365-2958.1999.01414.x. PMID 10361303. {{cite journal}}: (עזרה)
  9. ^ Boxma B, de Graaf RM, van der Staay GW, van Alen TA, Ricard G, Gabaldón T, van Hoek AH, Moon-van der Staay SY, Koopman WJ, van Hellemond JJ, Tielens AG, Friedrich T, Veenhuis M, Huynen MA, Hackstein JH (במרץ 2005). "An anaerobic mitochondrion that produces hydrogen". Nature. 434 (7029): 74–9. Bibcode:2005Natur.434...74B. doi:10.1038/nature03343. PMID 15744302. {{cite journal}}: (עזרה)
  10. ^ Burki F, Shalchian-Tabrizi K, Minge M, Skjaeveland A, Nikolaev SI, Jakobsen KS, Pawlowski J (באוגוסט 2007). Butler G (ed.). "Phylogenomics reshuffles the eukaryotic supergroups". PLOS One. 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO...2..790B. doi:10.1371/journal.pone.0000790. PMC 1949142. PMID 17726520. {{cite journal}}: (עזרה)
  11. ^ Burki F, Shalchian-Tabrizi K, Pawlowski J (באוגוסט 2008). "Phylogenomics reveals a new 'megagroup' including most photosynthetic eukaryotes". Biology Letters. 4 (4): 366–9. doi:10.1098/rsbl.2008.0224. PMC 2610160. PMID 18522922. {{cite journal}}: (עזרה)
  12. ^ Burki F, Inagaki Y, Bråte J, Archibald JM, Keeling PJ, Cavalier-Smith T, Sakaguchi M, Hashimoto T, Horak A, Kumar S, Klaveness D, Jakobsen KS, Pawlowski J, Shalchian-Tabrizi K (ביולי 2009). "Large-scale phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, telonemia and centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates". Genome Biology and Evolution. 1: 231–8. doi:10.1093/gbe/evp022. PMC 2817417. PMID 20333193. {{cite journal}}: (עזרה)
  13. ^ Hackett JD, Yoon HS, Li S, Reyes-Prieto A, Rümmele SE, Bhattacharya D (באוגוסט 2007). "Phylogenomic analysis supports the monophyly of cryptophytes and haptophytes and the association of rhizaria with chromalveolates". Molecular Biology and Evolution. 24 (8): 1702–13. doi:10.1093/molbev/msm089. PMID 17488740. {{cite journal}}: (עזרה)
  14. ^ Cavalier-Smith T (ביוני 2010). "Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree". Biology Letters. 6 (3): 342–5. doi:10.1098/rsbl.2009.0948. PMC 2880060. PMID 20031978. {{cite journal}}: (עזרה)
  15. ^ Jagus R, Bachvaroff TR, Joshi B, Place AR (2012). "Diversity of Eukaryotic Translational Initiation Factor eIF4E in Protists". Comparative and Functional Genomics. 2012: 1–21. doi:10.1155/2012/134839. PMC 3388326. PMID 22778692.
  16. ^ Burki F (במאי 2014). "The eukaryotic tree of life from a global phylogenomic perspective". Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 6 (5): a016147. doi:10.1101/cshperspect.a016147. PMC 3996474. PMID 24789819. {{cite journal}}: (עזרה)
  17. ^ Burki F, Kaplan M, Tikhonenkov DV, Zlatogursky V, Minh BQ, Radaykina LV, Smirnov A, Mylnikov AP, Keeling PJ (בינואר 2016). "Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista". Proceedings: Biological Sciences. 283 (1823): 20152802. doi:10.1098/rspb.2015.2802. PMC 4795036. PMID 26817772. {{cite journal}}: (עזרה)
  18. ^ Janouškovec J, Tikhonenkov DV, Burki F, Howe AT, Rohwer FL, Mylnikov AP, Keeling PJ (בדצמבר 2017). "A New Lineage of Eukaryotes Illuminates Early Mitochondrial Genome Reduction". Current Biology. 27 (23): 3717–3724.e5. doi:10.1016/j.cub.2017.10.051. PMID 29174886. {{cite journal}}: (עזרה)
  19. ^ Bodył A (בפברואר 2018). "Did some red alga-derived plastids evolve via kleptoplastidy? A hypothesis". Biological Reviews of the Cambridge Philosophical Society. 93 (1): 201–222. doi:10.1111/brv.12340. PMID 28544184. {{cite journal}}: (עזרה)
  20. ^ Brown MW, Heiss AA, Kamikawa R, Inagaki Y, Yabuki A, Tice AK, Shiratori T, Ishida KI, Hashimoto T, Simpson AG, Roger AJ (בפברואר 2018). "Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group". Genome Biology and Evolution. 10 (2): 427–433. doi:10.1093/gbe/evy014. PMC 5793813. PMID 29360967. {{cite journal}}: (עזרה)

הערות[עריכת קוד מקור | עריכה]

[[קטגוריה:איקריוטים]]

אוחזר מתוך "https://he.wikipedia.org/w/index.php?title=משתמש:YoavRamon/Eukaryote&oldid=33812645"