לדלג לתוכן

DNA עתיק – הבדלי גרסאות

מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית
עיון אינטראקטיבי בהיסטוריה
→ העריכה הקודמתהעריכה הבאה ←
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
חזותיקוד ויקי
←‏זיהום: עברית * 2
תרגום פסקאות נוספות
שורה 5: שורה 5:


== היסטוריה של חקר DNA עתיק ==
== היסטוריה של חקר DNA עתיק ==

=== '''שנות ה-80''' ===
המחקר הראשון של מה שעתיד להיקרא לימים DNA עתיק, בוצע בשנת [[1984]], כאשר ראס היגוצ'י ועמיתיו ב[[אוניברסיטת קליפורניה בברקלי]], דיווחו כי שרידי DNA ממוצג מוזיאלי של [[קואגה]] לא רק שהשתמרו בו מקץ 150 שנה מרגע מותו של הפרט, אלא שגם ניתן למצות שרידים אלה ו[[ריצוף DNA|לרצפם]].<ref name="pmid65041422">{{cite journal|title=DNA sequences from the quagga, an extinct member of the horse family|date=1984|journal=Nature|issue=5991|doi=10.1038/312282a0|volume=312|pages=282–4|bibcode=1984Natur.312..282H|pmid=6504142}}</ref> במהלך השנתיים הבאות, באמצעות מחקר של מוצגים שהשתמרו באופן טבעי או [[חניטה|נחנטו]], הגנטיקאי האבולוציוני [[סוונטה פבו]] אישש כי תופעה זו איננה מוגבלת אך ורק למוצגים מוזיאליים בני זמננו אלא שניתן ליישם את שיטות המחקר למגוון של מוצגים אנושיים שנחנטו ואשר גילם המשוערך עומד על אלפי שנים.<ref name="Pääbo 1985a">{{cite journal|title=Preservation of DNA in ancient Egyptian mummies|date=|journal=J. Archaeol. Sci.|issue=6|doi=10.1016/0305-4403(85)90002-0|year=1985a|volume=12|pages=411–17}}</ref><ref name="Pääbo 1985b">{{cite journal|title=Molecular cloning of Ancient Egyptian mummy DNA|date=|journal=Nature|issue=6012|doi=10.1038/314644a0|year=1985b|volume=314|pages=644–5|bibcode=1985Natur.314..644P|pmid=3990798}}</ref><ref name="Pääbo_1986">{{cite journal|title=Molecular genetic investigations of ancient human remains|date=1986|journal=Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology|issue=Pt 1|doi=10.1101/SQB.1986.051.01.053|volume=51|pages=441–6|pmid=3107879}}</ref>

התהליכים המעבדתיים הנדרשים על מנת לרצף DNA עתיק באמצעות [[שיבוט]] בקטריאלי היוו אבן נגף בפיתוח תחום חקר ה-DNA העתיק. עם זאת, פיתוח שיטת ה-[[PCR]] ב[[שנות ה-80 של המאה ה-20|שנות ה-80]] המאוחרות סייע להתקדמות התחום בצורה מהירה למדי.<ref name="pmid3431465">{{cite journal|url=https://archive.org/details/recombinantdna0000unse/page/335|title=Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction|date=1987|journal=Methods in Enzymology|doi=10.1016/0076-6879(87)55023-6|volume=155|pages=335–50|isbn=978-0-12-182056-5|pmid=3431465}}</ref><ref name="Saiki_1988">{{cite journal|title=Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase|date=January 1988|journal=Science|issue=4839|doi=10.1126/science.239.4839.487|volume=239|pages=487–91|bibcode=1988Sci...239..487S|pmid=2448875|display-authors=6}}</ref> כיום ידוע כי PCR המבוסס על הגברת [[תחל|פריימר]] כפול מביא לקבלת ממצאים שגויים בתהליך הריצוף (DNA מעוות ובלתי אותנטי). תחת זאת, נהוג להשתמש ב-PCR מקונן המבוסס על ריבוי פריימרים כדי להתגבר על חסרונות אלה.

=== '''שנות ה-90''' ===
העידן שבא לאחר המצאת ה-PCR לווה בגל של פרסומים מטעם קבוצות מחקר שטענו כי הצליחו לבודד DNA עתיק. בהמשך לכך, פורסמה סדרה של ממצאים שטענו כי DNA אותנטי ניתן למיצוי מדוגמאות בנות מיליוני שנים, אשר זכו לשם "DNA מתקופת טרום-המבול" (Antediluvian DNA).<ref name="Lindahl 1993b">{{cite journal|title=Recovery of antediluvian DNA|date=October 1993|journal=Nature|issue=6448|doi=10.1038/365700a0|volume=365|pages=700|bibcode=1993Natur.365..700L|pmid=8413647}}</ref> רוב הטענות התבססו על שחזור DNA מ[[אורגניזם|אורגניזמים]] שנשתמרו בתוך [[ענבר]]. נטען בין היתר כי רצפים שמוצו מתוך חרקים כגון [[דבורים]] חסרות-עוקץ,<ref name="Cano ''et al.'' 1992a">{{cite journal|title=Isolation and partial characterisation of DNA from the bee Problebeia dominicana (Apidae:Hymenoptera) in 25–40 million year old amber|date=|journal=Med Sci Res|year=1992a|volume=20|pages=249–51}}</ref><ref name="Cano ''et al.'' 1992b">{{cite journal|title=Enzymatic amplification and nucleotide sequencing of portions of the 18S rRNA gene of the bee Problebeia dominicana (Apidae:Hymenoptera) isolated from 25–40 million year old Dominican amber|date=|journal=Med Sci Res|year=1992b|volume=20|pages=619–22}}</ref><ref name="pmid18979000">{{cite journal|title=Extracting DNA from the gut microbes of the termite (Zootermopsis nevadensis)|date=2007|journal=Journal of Visualized Experiments|issue=4|doi=10.3791/195|volume=|pages=195|pmc=2556161|pmid=18979000}}</ref> [[טרמיטים]] ו[[יתושים|יתושי]] עצים,<ref name="pmid7888749">{{cite journal|title=Very old DNA|date=December 1994|journal=Current Opinion in Genetics & Development|issue=6|doi=10.1016/0959-437x(94)90064-7|volume=4|pages=810–5|pmid=7888749}}</ref> כמו גם [[צומח|צמחים]]<ref name="pmid78887492">{{cite journal|title=Very old DNA|date=December 1994|journal=Current Opinion in Genetics & Development|issue=6|doi=10.1016/0959-437x(94)90064-7|volume=4|pages=810–5|pmid=7888749}}</ref> ו[[חיידקים|בקטריות]],<ref>{{cite journal|title=Bacillus DNA in fossil bees: an ancient symbiosis?|date=June 1994|journal=Applied and Environmental Microbiology|issue=6|doi=10.1128/aem.60.6.2164-2167.1994|volume=60|pages=2164–2167|pmc=201618|pmid=8031102}}</ref> מוצו מענבר [[הרפובליקה הדומיניקנית|דומיניקני]] שמתוארך לתקופת ה[[אוליגוקן]]; דווח גם כי מוצה DNA אותנטי מתוך מקורות של [[חדקוניתיים|חדקוניות]] שנשתמרו בענבר [[לבנון|לבנוני]], שתוארכו לתקופת ה[[קרטיקון]].<ref>{{cite journal|title=Amplification and sequencing of DNA from a 120-135-million-year-old weevil|date=June 1993|journal=Nature|issue=6429|doi=10.1038/363536a0|volume=363|pages=536–538|pmid=8505978}}</ref> טענות אלה לא הוגבלו אך ורק לגבי ענבר.

עוד פורסמו דיווחים על שיירי צמחים שנשתמרו במשקעים המתוארכים לתקופת ה[[מיוקן]].<ref name="Golenberg ''et al.'' 1990">{{cite journal|title=Amplification and analysis of Miocene plant fossil DNA|date=September 1991|journal=Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences|issue=1268|doi=10.1098/rstb.1991.0092|volume=333|pages=419–26; discussion 426–7|pmid=1684052|vauthors=}}</ref><ref name="Golenberg 1991">{{cite journal|title=Chloroplast DNA sequence from a miocene Magnolia species|date=April 1990|journal=Nature|issue=6267|doi=10.1038/344656a0|volume=344|pages=656–8|bibcode=1990Natur.344..656G|pmid=2325772}}</ref> בשנת [[1994]], וודוורד ועמיתיו כתבו כי את מה שנחשב לאחד הממצאים המשמעותיים עד אותה העת<ref name="pmid7973705">{{cite journal|title=DNA sequence from Cretaceous period bone fragments|date=November 1994|journal=Science|issue=5188|doi=10.1126/science.7973705|volume=266|pages=1229–32|bibcode=1994Sci...266.1229W|pmid=7973705}}</ref> - רצפי [[ציטוכרום]] [[מיטוכונדריון|מיטוכונדריאלי]] b שמוצו מעצמות [[דינוזאורים|דינוזאור]] ושגילן המשוער עומד על למעלה מ-80 מיליון שנה.

בשנת [[1995]], שני מחקרים נוספים דיווחו כי רצפי DNA של דינוזאור מוצו מביצה מתקופת הקרטיקון.<ref name="An ''et al.'' 1995">{{cite journal|title=Molecular cloning and sequencing of the 18S rDNA from specialized dinosaur egg fossil found in Xixia Henan, China|date=|journal=Acta Sci Nat Univ Pekinensis|year=1995|volume=31|pages=140–47}}</ref><ref name="Li_1995">{{cite journal|title=DNA isolation and sequence analysis of dinosaur DNA from Cretaceous dinosaur egg in Xixia Henan, China|date=|journal=Acta Sci Nat Univ Pekinensis|year=1995|volume=31|pages=148–52}}</ref> נדמה היה כי תחום חקר ה-DNA העתיק יחולל מהפכה בכל הקשור לידע על עברו האבולוציוני של [[כדור הארץ]]. מעבר לממצאים אלה גם שוחזרו רצפים הלו-בקטריאליים בני 250 מיליון שנה שמוצו מ[[הליט]].<ref name="pmid11057666">{{cite journal|title=Isolation of a 250 million-year-old halotolerant bacterium from a primary salt crystal|date=October 2000|journal=Nature|issue=6806|doi=10.1038/35038060|volume=407|pages=897–900|bibcode=2000Natur.407..897V|pmid=11057666}}</ref><ref name="pmid12024211">{{cite journal|title=Recovery of 16S ribosomal RNA gene fragments from ancient halite|date=May 2002|journal=Nature|issue=6887|doi=10.1038/417432a|volume=417|pages=432–6|bibcode=2002Natur.417..432F|pmid=12024211}}</ref>

בתקופה זו גם התפתחה ההבנה של [[קינטיקה כימית|קינטיקת]] שימור DNA. הסיכונים של זיהום דוגמאות וגורמי סיבוך מחקריים, הובילו את החוקרים בתחום זה להסתכל על הממצאים בצורה ספקנית יותר. מספר ניסיונות זהירים נעשו על מנת לשחזר רבים מהממצאים הקודמים, והתחוור כי כל הטענות בדבר DNA עתיק בן עשרות מיליוני שנים ששוחזר ורוצף כהלכה, אינן אותנטיות.<ref name="PääboPoinar2004">{{cite journal|url=http://www.454genomics.net/downloads/news-events/geneticanalysisfromancientdna.pdf|title=Genetic analyses from ancient DNA|date=|journal=Annual Review of Genetics|issue=1|doi=10.1146/annurev.genet.37.110801.143214|year=2004|volume=38|pages=645–79|pmid=15568989|archive-url=https://web.archive.org/web/20081217110352/http://www.454genomics.net/downloads/news-events/geneticanalysisfromancientdna.pdf|archive-date=December 17, 2008|display-authors=6}}</ref>

=== '''שנות האלפיים''' ===
על מנת להתמודד עם נזקי השינויים ב-DNA לאחר המוות, בשנת [[2007]] הוצגה שיטת הגברה באמצעות הרחבה של פריימר יחיד.<ref>{{cite journal|url=|title=Novel high-resolution characterization of ancient DNA reveals C > U-type base modification events as the sole cause of post mortem miscoding lesions|date=2007|journal=Nucleic Acids Research|issue=17|doi=10.1093/nar/gkm588|volume=35|pages=5717–28|pmc=2034480|pmid=17715147}}</ref> בשנת [[2009]], תחום חקר ה-DNA העתיק עבר מהפכה עת הוצגו טכניקות מחקר זולות ביחס לקיים עד אותה תקופה. השימוש בטכניקות ריצוף של הדור הבא, ומאפשרות תפוקה גבוהה, התבררה כחיונית לשחזור ה[[גנום|גנומים]] של אורגניזמים עתיקים או כאלה שנכחדו. כמו כן, נבנתה ספריית DNA [[גדיל (ביולוגיה)|חד-גדילי]], אשר הציתה עניין רב בקרב חוקרי DNA עתיק.<ref>{{cite journal|title=New insights on single-stranded versus double-stranded DNA library preparation for ancient DNA|date=December 2015|journal=BioTechniques|issue=6|doi=10.2144/000114364|volume=59|pages=368–71|pmid=26651516|display-authors=6}}</ref><ref>{{cite journal|title=Library construction for ancient genomics: single strand or double strand?|date=June 2014|journal=BioTechniques|issue=6|doi=10.2144/000114176|volume=56|pages=289–90, 292–6, 298, passim|pmid=24924389}}</ref>

בנוסף להתפתחויות הטכנולוגית, התפתחו גם תקנים וקריטריונים טובים יותר המשמשים להערכת תוצאות DNA, כמו גם הבנה טובה יותר של סך הבעיות הפוטנציאליות הטמונות במחקר DNA עתיק.<ref name="pmid15719062">{{cite journal|title=Ancient DNA comes of age|date=February 2005|journal=PLOS Biology|issue=2|doi=10.1371/journal.pbio.0030056|volume=3|pages=e56|pmc=548952|pmid=15719062}}</ref><ref name="PääboPoinar2004" />


== בעיות אפשריות ==
== בעיות אפשריות ==
שורה 15: שורה 34:


== DNA לא אנושי ==
== DNA לא אנושי ==
על אף הבעיות שנקשרו בשמו של DNA מתקופת טרום-המבול, פורסמה מאז מיסוד התחום שורה הולכת וגדלה של רצפי DNA עתיק שמוצו ממינים רבים של בעלי חיים וצמחים. [[רקמת תאים|רקמות]] שנבחנו כוללות שרידי בעלי חיים שנחנטו מלאכותית או טבעית,<ref name="pmid65041422" /><ref name="pmid2755507">{{cite journal|title=DNA phylogeny of the extinct marsupial wolf|date=August 1989|journal=Nature|issue=6233|doi=10.1038/340465a0|volume=340|pages=465–7|bibcode=1989Natur.340..465T|pmid=2755507}}</ref> [[עצם|עצמות]],<ref name="Hagelberg ''et al.'' 1989">{{cite journal|title=Ancient bone DNA amplified|date=November 1989|journal=Nature|issue=6249|doi=10.1038/342485a0|volume=342|pages=485|bibcode=1989Natur.342..485H|pmid=2586623}}</ref><ref name="Cooper ''et al.'' 1992">{{cite journal|title=Independent origins of New Zealand moas and kiwis|date=September 1992|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|issue=18|doi=10.1073/pnas.89.18.8741|volume=89|pages=8741–4|bibcode=1992PNAS...89.8741C|pmc=49996|pmid=1528888}}</ref><ref name="Hagelberg ''et al.'' 1994">{{cite journal|title=DNA from ancient mammoth bones|date=August 1994|journal=Nature|issue=6488|doi=10.1038/370333b0|volume=370|pages=333–4|bibcode=1994Natur.370R.333H|pmid=8047136}}</ref><ref name="pmid7991628">{{cite journal|title=Tracking the origins of the cave bear (Ursus spelaeus) by mitochondrial DNA sequencing|date=December 1994|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|issue=25|doi=10.1073/pnas.91.25.12336|volume=91|pages=12336–40|bibcode=1994PNAS...9112336H|pmc=45432|pmid=7991628}}</ref> [[צואה]] קדומה,<ref name="pmid9665881">{{cite journal|title=Molecular coproscopy: dung and diet of the extinct ground sloth Nothrotheriops shastensis|date=July 1998|journal=Science|issue=5375|doi=10.1126/science.281.5375.402|volume=281|pages=402–6|bibcode=1998Sci...281..402P|pmid=9665881|display-authors=6}}</ref><ref name="pmid11123610">{{cite journal|title=A molecular analysis of ground sloth diet through the last glaciation|date=December 2000|journal=Molecular Ecology|issue=12|doi=10.1046/j.1365-294X.2000.01106.x|volume=9|pages=1975–84|pmid=11123610}}</ref> דוגמאות [[כוהל]] שנשתמרו,<ref name="Junqueira ''et al.'' 2002">{{cite journal|title=Methods for the recovery of mitochondrial DNA sequences from museum specimens of myiasis-causing flies|date=March 2002|journal=Medical and Veterinary Entomology|issue=1|doi=10.1046/j.0269-283x.2002.00336.x|volume=16|pages=39–45|pmid=11963980}}</ref> [[ערימת פסולת|ערימות פסולת]] של [[מכרסמים]],<ref name="pmid11975707">{{cite journal|title=Molecular analysis of an 11,700-year-old rodent midden from the Atacama Desert, Chile|date=May 2002|journal=Molecular Ecology|issue=5|doi=10.1046/j.1365-294X.2002.01492.x|volume=11|pages=913–24|pmid=11975707}}</ref> שרידי צמחים יבשים,<ref name="Goloubinoff ''et al.'' 1993">{{cite journal|title=Evolution of maize inferred from sequence diversity of an Adh2 gene segment from archaeological specimens|date=March 1993|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|issue=5|doi=10.1073/pnas.90.5.1997|volume=90|pages=1997–2001|bibcode=1993PNAS...90.1997G|pmc=46007|pmid=8446621}}</ref><ref name="Dumolin-Lapegue ''et al.'' 1999">{{cite journal|title=Amplification of oak DNA from ancient and modern wood|date=December 1999|journal=Molecular Ecology|issue=12|doi=10.1046/j.1365-294x.1999.00788.x|volume=8|pages=2137–40|pmid=10632865}}</ref> וכן מיצויים של DNA מבעלי חיים או צמחים היישר מתוך דגימות קרקע.<ref name="pmid15875564">{{cite journal|title=Ancient DNA|date=January 2005|journal=Proceedings. Biological Sciences|issue=1558|doi=10.1098/rspb.2004.2813|volume=272|pages=3–16|pmc=1634942|pmid=15875564}}</ref>

ביוני [[2013]], קבוצה של חוקרים ובהם אסקה ווילרסלב, מרכוס תומס, פיוס גילברט ואורלנדו לודוביק מהמרכז לגאו-גנטיקה במוזיאון הטבע של [[דנמרק]] (המשויך ל[[אוניברסיטת קופנהגן]]) הכריזה כי הצליחה לרצף DNA של [[סוס הבית|סוס]], בן 560-780 אלפי שנים, וזאת באמצעות מיצוי חומרים מעצם [[רגל|רגלית]] שנמצאה קבורה ב[[קפאת-עד]] ב[[יוקון]] שב[[קנדה]].<ref name="Hayden_2013">{{cite news|url=http://www.nature.com/news/first-horses-arose-4-million-years-ago-1.13261|title=First horses arose 4 million years ago|author=Erika Check Hayden|publisher=Nature|date=26 June 2013|doi=10.1038/nature.2013.13261}}</ref><ref>{{cite web|url=https://www.nationalgeographic.co.uk/history-and-civilisation/2017/11/worlds-oldest-genome-sequenced-700000-year-old-horse-dna|title=World's Oldest Genome Sequenced From 700,000-Year-Old Horse DNA|work=[[National Geographic]]|date=November 7, 2017}}</ref><ref>{{cite journal|title=Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse|date=July 2013|journal=Nature|issue=7456|doi=10.1038/nature12323|volume=499|pages=74–8|bibcode=2013Natur.499...74O|pmid=23803765|display-authors=6}}</ref>

קבוצה [[גרמניה|גרמנית]] פרסמה, גם כן בשנת 2013, כי הצליחה לשחזר גנום מיטוכונדריאלי של [[דוביים|דב]] בן למעלה מ-300 אלפי שנים, ובכך הוכיחה כי DNA עתיק אותנטי יכול להשתמר במשך מאות אלפי שנים מחוץ לקפאת-עד.<ref name="PNAS-2013">{{cite journal|title=Complete mitochondrial genome sequence of a Middle Pleistocene cave bear reconstructed from ultrashort DNA fragments|date=September 2013|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|issue=39|doi=10.1073/pnas.1314445110|volume=110|pages=15758–63|bibcode=2013PNAS..11015758D|pmc=3785785|pmid=24019490|display-authors=6}}</ref> בשנת [[2021]] דווח כי רצף DNA עתיק אף יותר, אשר השתמר בקפאת-עד, מוצה מתוך שתי [[ממותה|ממותות]] סיביריות בנות למעלה ממיליון שנה.<ref name="CNN-20210217">{{cite news|title=World's oldest DNA sequenced from a mammoth that lived more than a million years ago|url=https://www.cnn.com/2021/02/17/world/mammoth-oldest-dna-million-years-ago-scn/index.html|date=17 February 2021|work=[[CNN|CNN News]]|accessdate=17 February 2021}}</ref><ref name="NAT-20210217">{{cite journal|title=Million-year-old mammoth genomes shatter record for oldest ancient DNA|date=February 2021|journal=Nature|issue=7847|doi=10.1038/d41586-021-00436-x|volume=590|pages=537–538|pmid=33597786}}</ref>

בשנת 2016 נחקר DNA [[כלורופלסט|כלורופלסטי]] שמוצה מליבת משקעים ימיים, ונמצא DNA של [[צורניות]] שמתוארך ל-1.4 מיליון שנה טרם זמננו ובכך נקבע שיא חדש של גיל DNA עתיק אותנטי.<ref name="Kirkpatrick_2016">{{Cite journal|url=https://digitalcommons.uri.edu/cgi/viewcontent.cgi?article=1606&context=gsofacpubs|title=Fossil DNA persistence and decay in marine sediment over hundred-thousand-year to million-year time scales|date=2016-07-08|journal=Geology|issue=8|doi=10.1130/g37933.1|volume=44|pages=615–18|language=en|bibcode=2016Geo....44..615K|issn=0091-7613}}</ref> קבוצתו של קירקפטריק מצאה כי ה-DNA עבר תהליך [[דעיכה מעריכית|דעיכה]] לאורך [[מחצית חיים|זמן מחצית חיים]] של כ-100 אלף שנים, לאחריו התרחשה דעיכה בקצב איטי יותר (שמתואר מתמטית על ידי חוק חזקה).<ref name="Kirkpatrick_20162">{{Cite journal|url=https://digitalcommons.uri.edu/cgi/viewcontent.cgi?article=1606&context=gsofacpubs|title=Fossil DNA persistence and decay in marine sediment over hundred-thousand-year to million-year time scales|date=2016-07-08|journal=Geology|issue=8|doi=10.1130/g37933.1|volume=44|pages=615–18|language=en|bibcode=2016Geo....44..615K|issn=0091-7613}}</ref>


== DNA אנושי ==
== DNA אנושי ==

גרסה מ־21:59, 10 בדצמבר 2021

DNA שהופק מכבד בן 4,000 שנים של כהן מצרי עתיק

DNA עתיק (aDNA) הוא DNA שמבודד מדגימות עתיקות.[1][2] עקב תהליכי ההתיישנות שעובר החומר, ה-DNA העתיק מתפורר יותר בהשוואה לחומר גנטי טרי.[3] אפילו בתנאי השימור הטובים ביותר, בחלוף 0.4-1.5 מיליון שנים, כמות ה-DNA בדגימה לא תאפשר לבצע ריצוף כהלכה.[4]

מאז מיסוד המחקר בתחום חקר ה-DNA העתיק, שוחזר חומר גנטי משלדים מהתקופה הפליאוליתית, מרקמות חנוטות, מאוספים ארכיוניים של דגימות רפואיות לא קפואות, משרידי צמחים משומרים, מקרקע קפואה, וממצאים שהתגלו בחפירות ארכאולוגיות.[1]

היסטוריה של חקר DNA עתיק

שנות ה-80

המחקר הראשון של מה שעתיד להיקרא לימים DNA עתיק, בוצע בשנת 1984, כאשר ראס היגוצ'י ועמיתיו באוניברסיטת קליפורניה בברקלי, דיווחו כי שרידי DNA ממוצג מוזיאלי של קואגה לא רק שהשתמרו בו מקץ 150 שנה מרגע מותו של הפרט, אלא שגם ניתן למצות שרידים אלה ולרצפם.[5] במהלך השנתיים הבאות, באמצעות מחקר של מוצגים שהשתמרו באופן טבעי או נחנטו, הגנטיקאי האבולוציוני סוונטה פבו אישש כי תופעה זו איננה מוגבלת אך ורק למוצגים מוזיאליים בני זמננו אלא שניתן ליישם את שיטות המחקר למגוון של מוצגים אנושיים שנחנטו ואשר גילם המשוערך עומד על אלפי שנים.[6][7][8]

התהליכים המעבדתיים הנדרשים על מנת לרצף DNA עתיק באמצעות שיבוט בקטריאלי היוו אבן נגף בפיתוח תחום חקר ה-DNA העתיק. עם זאת, פיתוח שיטת ה-PCR בשנות ה-80 המאוחרות סייע להתקדמות התחום בצורה מהירה למדי.[9][10] כיום ידוע כי PCR המבוסס על הגברת פריימר כפול מביא לקבלת ממצאים שגויים בתהליך הריצוף (DNA מעוות ובלתי אותנטי). תחת זאת, נהוג להשתמש ב-PCR מקונן המבוסס על ריבוי פריימרים כדי להתגבר על חסרונות אלה.

שנות ה-90

העידן שבא לאחר המצאת ה-PCR לווה בגל של פרסומים מטעם קבוצות מחקר שטענו כי הצליחו לבודד DNA עתיק. בהמשך לכך, פורסמה סדרה של ממצאים שטענו כי DNA אותנטי ניתן למיצוי מדוגמאות בנות מיליוני שנים, אשר זכו לשם "DNA מתקופת טרום-המבול" (Antediluvian DNA).[11] רוב הטענות התבססו על שחזור DNA מאורגניזמים שנשתמרו בתוך ענבר. נטען בין היתר כי רצפים שמוצו מתוך חרקים כגון דבורים חסרות-עוקץ,[12][13][14] טרמיטים ויתושי עצים,[15] כמו גם צמחים[16] ובקטריות,[17] מוצו מענבר דומיניקני שמתוארך לתקופת האוליגוקן; דווח גם כי מוצה DNA אותנטי מתוך מקורות של חדקוניות שנשתמרו בענבר לבנוני, שתוארכו לתקופת הקרטיקון.[18] טענות אלה לא הוגבלו אך ורק לגבי ענבר.

עוד פורסמו דיווחים על שיירי צמחים שנשתמרו במשקעים המתוארכים לתקופת המיוקן.[19][20] בשנת 1994, וודוורד ועמיתיו כתבו כי את מה שנחשב לאחד הממצאים המשמעותיים עד אותה העת[21] - רצפי ציטוכרום מיטוכונדריאלי b שמוצו מעצמות דינוזאור ושגילן המשוער עומד על למעלה מ-80 מיליון שנה.

בשנת 1995, שני מחקרים נוספים דיווחו כי רצפי DNA של דינוזאור מוצו מביצה מתקופת הקרטיקון.[22][23] נדמה היה כי תחום חקר ה-DNA העתיק יחולל מהפכה בכל הקשור לידע על עברו האבולוציוני של כדור הארץ. מעבר לממצאים אלה גם שוחזרו רצפים הלו-בקטריאליים בני 250 מיליון שנה שמוצו מהליט.[24][25]

בתקופה זו גם התפתחה ההבנה של קינטיקת שימור DNA. הסיכונים של זיהום דוגמאות וגורמי סיבוך מחקריים, הובילו את החוקרים בתחום זה להסתכל על הממצאים בצורה ספקנית יותר. מספר ניסיונות זהירים נעשו על מנת לשחזר רבים מהממצאים הקודמים, והתחוור כי כל הטענות בדבר DNA עתיק בן עשרות מיליוני שנים ששוחזר ורוצף כהלכה, אינן אותנטיות.[26]

שנות האלפיים

על מנת להתמודד עם נזקי השינויים ב-DNA לאחר המוות, בשנת 2007 הוצגה שיטת הגברה באמצעות הרחבה של פריימר יחיד.[27] בשנת 2009, תחום חקר ה-DNA העתיק עבר מהפכה עת הוצגו טכניקות מחקר זולות ביחס לקיים עד אותה תקופה. השימוש בטכניקות ריצוף של הדור הבא, ומאפשרות תפוקה גבוהה, התבררה כחיונית לשחזור הגנומים של אורגניזמים עתיקים או כאלה שנכחדו. כמו כן, נבנתה ספריית DNA חד-גדילי, אשר הציתה עניין רב בקרב חוקרי DNA עתיק.[28][29]

בנוסף להתפתחויות הטכנולוגית, התפתחו גם תקנים וקריטריונים טובים יותר המשמשים להערכת תוצאות DNA, כמו גם הבנה טובה יותר של סך הבעיות הפוטנציאליות הטמונות במחקר DNA עתיק.[30][26]

בעיות אפשריות

תהליכי פירוק

עקב תהליכי פירוק שעובר DNA בחלוף הזמן (בין היתר דיאמינציה וקיטוע), ה-DNA העתיק פחות איכותי מחומר גנטי מודרני.[3] חוסר השרידות של ה-aDNA לאורך זמן מגביל את אפשרויות הניתוח שלו, ובחלוף זמן רב קשה לקבל דגימות מוצלחות.[3] קיים מתאם בין כמות הזמן שחלפה לבין פירוק ה-DNA, אך תנאי הסביבה יכולים לגרום למתאם להיות לא אחיד.[31] בשל כך, סביר שדגימות שהשתמרו בתנאים שונים תתפרקנה באופן שונה, גם אם גיל הדגימות זהה.[32] תנאי הסביבה עשויים להשפיע על הדגימה גם לאחר שלב החפירה, שכן שיעורי ריקבון ה-DNA עשויים להשתנות בהתאם לתנאי האחסון.[33][34] גם בתנאי השימור הטובים ביותר, 0.4-1.5 מיליון שנים הן הגבול העליון לגיל הדגימה המאפשר ריצוף של ה-DNA בטכנולוגיות מודרניות.[4]

זיהום

דגימות DNA עתיקות עשויות להיות מזוהמות על ידי DNA אנושי מודרני ועל ידי DNA מיקרוביאלי (שרובו עתיק).[35][36] בשנים האחרונות פותחו שיטות למניעת זיהום אפשרי של דגימות aDNA. השיטות כוללות חילוץ חלקים בתנאים סטריליים ושימוש במתאמים מיוחדים לזיהוי מולקולות ששייכות לדגימה המקורית. בנוסף, קיימים יישומים מתחום הביואינפורמטיקה המאפשרים להעריך את מידת הזיהום ברצף באמצעות השוואה לרצפים מוכרים.[37][38]

DNA לא אנושי

על אף הבעיות שנקשרו בשמו של DNA מתקופת טרום-המבול, פורסמה מאז מיסוד התחום שורה הולכת וגדלה של רצפי DNA עתיק שמוצו ממינים רבים של בעלי חיים וצמחים. רקמות שנבחנו כוללות שרידי בעלי חיים שנחנטו מלאכותית או טבעית,[5][39] עצמות,[40][41][42][43] צואה קדומה,[44][45] דוגמאות כוהל שנשתמרו,[46] ערימות פסולת של מכרסמים,[47] שרידי צמחים יבשים,[48][49] וכן מיצויים של DNA מבעלי חיים או צמחים היישר מתוך דגימות קרקע.[50]

ביוני 2013, קבוצה של חוקרים ובהם אסקה ווילרסלב, מרכוס תומס, פיוס גילברט ואורלנדו לודוביק מהמרכז לגאו-גנטיקה במוזיאון הטבע של דנמרק (המשויך לאוניברסיטת קופנהגן) הכריזה כי הצליחה לרצף DNA של סוס, בן 560-780 אלפי שנים, וזאת באמצעות מיצוי חומרים מעצם רגלית שנמצאה קבורה בקפאת-עד ביוקון שבקנדה.[51][52][53]

קבוצה גרמנית פרסמה, גם כן בשנת 2013, כי הצליחה לשחזר גנום מיטוכונדריאלי של דב בן למעלה מ-300 אלפי שנים, ובכך הוכיחה כי DNA עתיק אותנטי יכול להשתמר במשך מאות אלפי שנים מחוץ לקפאת-עד.[54] בשנת 2021 דווח כי רצף DNA עתיק אף יותר, אשר השתמר בקפאת-עד, מוצה מתוך שתי ממותות סיביריות בנות למעלה ממיליון שנה.[55][56]

בשנת 2016 נחקר DNA כלורופלסטי שמוצה מליבת משקעים ימיים, ונמצא DNA של צורניות שמתוארך ל-1.4 מיליון שנה טרם זמננו ובכך נקבע שיא חדש של גיל DNA עתיק אותנטי.[57] קבוצתו של קירקפטריק מצאה כי ה-DNA עבר תהליך דעיכה לאורך זמן מחצית חיים של כ-100 אלף שנים, לאחריו התרחשה דעיכה בקצב איטי יותר (שמתואר מתמטית על ידי חוק חזקה).[58]

DNA אנושי

מפה של מאובנים אנושיים שגילם מתוארך למעל 40,000 שנים, שהחקר שלהם הניב נתונים מפורטים על הגנום

בשל העניין האנתרופולוגי, הארכיאולוגי והציבורי בשרידי אדם, אלו זכו לתשומת לב רבה של חוקרי DNA. בעיית הזיהום מתגברת בחקר דגימות אנושיות, שכן הדגימות מגיעות ממין זהה לזה של החוקרים שאוספים ומעריכים את הדגימות.[59]

מקורות

בשל אופן השימור של מומיות, מחקרים רבים משנות ה-90 וה-2000 השתמשו ברקמה חנוטה כמקור ל-DNA אנושי עתיק. חלק מהמקורות הללו כוללים דגימות שהשתמרו באופן טבעי, למשל מומיות שהשתמרו בקרח, כגון אצי - איש הקרח,[60] או מומיות שנשמרו ביובש, כמו מומיות הנמצאות בגובה רב בהרי האנדים.[61][62] כמו כן, נעשה גם שימוש ברקמות שהשתמרו באופן מלאכותי, למשל במומיות שנחנטו במצרים העתיקה.[63]

הערות שוליים

  1. ^ 1 2 Ancient DNA - an overview | ScienceDirect Topics, www.sciencedirect.com
  2. ^ Eske Willerslev, Alan Cooper, Ancient DNA, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 272, 2005-01-07, עמ' 3–16 doi: 10.1098/rspb.2004.2813
  3. ^ 1 2 3 Morten E. Allentoft, Matthew Collins, David Harker, James Haile, The half-life of DNA in bone: measuring decay kinetics in 158 dated fossils, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 279, 2012-12-07, עמ' 4724–4733 doi: 10.1098/rspb.2012.1745
  4. ^ 1 2 Eske Willerslev, Anders J. Hansen, Regin Rønn, Tina B. Brand, Long-term persistence of bacterial DNA, Current Biology 14, 2004-01-06, עמ' R9–R10 doi: 10.1016/j.cub.2003.12.012
  5. ^ 1 2 "DNA sequences from the quagga, an extinct member of the horse family". Nature. 312 (5991): 282–4. 1984. Bibcode:1984Natur.312..282H. doi:10.1038/312282a0. PMID 6504142.
  6. ^ "Preservation of DNA in ancient Egyptian mummies". J. Archaeol. Sci. 12 (6): 411–17. 1985a. doi:10.1016/0305-4403(85)90002-0.
  7. ^ "Molecular cloning of Ancient Egyptian mummy DNA". Nature. 314 (6012): 644–5. 1985b. Bibcode:1985Natur.314..644P. doi:10.1038/314644a0. PMID 3990798.
  8. ^ "Molecular genetic investigations of ancient human remains". Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 51 (Pt 1): 441–6. 1986. doi:10.1101/SQB.1986.051.01.053. PMID 3107879.
  9. ^ "Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction". Methods in Enzymology. 155: 335–50. 1987. doi:10.1016/0076-6879(87)55023-6. ISBN 978-0-12-182056-5. PMID 3431465.
  10. ^ "Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase". Science. 239 (4839): 487–91. בינואר 1988. Bibcode:1988Sci...239..487S. doi:10.1126/science.239.4839.487. PMID 2448875. {{cite journal}}: (עזרה); Invalid |display-authors=6 (עזרה)
  11. ^ "Recovery of antediluvian DNA". Nature. 365 (6448): 700. באוקטובר 1993. Bibcode:1993Natur.365..700L. doi:10.1038/365700a0. PMID 8413647. {{cite journal}}: (עזרה)
  12. ^ "Isolation and partial characterisation of DNA from the bee Problebeia dominicana (Apidae:Hymenoptera) in 25–40 million year old amber". Med Sci Res. 20: 249–51. 1992a.
  13. ^ "Enzymatic amplification and nucleotide sequencing of portions of the 18S rRNA gene of the bee Problebeia dominicana (Apidae:Hymenoptera) isolated from 25–40 million year old Dominican amber". Med Sci Res. 20: 619–22. 1992b.
  14. ^ "Extracting DNA from the gut microbes of the termite (Zootermopsis nevadensis)". Journal of Visualized Experiments (4): 195. 2007. doi:10.3791/195. PMC 2556161. PMID 18979000.
  15. ^ "Very old DNA". Current Opinion in Genetics & Development. 4 (6): 810–5. בדצמבר 1994. doi:10.1016/0959-437x(94)90064-7. PMID 7888749. {{cite journal}}: (עזרה)
  16. ^ "Very old DNA". Current Opinion in Genetics & Development. 4 (6): 810–5. בדצמבר 1994. doi:10.1016/0959-437x(94)90064-7. PMID 7888749. {{cite journal}}: (עזרה)
  17. ^ "Bacillus DNA in fossil bees: an ancient symbiosis?". Applied and Environmental Microbiology. 60 (6): 2164–2167. ביוני 1994. doi:10.1128/aem.60.6.2164-2167.1994. PMC 201618. PMID 8031102. {{cite journal}}: (עזרה)
  18. ^ "Amplification and sequencing of DNA from a 120-135-million-year-old weevil". Nature. 363 (6429): 536–538. ביוני 1993. doi:10.1038/363536a0. PMID 8505978. {{cite journal}}: (עזרה)
  19. ^ "Amplification and analysis of Miocene plant fossil DNA". Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences. 333 (1268): 419–26, discussion 426–7. בספטמבר 1991. doi:10.1098/rstb.1991.0092. PMID 1684052. {{cite journal}}: (עזרה)
  20. ^ "Chloroplast DNA sequence from a miocene Magnolia species". Nature. 344 (6267): 656–8. באפריל 1990. Bibcode:1990Natur.344..656G. doi:10.1038/344656a0. PMID 2325772. {{cite journal}}: (עזרה)
  21. ^ "DNA sequence from Cretaceous period bone fragments". Science. 266 (5188): 1229–32. בנובמבר 1994. Bibcode:1994Sci...266.1229W. doi:10.1126/science.7973705. PMID 7973705. {{cite journal}}: (עזרה)
  22. ^ "Molecular cloning and sequencing of the 18S rDNA from specialized dinosaur egg fossil found in Xixia Henan, China". Acta Sci Nat Univ Pekinensis. 31: 140–47. 1995.
  23. ^ "DNA isolation and sequence analysis of dinosaur DNA from Cretaceous dinosaur egg in Xixia Henan, China". Acta Sci Nat Univ Pekinensis. 31: 148–52. 1995.
  24. ^ "Isolation of a 250 million-year-old halotolerant bacterium from a primary salt crystal". Nature. 407 (6806): 897–900. באוקטובר 2000. Bibcode:2000Natur.407..897V. doi:10.1038/35038060. PMID 11057666. {{cite journal}}: (עזרה)
  25. ^ "Recovery of 16S ribosomal RNA gene fragments from ancient halite". Nature. 417 (6887): 432–6. במאי 2002. Bibcode:2002Natur.417..432F. doi:10.1038/417432a. PMID 12024211. {{cite journal}}: (עזרה)
  26. ^ 1 2 "Genetic analyses from ancient DNA" (PDF). Annual Review of Genetics. 38 (1): 645–79. 2004. doi:10.1146/annurev.genet.37.110801.143214. PMID 15568989. אורכב מ-המקור (PDF) ב-17 בדצמבר 2008. {{cite journal}}: (עזרה); Invalid |display-authors=6 (עזרה)
  27. ^ "Novel high-resolution characterization of ancient DNA reveals C > U-type base modification events as the sole cause of post mortem miscoding lesions". Nucleic Acids Research. 35 (17): 5717–28. 2007. doi:10.1093/nar/gkm588. PMC 2034480. PMID 17715147.
  28. ^ "New insights on single-stranded versus double-stranded DNA library preparation for ancient DNA". BioTechniques. 59 (6): 368–71. בדצמבר 2015. doi:10.2144/000114364. PMID 26651516. {{cite journal}}: (עזרה); Invalid |display-authors=6 (עזרה)
  29. ^ "Library construction for ancient genomics: single strand or double strand?". BioTechniques. 56 (6): 289–90, 292–6, 298, passim. ביוני 2014. doi:10.2144/000114176. PMID 24924389. {{cite journal}}: (עזרה)
  30. ^ "Ancient DNA comes of age". PLOS Biology. 3 (2): e56. בפברואר 2005. doi:10.1371/journal.pbio.0030056. PMC 548952. PMID 15719062. {{cite journal}}: (עזרה)
  31. ^ Martin B. Hebsgaard, Matthew J. Phillips, Eske Willerslev, Geologically ancient DNA: fact or artefact?, Trends in Microbiology 13, 2005-05-01, עמ' 212–220 doi: 10.1016/j.tim.2005.03.010
  32. ^ Anders J Hansen, David L Mitchell, Carsten Wiuf, Lakshmi Paniker, Crosslinks Rather Than Strand Breaks Determine Access to Ancient DNA Sequences From Frozen Sediments, Genetics 173, 2006-06-01, עמ' 1175–1179 doi: 10.1534/genetics.106.057349
  33. ^ Mélanie Pruvost, Reinhard Schwarz, Virginia Bessa Correia, Sophie Champlot, Freshly excavated fossil bones are best for amplification of ancient DNA, Proceedings of the National Academy of Sciences 104, 2007-01-16, עמ' 739–744 doi: 10.1073/pnas.0610257104
  34. ^ Joachim Burger, Susanne Hummel, Bernd Herrmann, Winfried Henke, DNA preservation: A microsatellite-DNA study on ancient skeletal remains, ELECTROPHORESIS 20, 1999, עמ' 1722–1728 doi: 10.1002/(SICI)1522-2683(19990101)20:8<1722::AID-ELPS1722>3.0.CO;2-4
  35. ^ Marie-Theres Gansauge, Matthias Meyer, Selective enrichment of damaged DNA molecules for ancient genome sequencing, Genome Research 24, 2014-09, עמ' 1543–1549 doi: 10.1101/gr.174201.114
  36. ^ Diogo Pratas, Morteza Hosseini, Gonçalo Grilo, Armando Pinho, Metagenomic Composition Analysis of an Ancient Sequenced Polar Bear Jawbone from Svalbard, Genes 9, 2018-09-06, עמ' 445 doi: 10.3390/genes9090445
  37. ^ Montgomery Slatkin, Fernando Racimo, Ancient DNA and human history, Proceedings of the National Academy of Sciences 113, 2016-06-07, עמ' 6380–6387 doi: 10.1073/pnas.1524306113
  38. ^ Maxime Borry, Alexander Hübner, Adam B. Rohrlach, Christina Warinner, PyDamage: automated ancient damage identification and estimation for contigs in ancient DNA de novo assembly, PeerJ 9, 2021-07-27, עמ' e11845 doi: 10.7717/peerj.11845
  39. ^ "DNA phylogeny of the extinct marsupial wolf". Nature. 340 (6233): 465–7. באוגוסט 1989. Bibcode:1989Natur.340..465T. doi:10.1038/340465a0. PMID 2755507. {{cite journal}}: (עזרה)
  40. ^ "Ancient bone DNA amplified". Nature. 342 (6249): 485. בנובמבר 1989. Bibcode:1989Natur.342..485H. doi:10.1038/342485a0. PMID 2586623. {{cite journal}}: (עזרה)
  41. ^ "Independent origins of New Zealand moas and kiwis". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 89 (18): 8741–4. בספטמבר 1992. Bibcode:1992PNAS...89.8741C. doi:10.1073/pnas.89.18.8741. PMC 49996. PMID 1528888. {{cite journal}}: (עזרה)
  42. ^ "DNA from ancient mammoth bones". Nature. 370 (6488): 333–4. באוגוסט 1994. Bibcode:1994Natur.370R.333H. doi:10.1038/370333b0. PMID 8047136. {{cite journal}}: (עזרה)
  43. ^ "Tracking the origins of the cave bear (Ursus spelaeus) by mitochondrial DNA sequencing". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (25): 12336–40. בדצמבר 1994. Bibcode:1994PNAS...9112336H. doi:10.1073/pnas.91.25.12336. PMC 45432. PMID 7991628. {{cite journal}}: (עזרה)
  44. ^ "Molecular coproscopy: dung and diet of the extinct ground sloth Nothrotheriops shastensis". Science. 281 (5375): 402–6. ביולי 1998. Bibcode:1998Sci...281..402P. doi:10.1126/science.281.5375.402. PMID 9665881. {{cite journal}}: (עזרה); Invalid |display-authors=6 (עזרה)
  45. ^ "A molecular analysis of ground sloth diet through the last glaciation". Molecular Ecology. 9 (12): 1975–84. בדצמבר 2000. doi:10.1046/j.1365-294X.2000.01106.x. PMID 11123610. {{cite journal}}: (עזרה)
  46. ^ "Methods for the recovery of mitochondrial DNA sequences from museum specimens of myiasis-causing flies". Medical and Veterinary Entomology. 16 (1): 39–45. במרץ 2002. doi:10.1046/j.0269-283x.2002.00336.x. PMID 11963980. {{cite journal}}: (עזרה)
  47. ^ "Molecular analysis of an 11,700-year-old rodent midden from the Atacama Desert, Chile". Molecular Ecology. 11 (5): 913–24. במאי 2002. doi:10.1046/j.1365-294X.2002.01492.x. PMID 11975707. {{cite journal}}: (עזרה)
  48. ^ "Evolution of maize inferred from sequence diversity of an Adh2 gene segment from archaeological specimens". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 90 (5): 1997–2001. במרץ 1993. Bibcode:1993PNAS...90.1997G. doi:10.1073/pnas.90.5.1997. PMC 46007. PMID 8446621. {{cite journal}}: (עזרה)
  49. ^ "Amplification of oak DNA from ancient and modern wood". Molecular Ecology. 8 (12): 2137–40. בדצמבר 1999. doi:10.1046/j.1365-294x.1999.00788.x. PMID 10632865. {{cite journal}}: (עזרה)
  50. ^ "Ancient DNA". Proceedings. Biological Sciences. 272 (1558): 3–16. בינואר 2005. doi:10.1098/rspb.2004.2813. PMC 1634942. PMID 15875564. {{cite journal}}: (עזרה)
  51. ^ Erika Check Hayden (26 ביוני 2013). "First horses arose 4 million years ago". Nature. doi:10.1038/nature.2013.13261. {{cite news}}: (עזרה)
  52. ^ "World's Oldest Genome Sequenced From 700,000-Year-Old Horse DNA". National Geographic. 7 בנובמבר 2017. {{cite web}}: (עזרה)
  53. ^ "Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse". Nature. 499 (7456): 74–8. ביולי 2013. Bibcode:2013Natur.499...74O. doi:10.1038/nature12323. PMID 23803765. {{cite journal}}: (עזרה); Invalid |display-authors=6 (עזרה)
  54. ^ "Complete mitochondrial genome sequence of a Middle Pleistocene cave bear reconstructed from ultrashort DNA fragments". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110 (39): 15758–63. בספטמבר 2013. Bibcode:2013PNAS..11015758D. doi:10.1073/pnas.1314445110. PMC 3785785. PMID 24019490. {{cite journal}}: (עזרה); Invalid |display-authors=6 (עזרה)
  55. ^ "World's oldest DNA sequenced from a mammoth that lived more than a million years ago". CNN News. 17 בפברואר 2021. נבדק ב-17 בפברואר 2021. {{cite news}}: (עזרה)
  56. ^ "Million-year-old mammoth genomes shatter record for oldest ancient DNA". Nature. 590 (7847): 537–538. בפברואר 2021. doi:10.1038/d41586-021-00436-x. PMID 33597786. {{cite journal}}: (עזרה)
  57. ^ "Fossil DNA persistence and decay in marine sediment over hundred-thousand-year to million-year time scales". Geology (באנגלית). 44 (8): 615–18. 2016-07-08. Bibcode:2016Geo....44..615K. doi:10.1130/g37933.1. ISSN 0091-7613.
  58. ^ "Fossil DNA persistence and decay in marine sediment over hundred-thousand-year to million-year time scales". Geology (באנגלית). 44 (8): 615–18. 2016-07-08. Bibcode:2016Geo....44..615K. doi:10.1130/g37933.1. ISSN 0091-7613.
  59. ^ Henryk Jurasz, Tomasz Pawłowski, Karol Perlejewski, Contamination Issue in Viral Metagenomics: Problems, Solutions, and Clinical Perspectives, Frontiers in Microbiology 12, 2021, עמ' 3037 doi: 10.3389/fmicb.2021.745076
  60. ^ Kay Prüfer, Cosimo Posth, He Yu, Alexander Stoessel, A genome sequence from a modern human skull over 45,000 years old from Zlatý kůň in Czechia, Nature Ecology & Evolution 5, 2021-06, עמ' 820–825 doi: 10.1038/s41559-021-01443-x
  61. ^ S. Paabo, Molecular Genetic Investigations of Ancient Human Remains, Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology 51, 1986-01-01, עמ' 441–446 doi: 10.1101/SQB.1986.051.01.053
  62. ^ Rafael Montiel, Assumpcio Malgosa, Paolo Francalacci, Authenticating Ancient Human Mitochondrial DNA, Human Biology 73, 2001, עמ' 689–713 doi: 10.1353/hub.2001.0069
  63. ^ Catherine Hänni, Vincent Laudet, Jean Coll, Dominique Stehelin, An Unusual Mitochondrial DNA Sequence Variant from an Egyptian Mummy, Genomics 22, 1994-07, עמ' 487–489 doi: 10.1006/geno.1994.1417
אוחזר מתוך "https://he.wikipedia.org/w/index.php?title=DNA_עתיק&oldid=32759486"