לאחר שחרורו מצה"ל, מונה על ידי המשרד להגנת הסביבה לרכז את תחום הטיפול בחומרים מסוכנים. ב-1996 מונה למנכ"ל המשרד לאיכות הסביבה, תחת ניהולו של השר יוסי שריד. ב-1997 מונה לראש המינהלה לאיחוד רשות שמורות הטבע ורשות הגנים הלאומיים, ובאפריל 1998 מונה למנכ"ל הראשון של הרשות לשמירת הטבע והגנים הלאומיים. הוא כיהן בתפקיד עד 2002, עת אולץ לעזוב את תפקידו בשל אי הסכמות עם השר להגנת הסביבה, צחי הנגבי. בתפקידו האחרון הקים את יחידת ביטחון המים ברשות המים. מאוחר יותר התגאה הנגבי, שהוא זה שהביא לפיטוריו של ורדי, על רקע סירובו של ורדי להחזיר לרשות הטבע והגנים חבר מרכז ליכוד[4]. ב-2010 שימש ורדי כעד תביעה במשפטו של הנגבי בעניין מינויים פוליטיים במשרד ובעדות שקר לשופט חשין[4].
משנת 2017 מוביל מטעם עמותת גולני, את שיקומו וחידושו של אתר ההנצחה והמורשת בתל פאחר - מצפה גולני, שהוכרז כאתר מרכזי של חטיבת גולני למלחמת ששת הימים.