מיקרוביולוגיה קלינית – הבדלי גרסאות

מתוך ויקיפדיה, האנציקלופדיה החופשית
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
יצירה באמצעות תרגום הדף "Medical microbiology"
תגית: [mw:Help:Extension:ContentTranslation/he תרגום תוכן]
יצירה באמצעות תרגום הדף "Medical microbiology"
תגית: [mw:Help:Extension:ContentTranslation/he תרגום תוכן]
שורה 1: שורה 1:
[[קובץ:Manusingmicroscope.jpg|שמאל|ממוזער| מיקרוביולוג בודק תרביות מתכת למיקוסקופ]]
[[קובץ:Manusingmicroscope.jpg|שמאל|ממוזער| מיקרוביולוג בודק תרביות מתחת למיקרוסקופ]]
'''מיקרוביולוגיה קלינית '''היא ענף של [[רפואה|מדע הרפואה]] העוסקת במניעה, אבחון וטיפול [[זיהום (רפואה)|במחלות זיהומיות]]. בנוסף לכך,  תחום זה של מדע עוסק במחקרים קליניים שונים יישומים של חיידקים על שיפור הבריאות. ישנם ארבעה סוגים של [[מיקרואורגניזם|מיקרואורגניזמים]] הגורמים מחלות זיהומיות: [[חיידקים]], [[פטריות]], [[טפילות|טפילים]] וכל [[נגיף|וירוסים]], סוג אחד של מדבקות חלבון בשם [[פריון (חלבון)|פריאון]].
'''מיקרוביולוגיה קלינית '''היא ענף של [[רפואה|מדע הרפואה]] העוסקת במניעה, אבחון וטיפול [[זיהום (רפואה)|במחלות זיהומיות]]. בנוסף לכך,  תחום זה של מדע עוסק במחקרים קליניים שונים יישומים של חיידקים על שיפור הבריאות. קיימים ארבעה סוגים של [[מיקרואורגניזם|מיקרואורגניזמים]] הגורמים למחלות זיהומיות (פתוגנים): [[חיידקים]], [[פטריות]], [[טפילות|טפילים]] ונגיפים, קיים סוג אחד של הדבקות מחלבון בשם [[פריון (חלבון)|פריון]].


מיקרוביולוג קליני (microbiologist ) חוקר את המאפיינים של [[פתוגניות|פתוגנים]], את מנגנוני ההעברה וההדבקות, מנגנונים של זיהום וצמיחה.<ref>http://jcm.asm.org/content/48/10/3465.full.pdf</ref> באמצעות מידע זה, ניתן להגיש את הטיפול המתאים. מיקרוביולוגים קליניים משמשים לעתים קרובות  כיועצים ל[[רופא|רופאים]], במתן זיהוי של פתוגנים והצעות לאפשרויות הטיפול.
פעילויות אחרות עשויות לכלול זיהוי של פוטנציאלי של סיכונים בריאותיים לקהילה או לניטור התפתחות פוטנציאלית של מחוללי מחלות מתפרצות חדשות או התפתחות של זנים עמידים של פתוגנים, לעסוק בהסברה וחינוך של הקהילה ולסייע בפיתוח פרקטיקות רפואיות. הם עשויים לסייע גם במניעת או בקרה של מגיפות והתפרצויות של מחלות.
לא כל המיקרוביולוגים הקליניים חוקרים חיידקים [[פתולוגיה|פתוגניים]]; יש בינהם העוסקים בחקר זני חיידקים ללא-פתוגניים במגמה ללמוד על המאפיינים שלהם, כדי ללמוד על דרכים לפיתוח [[אנטיביוטיקה]] או שיטות טיפול אחרות.

בעוד ש[[אפידמיולוגיה]] עוסקת בחקר דפוסים, גורמים והשפעות של [[בריאות]] ושל [[מחלה|מחלות]] באוכלוסיות, רפואי מיקרוביולוגיה מתמקד בעיקר את הנוכחות ואת הצמיחה של זיהומים מיקרוביאלית של יחידים, ההשפעות שלהם על הגוף האנושי, שיטות טיפול אלו זיהומים.

== היסטוריה ==
[[קובץ:Anthonie_van_Leeuwenhoek_(1632-1723)._Natuurkundige_te_Delft_Rijksmuseum_SK-A-957.jpeg|שמאל|ממוזער|[[אנטוני ואן לוונהוק|אנטון ואן ליוונהוק]] היה הראשון לבחון מיקרואורגניזמים באמצעות מיקרוסקופ.]]
ב-1676, [[אנטוני ואן לוונהוק|אנטון ואן ליוונהוק]] הבחין בחיידקים ומיקרואורגניזמים אחרים, תוך שימוש ב[[מיקרוסקופ]] בעל עדשה אחת שפיתח.<ref>{{Cite journal|title=A History of the Ecological Sciences, Part 19: Leeuwenhoek's Microscopic Natural History|last=Frank N. Egerton|date=2006|journal=Bulletin of the Ecological Society of America|doi=10.1890/0012-9623(2006)87[47:AHOTES]2.0.CO;2|volume=87|pages=47}}</ref>

בשנת 1796, [[אדוארד ג'נר]] פיתח שיטה באמצעות אבעבועות של בקר   בהצלחה לחסן ילד נגד אבעבועות שחורות. עקרונות זהים משמשים גם כיום לפיתוח [[חיסון|חיסונים]].

בהמשך, בשנת 1857 [[לואי פסטר]] עיצב גם חיסונים נגד מספר מחלות כגון [[גחלת|אנתרקס]], עופות [[כולרה|כולירה]] ו - [[כלבת|נגד כלבת]] וכן [[פסטור|פיסטור]] מזון לשימור.<ref name="Brock">{{Cite book|title=Brock Biology of Microorganisms|date=2006|publisher=Pearson Education|isbn=0-321-73551-X|editor-last=Madigan M|edition=13th|page=1096|editor-last2=Martinko J}}</ref>

בשנת 1867 [[ג'וזף ליסטר|ג ' וזף ליסטר]] נחשב האב של חיטוי הניתוח. על ידי עיקור המכשירים עם מדולל [[פנול|חומצה קרבוקסילית]] ולהשתמש בו לניקוי פצעים, פוסט-אופרטיבי זיהומים היו מופחת, מה שהופך את הניתוח לבטוח יותר עבור המטופלים.

בין השנים 1876 ו 1884 [[רוברט קוך]] סיפק כמה תובנות לגבי מחלות זיהומיות. הוא היה אחד המדענים הראשונים להתמקד בידוד של חיידקים תרבות טהור. זה שהוליד את תיאוריית החיידקים, מסוים מיקרואורגניזם להיות אחראי על מחלה מסוימת. הוא פיתח סדרה של קריטריונים סביב זה, כי יש להפוך המכונה [[העיקרים של קוך|קוך הוא מעלה את ההשערה]].<ref>{{Cite book|title=Robert Koch: a life in medicine and bacteriology|last=Brock TD|date=1999|publisher=American Society of Microbiology Press|isbn=1-55581-143-4|location=Washington DC|author-link=Thomas D. Brock}}</ref>

ציון דרך משמעותי רפואי מיקרוביולוגיה היא [[צביעת גראם|גראם]]. בשנת 1884 [[הנס כריסטיאן גראם]] פיתח את שיטת צביעת חיידקים כדי להפוך אותם יותר גלוי גזיר תחת מיקרוסקופ. טכניקה זו נמצאת בשימוש נרחב היום.

בשנת 1929 [[אלכסנדר פלמינג]] פיתח הנפוץ ביותר בשימוש אנטיביוטי חומר שניהם באותו זמן ועכשיו: [[פניצילין]].

[[ריצוף DNA|רצפי DNA]], שיטה שפותחה על ידי [[וולטר גילברט]] ו [[פרדריק סנגר|פרדריק סאנגר]] בשנת 1977,<ref>Sanger F, Nicklen S, Coulson AR (1977) DNA sequencing with chain-terminating inhibitors" ''Proceedings of the National Academy of Sciences'' 74:5463-5467.</ref> גרם שינוי מהיר פיתוח של [[חיסון|חיסונים]], טיפולים רפואיים, אבחון שיטות. חלקם של אלה כוללים סינטטי [[אינסולין]] שהופק ב-1979 באמצעות [[DNA רקומביננטי|דנ א רקומביננטי]] הראשון מהונדס גנטית החיסון נוצר בשנת 1986 על [[הפטיטיס B (מחלה)|הפטיטיס B]].

ב-1995. צוות המכון על גנומית מחקר רצף הראשון חיידקי [[גנום|הגנום]]; ''המופילוס אינפלואנזה''.<ref>Fleischmann R, Adams M, White O, Clayton R, Kirkness E, Kerlavage A, Bult C, Tomb J, Dougherty B, Merrick J, al. e (1995) Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd" ''Science'' 269:496-512.</ref> מספר חודשים מאוחר יותר, הראשון [[איקריוטים|איקריוטית]] הגנום הושלמה. זה חשוב לאין שיעור על טכניקות אבחון.<ref>Prescott LM, Harley JP, Klein DA (2005) Microbiology: McGraw-Hill Higher Education.</ref>

== בדרך כלל מטופלים מחלות זיהומיות ==

=== חיידקי ===
* גרון Streptococcal<ref name="Shaikh">{{Cite journal|url=http://pediatrics.aappublications.org/content/126/3/e557.abstract|title=Prevalence of streptococcal pharyngitis and streptococcal carriage in children: a meta-analysis|last=Shaikh N|last2=Leonard E|date=September 2010|journal=Pediatrics|issue=3|doi=10.1542/peds.2009-2648|volume=126|pages=557–564|pmid=20696723|last3=Martin JM}}</ref>
* [[כלמידיה]]<ref name="Vos">{{Cite journal|url=http://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736%2812%2961729-2/abstract|title=Years lived with disability (YLDs) for 1160 sequelae of 289 diseases and injuries 1990–2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010|last=Vos T|date=December 2012|journal=Lancet|doi=10.1016/S0140-6736(12)61729-2|volume=380|pages=2163–96|pmid=23245607|displayauthors=etal}}</ref>
* [[טיפואיד (מחלה)|טיפואיד]]<ref name="who">{{Cite web|url=http://www.who.int/vaccine_research/diseases/diarrhoeal/en/index7.html|title=Typhoid Fever|accessdate=2013-04-25|publisher=World Health Organization}}</ref>
* [[שחפת]]

=== ויראלי ===
* [[Rotavirus|בנגיף]]<ref name="pmid22789574">{{Cite journal|title=Rotavirus infection: an update on management and prevention|last=Dennehy PH|date=2012|journal=Advances in Pediatrics|issue=1|doi=10.1016/j.yapd.2012.04.002|volume=59|pages=47–74|pmid=22789574}}</ref>
* [[הפטיטיס C]]<ref name="who1">{{Cite web|url=http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs164/en/index.html|title=Hepatitis C|accessdate=2013-04-25|publisher=World Health Organization}}</ref>
* [[נגיף הפפילומה האנושי]] (HPV)<ref name="Dunne">{{Cite journal|title=Prevalence of HPV infection among females in the United States|last=Dunne EF|last2=Unger ER|date=February 2007|journal=Journal of the American Medical Association|issue=8|doi=10.1001/jama.297.8.813|volume=297|pages=813–9|pmid=17327523|last3=Sternberg, M}}</ref>

=== טפילי. ===
* [[מלריה]]<ref name="who2">{{Cite web|url=http://www.who.int/gho/publications/world_health_statistics/2012/en/index.html|title=World Health Statistics 2012|accessdate=2013-04-25|publisher=World Health Organization}}</ref>
* ''[[Giardia lamblia|ג ' יארדיה לאמבליה פוגע בלא מעט]]''<ref name="Kappus">{{Cite journal|title=Intestinal parasitism in the United States: update on a continuing problem|last=Kappus KD|last2=Lundgren RG, Jr.|date=June 1994|journal=American Society of Tropical Medicine and Hygiene|issue=6|volume=50|pages=705–13|pmid=8024063|last3=Juranek DD|last4=Roberts JM|last5=Spencer HC|displayauthors=4}}</ref>
* ''Toxoplasma gondii''<ref name="cdc1">{{Cite web|url=http://www.cdc.gov/parasites/toxoplasmosis/|title=Toxoplasmosis|accessdate=2013-04-25|publisher=Centers for Disease Control and Prevention}}</ref>

=== פטרייתיים ===
* [[Candida|קנדידה]]'''<ref name="cdc2">{{Cite web|url=http://www.cdc.gov/fungal/candidiasis/genital/statistics.html|title=Candidiasis|accessdate=2013-04-25|publisher=Centers for Disease Control and Prevention}}</ref>'''
* Histoplasmosis<ref name="cdc3">{{Cite web|url=http://www.cdc.gov/fungal/histoplasmosis/statistics.html|title=Histoplasmosis|accessdate=2013-04-25|publisher=Centers for Disease Control and Prevention}}</ref>

== גורם והעברה של מחלות זיהומיות ==
זיהומים עלולים להיגרם על ידי [[חיידקים]], [[נגיף|וירוסים]], [[פטריות]], [[טפילות|טפילים]]. את חיידק זה גורם המחלה יכול להיות אקסוגני (נרכש ממקור חיצוני; איכות הסביבה, בעלי חיים או אנשים אחרים, למשל [[שפעת]]) או אנדוגני (מ פלורה נורמלית למשל [[קנדידיאזיס|קנדידה]]).<ref name="Baron">{{Cite book|title=Medical Microbiology|last=Washington|first=JA|date=1996|publisher=University of Texas Medical Branch at Galveston|isbn=0-9631172-1-1|editor-last=Baron|editor-first=S|edition=4th|chapter=10 Principles of Diagnosis|chapter-url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK8014/}}</ref>

האתר שבו החיידק נכנס לגוף המכונה פורטל הכניסה.<ref name="Bittar">{{Cite book|title=Microbiology|last=Siebeling|first=RJ|date=1998|publisher=Elsevier|isbn=1-55938-814-5|editor-last=Bittar, Neville|editor-first=E, B|page=87|chapter=Chapter 7 Principles of bacterial pathogenesis}}</ref> אלה כוללים את מערכת הנשימה, העיכול, בדרכי המין והשתן, [[עור|העור]], [[קרום רירי|הקרומים הריריים]].<ref name="Rhinehart">{{Cite book|title=Infection control in home care|last=Rhinehart E|last2=Friedman M|date=1999|publisher=Jones & Bartlett Learning|isbn=0-8342-1143-2|page=11}}</ref> שער הכניסה עבור מסוימת חיידק זה בדרך כלל תלוי איך הוא נוסע מן הגידול הטבעי שלה כדי המארח.

יש דרכים שונות בהן המחלה יכול להיות מועבר בין אנשים.
אלה כוללים:
* קשר ישיר נוגע המארח נגוע, כולל מגע מיני
* מגע עקיף - נוגע משטח מזוהמים
* רביב צור - שיעול או התעטשות
* [[מחזור צואה-פה|בצואה אורלי נתיב]] . צורכים מזון מזוהם או מים מקורות
* נגיף הנישא באוויר - פתוגן נושא [[נבג|נבגים]]
* [[וקטור (ביולוגיה)|וקטור השידור]] - אורגניזם אינו גורם המחלה עצמה, אלא מעבירה את הזיהום על ידי מעבירי פתוגנים ממחשב מארח אחד לשני
* Fomite השידור - חפץ דומם, או חומר המסוגל לשאת זיהומיות חיידקים או טפילים
* איכות הסביבה - רכשה החולים זיהום ([[זיהום נוזוקומי|Nosocomial זיהומים]])
כמו פתוגנים אחרים, וירוסים להשתמש בשיטות אלו של שידור כדי להזין את הגוף, אך וירוסים שונים כי הם חייבים גם להיכנס לתוך המארח האמיתי של תאים. ברגע שהווירוס צברה גישה המארח של תאים, הוירוס חומר גנטי ([[RNA]] או [[DNA]]) חייב להיות הציג את התא. שכפול בין וירוסים היא מאוד מגוונת, תלוי בסוג של גנים המעורבים בהן. רוב הדנ " א של וירוסים להרכיב בגרעין בעוד רוב RNA וירוסים לפתח אך ורק בתוך הציטופלסמה.<ref>Roberts RJ, "Fish pathology, 3rd Edition" ,Elsevier Health Sciences, 2001.</ref><ref name="Baron1">{{Cite book|title=Medical Microbiology|last=Roizman|first=B|date=1996|publisher=University of Texas Medical Branch at Galveston|isbn=0-9631172-1-1|editor-last=Baron|editor-first=S|edition=4th|chapter=42 Multiplication|chapter-url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK8181/}}</ref>

מנגנוני זיהום, התפשטות, והתמדה של הנגיף בתאים של המארח הן קריטיות לקיומו. לדוגמה, כמה מחלות כגון [[חצבת]] להעסיק אסטרטגיה לפיו חייב להתפשט סדרה של המארחים. אלה צורות של זיהום ויראלי, המחלה היא לעתים קרובות מטופלים על ידי [[חסינות תאית|הגוף עצמו התגובה החיסונית]], ולכן הוירוס לפזר לניו המארחים לפני זה הוא נהרס על ידי [[מערכת החיסון|אימונולוגי התנגדות]] מארח או מוות.<ref name="Hilleman">{{Cite journal|title=Strategies and mechanisms for host and pathogen survival in acute and persistent viral infections|last=Hilleman M|date=October 2004|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|doi=10.1073/pnas.0404758101|volume=101|pages=14560–14566|pmc=521982|pmid=15297608}}</ref> לעומת זאת, כמה מדבקים כגון חתולים וירוס לוקמיה, הם מסוגלים לשאת את התגובה החיסונית, והם מסוגלים להשיג לטווח ארוך מגורים בתוך אדם המארח, גם תוך שמירה על היכולת להפיץ רצופים המארחים.<ref name="Greggs">{{Cite journal|url=http://jgv.sgmjournals.org/content/93/Pt_4/900.full|title=Discovery of drugs that possess activity against feline leukemia virus|last=Greggs WM|last2=Clouser CL|date=April 2012|journal=Journal of General Virology|issue=4|doi=10.1099/vir.0.039909-0|volume=93|pages=900–905|last3=Patterson SE|last4=Manksy LM}}</ref>

== בדיקות אבחון ==
זיהוי של הסוכן זיהומיות עבור קטין המחלה יכול להיות פשוט כמו המצגת קליניים; כגון מחלות במערכת העיכול , דלקות עור. על מנת לבצע משכיל הערכה לגבי איזה חיידק יכול להיות גורם המחלה, אפידמיולוגיים גורמים צריכים להילקח בחשבון; כגון של החולה הסבירות של חשיפה חשד האורגניזם ואת הנוכחות, השכיחות של חיידקים זן בקהילה.

אבחון של מחלות זיהומיות כמעט תמיד ביוזמת הייעוץ של המטופל, היסטוריה רפואית וביצוע בדיקה גופנית. יותר מפורט זיהוי טכניקות לערב חיידקים תרבות, מיקרוסקופ, [[זיהום (רפואה)|בדיקות ביוכימיות]] ו genotyping. אחרים פחות טכניקות נפוצות (כגון [[קרני רנטגן|צילומי רנטגן]], [[טומוגרפיה ממוחשבת|סריקות]], [[טומוגרפיית פליטת פוזיטרונים|סריקות PET]] או [[תהודה מגנטית גרעינית|תמ " ג]]) משמשים כדי ליצור תמונות פנימיות חריגות הנובעות הצמיחה של הסוכן זיהומיות.

=== התרבות חיידקים ===
[[קובץ:K_pneumoniae_M_morganii_providencia_styphimuriuma.JPG|ממוזער|218x218 פיקסלים|ארבע אגר מזין צלחות גידול מושבות משותפת של [[חיידקים גראם-שליליים|גרם שליליים]] חיידקים.]]
מיקרוביולוגית תרבות היא השיטה העיקרית המשמשת מבודד למחלות זיהומיות למחקר במעבדה. רקמה או נוזל. הדגימות נבדקו לנוכחות של אדם ספציפי [[פתוגניות|למחלה]], אשר נקבע על ידי צמיחה סלקטיבית או דיפרנציאלי בינוני.

3 סוגים עיקריים של מדיה משמשים לבדיקה הם:<ref name="Nester">{{Cite book|title=Microbiology: A human perspective|last=Nester E|last2=Anderson D|last3=Evans Roberts, C|last4=Nester M|date=2009|publisher=McGraw Hill|isbn=1-55938-814-5|pages=336–337}}</ref>
* מוצק תרבות: משטח יציב נוצר באמצעות תערובת של חומרים מזינים, מלחי [[אגר]]. בודד חיידק על צלחת אגר אז יכול לצמוח לתוך מושבות (שיבוטים שבו תאים זהים אחד לשני) המכיל אלפי תאים. אלה משמשים בעיקר כדי התרבות חיידקים ופטריות.
* נוזל תרבות: התאים גדלים בתוך נוזלי מדיה. צמיחה מיקרוביאלית נקבע על-ידי הזמן לקחת את נוזלי כדי ליצור [[קולואיד|colloidal השעיה]]. טכניקה זו משמשת לאבחון טפילים וזיהוי mycobacteria.<ref name="Møller">{{cite journal|title=Safe inoculation of blood and bone marrow for liquid culture detection of mycobacteria|date=November 2004|journal=Occupational Medicine|issue=8|doi=10.1093/occmed/kqh106|volume=54|pages=530–3|pmid=15520021|author=Møller M|author2=El Maghrabi R|author3=Olesen N|author4=Thomsen VØ}}</ref>
* תרבית תאים: אדם או חיה [[תרבית תאים|תרביות תאים]] נגועים עם חיידק של עניין. תרבויות אלה הם מכן נצפתה כדי לקבוע את ההשפעה של חיידק יש את התאים. טכניקה זו משמשת לזיהוי וירוסים.

=== מיקרוסקופ ===
תרבות טכניקות לעתים קרובות להשתמש בבדיקה מיקרוסקופית כדי לעזור בזיהוי של החיידק. מכשירים כגון [[מיקרוסקופ|מתחם אור מיקרוסקופים]] יכול לשמש כדי להעריך היבטים קריטיים של האורגניזם. זה יכול להתבצע מיד לאחר המדגם נלקח מן המטופל, והוא משמש בשילוב עם ביו-צביעת טכניקות, המאפשר רזולוציה של תאי תכונות. [[מיקרוסקופ אלקטרונים|אלקטרונים מיקרוסקופים]] ו פלואורסצנטי מיקרוסקופים משמשים גם התבוננות חיידקים בפירוט רב יותר על מחקר.<ref>Madigan MT (2009) Brock Biology of Microorganisms: Pearson/Benjamin Cummings.</ref>

=== בדיקות ביוכימיות ===
מהר יחסית פשוטה [[זיהום (רפואה)|בדיקות ביוכימיות]] יכול לשמש כדי לזהות מדבקים. חיידקים זיהוי, השימוש [[מטבוליזם|מטבולית]] או אנזימטי מאפיינים נפוצים בשל היכולת שלהם להתסיס [[פחמימה|פחמימות]] בדפוסים אופייניים שלהם [[סוג (טקסונומיה)|הסוג]] ואת [[מין (טקסונומיה)|המינים]]. חומצות, אלכוהול וגזים הם בדרך כלל מזוהה המבחנים האלה כאשר חיידקים גדלים סלקטיבי נוזלי או מוצק התקשורת, כאמור לעיל. על מנת לבצע את הבדיקות הללו בהמוניהם, מכונות אוטומטיות משמשות. מכונות אלה לבצע מספר בדיקות ביוכימיות בו זמנית, באמצעות כרטיסי עם מספר בארות המכיל שונים מיובש כימיקלים. את החיידק של עניין יגיב עם כל חומר כימי באופן ספציפי, סיוע שלה זהות.

[[סרולוגיה|סרולוגית]] השיטות מאוד רגיש, ספציפי, לעתים קרובות מאוד מהירה בדיקות מעבדה משמשים כדי לזהות סוגים שונים של מיקרואורגניזמים. הבדיקות מבוססות על היכולת של [[נוגדן|נוגדנים]] כדי לאגד במיוחד של [[אנטיגן]]. אנטיגן (בדרך כלל חלבון או פחמימות שבוצעו על-ידי הסוכן זיהומיות) מחויב על ידי נוגדנים, מה שמאפשר סוג זה של בדיקה כדי לשמש עבור אורגניזמים אחרים מאשר חיידקים. זה מחייב ואז מפעיל שרשרת של אירועים יכול להיות בקלות ומוחלט שנצפו, בהתאם מבחן. מורכב יותר סרולוגית טכניקות ידועות כמו immunoassays. באמצעות בסיס קבוע כפי שתואר לעיל, immunoassays יכול לזהות או למדוד אנטיגנים משני זיהומיות סוכנים או חלבונים שנוצרו על ידי המארח נגוע בתגובה זיהום.

=== תגובת שרשרת של פולימראז ===
[[PCR|תגובת שרשרת של פולימראז]] (PCR) מבחני הנפוץ ביותר בשימוש מולקולרית טכניקה כדי לזהות וללמוד חיידקים.<ref name="Mackay">{{Cite book|title=Real-time PCR in Microbiology: From Diagnosis to Characterisation|last=Mackay I|date=2007|publisher=Horizon Scientific Press|isbn=9781904455189|pages=1–25}}</ref> לעומת שיטות אחרות, רצף וניתוח מוחלט, אמין, מדויק ומהיר.<ref name="Viljoen">{{Cite book|title=Molecular Diagnostic PCR Handbook|date=2005|publisher=Springer|isbn=978-1-4020-3404-6|editor-last=Viljoen GJ|page=58|editor-last2=Nel LH|editor-last3=Crowther JR}}</ref> היום, [[Real Time PCR|כמותית PCR]] הוא הטכניקה העיקרית בשימוש, גם שיטה זו מספקת נתונים מהירה יותר לעומת תקן ה-PCR assay. למשל, מסורתיים טכניקות PCR דורשים את השימוש של [[אלקטרופורזה דו-ממדית בג'ל|ג ' ל אלקטרופורזה]] כדי להמחיש מוגבר מולקולות ה-DNA אחרי התגובה סיים. [[Real Time PCR|כמותית PCR]] אינו מחייב את זה, כמו מערכת זיהוי משתמש הקרינה ואת בדיקות כדי לזהות את מולקולות ה-DNA כפי שהם להיות מוגבר.<ref name="Tang">{{Cite book|title=Encyclopedia of Microbiology|last=Tang YW|last2=Persing DH|date=2009|publisher=Oxford Academic Press|isbn=978-0-12-373944-5|pages=308–320}}</ref> בנוסף לכך, [[Real Time PCR|כמותית PCR]] גם מסיר את הסיכון של זיהום זה יכול להתרחש במהלך תקן ה-PCR הליכים (נושא על PCR המוצר לתוך הבאים PCRs). יתרון נוסף של שימוש PCR כדי לזהות וללמוד חיידקים זה רצף הדנ " א של שהתגלתה זיהומיות חיידקים או זנים יכול להיות בהשוואה לאלו שכבר רשום במאגר מידע, אשר בתורו, מסייע להגדיל את ההבנה של איזה אורגניזם הגורם מחלה זיהומית, ולכן מה שיטות אפשריות של טיפול יכול להיות בשימוש. טכניקה זו היא בתקן הנוכחי לגילוי זיהומים נגיפיים כגון [[איידס]] ו - [[דלקת כבד|צהבת]].

== טיפולים ==
פעם אחת זיהום אובחן וזיהה, מתאים אפשרויות הטיפול חייב להיות מוערך על ידי רופא, יעוץ רפואי מיקרוביולוגים. זיהומים מסוימים יכולים להיות מטופל על ידי הגוף עצמו של [[מערכת החיסון|המערכת החיסונית]], אבל זיהומים קשים יותר מטופלים עם מיקרוביאלית סמים. זיהומים חיידקיים מטופלים עם [[אנטיביוטיקה|אנטיבקטריאליים]] (נקרא לעתים אנטיביוטיקה) ואילו [[פטרת|פטרייתי]] ו - ויראלי זיהומים מטופלים עם טיפול אנטי פטרייתי ו ויראליים בהתאמה. בחורה בשיעור של תרופות המכונה antiparasitics משמשים לטיפול מחלות טפיליות.

רפואי מיקרוביולוגים לעתים קרובות להפוך את המלצות הטיפול של החולה לרופא מבוסס על זן של [[מיקרואורגניזם|חיידק]] שלה [[עמידות לאנטיביוטיקה|אנטיביוטיקה ההתנגדויות]], האתר של זיהום, פוטנציאל רעילות של תרופות מיקרוביאלית וכל אלרגיות תרופה לחולה יש.
[[קובץ:Antibiotic_sensitvity_and_resistance.JPG|שמאל|ממוזער|עמידות לאנטיביוטיקה בדיקות: חיידקים בתרבות בצד שמאל רגישים לאנטיביוטיקה הכלול לבן, נייר דיסקים. חיידקים בתרבות מימין עמידים ביותר של אנטיביוטיקה.]]
בנוסף סמים להיות ספציפי לסוג מסוים של האורגניזם (חיידקים, פטריות, וכו'.), כמה תרופות ספציפיות מסוימת [[סוג (טקסונומיה)|מין]] או [[מין (טקסונומיה)|מינים]] של האורגניזם, ולא לעבוד על אורגניזמים אחרים. בגלל זה הספציפיות, רפואי מיקרוביולוגים חייב לשקול את היעילות של כמה תרופות מיקרוביאלית בעת ביצוע המלצות. בנוסף, [[זן (Strain)|זנים]] של אורגניזם יכול להיות עמידים בפני מסוים סמים או מחלקה של סמים, אפילו כאשר הוא בדרך כלל יעיל נגד המינים. זנים אלה, שכונו זנים עמידים, להציג רציני על בריאות הציבור, הדאגה של גידול חשיבות התעשייה הרפואית כמו התפשטות של [[עמידות לאנטיביוטיקה]] מחמיר. מיקרוביאלית התנגדות הוא בעייתי יותר ויותר עניין זה מוביל מיליוני מקרי מוות בכל שנה.<ref name="WHO 2014">{{Cite web|url=http://www.who.int/drugresistance/documents/surveillancereport/en/|title=Antimicrobial resistance: global report on surveillance 2014|date=April 2014|accessdate=May 9, 2015|website=WHO|publisher=WHO|last=WHO}}</ref>

תוך עמידות לתרופות כוללת בדרך כלל חיידקים כימית inactivating מיקרוביאלית סמים או תא מכנית עוצר את ספיגת התרופה, צורה נוספת של התרופה ההתנגדות יכולה לנבוע היווצרות של [[ביופילם|biofilms]]. חיידקים מסוימים מסוגלים ליצור biofilms על ידי שמירה על משטחים להתקנים מושתלים כגון קטטרים ו תותבות ויצירת [[ביופילם|מטריצה חוץ-תאית]] , עבור תאים אחרים לדבוק.<ref>Vickery K, Hu H, Jacombs AS, Bradshaw DA, Deva AK (2013) A review of bacterial biofilms and their role in device-associated infection. </ref> זה מספק אותם עם סביבה יציבה שממנו החיידקים יכולים להתפזר, להדביק חלקים אחרים של המארח. בנוסף, המטריצה החוץ-תאית צפופה השכבה החיצונית של תאים חיידקיים יכולים להגן הפנימי חיידקים מתאי תרופות מיקרוביאלית.<ref>{{Cite journal|title=Antibiotic resistance of bacteria in biofilms|last=Stewart PS|last2=Costerton JW|date=July 2001|journal=Lancet|issue=9276|doi=10.1016/S0140-6736(01)05321-1|volume=358|pages=135–8|pmid=11463434}}</ref>

רפואי מיקרוביולוגיה היא לא רק על אבחון וטיפול במחלה, זה כרוך גם המחקר של חיידקים מועילים. חיידקים הוכחו להיות מועיל במאבק נגד מחלות זיהומיות, קידום בריאות. טיפולים יכולים להתפתח מחיידקים, כפי שהודגם על ידי אלכסנדר פלמינג גילוי [[פניצילין|הפניצילין]] כמו גם פיתוח חדש של אנטיביוטיקה מן חיידקי סוג Streptomyces בין רבים אחרים.<ref>Taguchi T, Yabe M, Odaki H, Shinozaki M, Metsä-Ketelä M, Arai T, Okamoto S, Ichinose K (2013) Biosynthetic Conclusions from the Functional Dissection of Oxygenases for Biosynthesis of Actinorhodin and Related Streptomyces Antibiotics. </ref> לא רק הם מיקרואורגניזמים מקור של אנטיביוטיקה אבל כמה יכול גם לפעול כמו [[פרוביוטיקה]] כדי לספק יתרונות בריאותיים המארח, כגון מתן יותר בריאות מערכת העיכול או עיכוב פתוגנים.<ref>Williams NT (2010) Probiotics. </ref>

== ראה גם ==
* הפתולוגיה הקלינית
* [[פטרת|זיהום פטרייתי]]
* [[זיהום (רפואה)|זיהום]]
* [[קבוצות אנטיביוטיקה|רשימה של אנטיביוטיקה]]
* רשימת האנושי מחלות טפיליות
* הרשימה של מחלות זיהומיות
* חיידקים פתוגניים
* מחלה ויראלית

== הערות והפניות ==
{{Reflist|30em}}
[[קטגוריה:תחומים ברפואה]]
[[קטגוריה:תחומים ברפואה]]
[[קטגוריה:מיקרוביולוגיה]]
[[קטגוריה:מיקרוביולוגיה]]

גרסה מ־11:27, 16 ביוני 2017

מיקרוביולוג בודק תרביות מתחת למיקרוסקופ

מיקרוביולוגיה קלינית היא ענף של מדע הרפואה העוסקת במניעה, אבחון וטיפול במחלות זיהומיות. בנוסף לכך,  תחום זה של מדע עוסק במחקרים קליניים שונים יישומים של חיידקים על שיפור הבריאות. קיימים ארבעה סוגים של מיקרואורגניזמים הגורמים למחלות זיהומיות (פתוגנים): חיידקים, פטריות, טפילים ונגיפים, קיים סוג אחד של הדבקות מחלבון בשם פריון.

מיקרוביולוג קליני (microbiologist ) חוקר את המאפיינים של פתוגנים, את מנגנוני ההעברה וההדבקות, מנגנונים של זיהום וצמיחה.[1] באמצעות מידע זה, ניתן להגיש את הטיפול המתאים. מיקרוביולוגים קליניים משמשים לעתים קרובות  כיועצים לרופאים, במתן זיהוי של פתוגנים והצעות לאפשרויות הטיפול. פעילויות אחרות עשויות לכלול זיהוי של פוטנציאלי של סיכונים בריאותיים לקהילה או לניטור התפתחות פוטנציאלית של מחוללי מחלות מתפרצות חדשות או התפתחות של זנים עמידים של פתוגנים, לעסוק בהסברה וחינוך של הקהילה ולסייע בפיתוח פרקטיקות רפואיות. הם עשויים לסייע גם במניעת או בקרה של מגיפות והתפרצויות של מחלות. לא כל המיקרוביולוגים הקליניים חוקרים חיידקים פתוגניים; יש בינהם העוסקים בחקר זני חיידקים ללא-פתוגניים במגמה ללמוד על המאפיינים שלהם, כדי ללמוד על דרכים לפיתוח אנטיביוטיקה או שיטות טיפול אחרות.

בעוד שאפידמיולוגיה עוסקת בחקר דפוסים, גורמים והשפעות של בריאות ושל מחלות באוכלוסיות, רפואי מיקרוביולוגיה מתמקד בעיקר את הנוכחות ואת הצמיחה של זיהומים מיקרוביאלית של יחידים, ההשפעות שלהם על הגוף האנושי, שיטות טיפול אלו זיהומים.

היסטוריה

אנטון ואן ליוונהוק היה הראשון לבחון מיקרואורגניזמים באמצעות מיקרוסקופ.

ב-1676, אנטון ואן ליוונהוק הבחין בחיידקים ומיקרואורגניזמים אחרים, תוך שימוש במיקרוסקופ בעל עדשה אחת שפיתח.[2]

בשנת 1796, אדוארד ג'נר פיתח שיטה באמצעות אבעבועות של בקר   בהצלחה לחסן ילד נגד אבעבועות שחורות. עקרונות זהים משמשים גם כיום לפיתוח חיסונים.

בהמשך, בשנת 1857 לואי פסטר עיצב גם חיסונים נגד מספר מחלות כגון אנתרקס, עופות כולירה ו - נגד כלבת וכן פיסטור מזון לשימור.[3]

בשנת 1867 ג ' וזף ליסטר נחשב האב של חיטוי הניתוח. על ידי עיקור המכשירים עם מדולל חומצה קרבוקסילית ולהשתמש בו לניקוי פצעים, פוסט-אופרטיבי זיהומים היו מופחת, מה שהופך את הניתוח לבטוח יותר עבור המטופלים.

בין השנים 1876 ו 1884 רוברט קוך סיפק כמה תובנות לגבי מחלות זיהומיות. הוא היה אחד המדענים הראשונים להתמקד בידוד של חיידקים תרבות טהור. זה שהוליד את תיאוריית החיידקים, מסוים מיקרואורגניזם להיות אחראי על מחלה מסוימת. הוא פיתח סדרה של קריטריונים סביב זה, כי יש להפוך המכונה קוך הוא מעלה את ההשערה.[4]

ציון דרך משמעותי רפואי מיקרוביולוגיה היא גראם. בשנת 1884 הנס כריסטיאן גראם פיתח את שיטת צביעת חיידקים כדי להפוך אותם יותר גלוי גזיר תחת מיקרוסקופ. טכניקה זו נמצאת בשימוש נרחב היום.

בשנת 1929 אלכסנדר פלמינג פיתח הנפוץ ביותר בשימוש אנטיביוטי חומר שניהם באותו זמן ועכשיו: פניצילין.

רצפי DNA, שיטה שפותחה על ידי וולטר גילברט ו פרדריק סאנגר בשנת 1977,[5] גרם שינוי מהיר פיתוח של חיסונים, טיפולים רפואיים, אבחון שיטות. חלקם של אלה כוללים סינטטי אינסולין שהופק ב-1979 באמצעות דנ א רקומביננטי הראשון מהונדס גנטית החיסון נוצר בשנת 1986 על הפטיטיס B.

ב-1995. צוות המכון על גנומית מחקר רצף הראשון חיידקי הגנום; המופילוס אינפלואנזה.[6] מספר חודשים מאוחר יותר, הראשון איקריוטית הגנום הושלמה. זה חשוב לאין שיעור על טכניקות אבחון.[7]

בדרך כלל מטופלים מחלות זיהומיות

חיידקי

ויראלי

טפילי.

פטרייתיים

גורם והעברה של מחלות זיהומיות

זיהומים עלולים להיגרם על ידי חיידקים, וירוסים, פטריות, טפילים. את חיידק זה גורם המחלה יכול להיות אקסוגני (נרכש ממקור חיצוני; איכות הסביבה, בעלי חיים או אנשים אחרים, למשל שפעת) או אנדוגני (מ פלורה נורמלית למשל קנדידה).[19]

האתר שבו החיידק נכנס לגוף המכונה פורטל הכניסה.[20] אלה כוללים את מערכת הנשימה, העיכול, בדרכי המין והשתן, העור, הקרומים הריריים.[21] שער הכניסה עבור מסוימת חיידק זה בדרך כלל תלוי איך הוא נוסע מן הגידול הטבעי שלה כדי המארח.

יש דרכים שונות בהן המחלה יכול להיות מועבר בין אנשים. אלה כוללים:

  • קשר ישיר נוגע המארח נגוע, כולל מגע מיני
  • מגע עקיף - נוגע משטח מזוהמים
  • רביב צור - שיעול או התעטשות
  • בצואה אורלי נתיב . צורכים מזון מזוהם או מים מקורות
  • נגיף הנישא באוויר - פתוגן נושא נבגים
  • וקטור השידור - אורגניזם אינו גורם המחלה עצמה, אלא מעבירה את הזיהום על ידי מעבירי פתוגנים ממחשב מארח אחד לשני
  • Fomite השידור - חפץ דומם, או חומר המסוגל לשאת זיהומיות חיידקים או טפילים
  • איכות הסביבה - רכשה החולים זיהום (Nosocomial זיהומים)

כמו פתוגנים אחרים, וירוסים להשתמש בשיטות אלו של שידור כדי להזין את הגוף, אך וירוסים שונים כי הם חייבים גם להיכנס לתוך המארח האמיתי של תאים. ברגע שהווירוס צברה גישה המארח של תאים, הוירוס חומר גנטי (RNA או DNA) חייב להיות הציג את התא. שכפול בין וירוסים היא מאוד מגוונת, תלוי בסוג של גנים המעורבים בהן. רוב הדנ " א של וירוסים להרכיב בגרעין בעוד רוב RNA וירוסים לפתח אך ורק בתוך הציטופלסמה.[22][23]

מנגנוני זיהום, התפשטות, והתמדה של הנגיף בתאים של המארח הן קריטיות לקיומו. לדוגמה, כמה מחלות כגון חצבת להעסיק אסטרטגיה לפיו חייב להתפשט סדרה של המארחים. אלה צורות של זיהום ויראלי, המחלה היא לעתים קרובות מטופלים על ידי הגוף עצמו התגובה החיסונית, ולכן הוירוס לפזר לניו המארחים לפני זה הוא נהרס על ידי אימונולוגי התנגדות מארח או מוות.[24] לעומת זאת, כמה מדבקים כגון חתולים וירוס לוקמיה, הם מסוגלים לשאת את התגובה החיסונית, והם מסוגלים להשיג לטווח ארוך מגורים בתוך אדם המארח, גם תוך שמירה על היכולת להפיץ רצופים המארחים.[25]

בדיקות אבחון

זיהוי של הסוכן זיהומיות עבור קטין המחלה יכול להיות פשוט כמו המצגת קליניים; כגון מחלות במערכת העיכול , דלקות עור. על מנת לבצע משכיל הערכה לגבי איזה חיידק יכול להיות גורם המחלה, אפידמיולוגיים גורמים צריכים להילקח בחשבון; כגון של החולה הסבירות של חשיפה חשד האורגניזם ואת הנוכחות, השכיחות של חיידקים זן בקהילה.

אבחון של מחלות זיהומיות כמעט תמיד ביוזמת הייעוץ של המטופל, היסטוריה רפואית וביצוע בדיקה גופנית. יותר מפורט זיהוי טכניקות לערב חיידקים תרבות, מיקרוסקופ, בדיקות ביוכימיות ו genotyping. אחרים פחות טכניקות נפוצות (כגון צילומי רנטגן, סריקות, סריקות PET או תמ " ג) משמשים כדי ליצור תמונות פנימיות חריגות הנובעות הצמיחה של הסוכן זיהומיות.

התרבות חיידקים

ארבע אגר מזין צלחות גידול מושבות משותפת של גרם שליליים חיידקים.

מיקרוביולוגית תרבות היא השיטה העיקרית המשמשת מבודד למחלות זיהומיות למחקר במעבדה. רקמה או נוזל. הדגימות נבדקו לנוכחות של אדם ספציפי למחלה, אשר נקבע על ידי צמיחה סלקטיבית או דיפרנציאלי בינוני.

3 סוגים עיקריים של מדיה משמשים לבדיקה הם:[26]

  • מוצק תרבות: משטח יציב נוצר באמצעות תערובת של חומרים מזינים, מלחי אגר. בודד חיידק על צלחת אגר אז יכול לצמוח לתוך מושבות (שיבוטים שבו תאים זהים אחד לשני) המכיל אלפי תאים. אלה משמשים בעיקר כדי התרבות חיידקים ופטריות.
  • נוזל תרבות: התאים גדלים בתוך נוזלי מדיה. צמיחה מיקרוביאלית נקבע על-ידי הזמן לקחת את נוזלי כדי ליצור colloidal השעיה. טכניקה זו משמשת לאבחון טפילים וזיהוי mycobacteria.[27]
  • תרבית תאים: אדם או חיה תרביות תאים נגועים עם חיידק של עניין. תרבויות אלה הם מכן נצפתה כדי לקבוע את ההשפעה של חיידק יש את התאים. טכניקה זו משמשת לזיהוי וירוסים.

מיקרוסקופ

תרבות טכניקות לעתים קרובות להשתמש בבדיקה מיקרוסקופית כדי לעזור בזיהוי של החיידק. מכשירים כגון מתחם אור מיקרוסקופים יכול לשמש כדי להעריך היבטים קריטיים של האורגניזם. זה יכול להתבצע מיד לאחר המדגם נלקח מן המטופל, והוא משמש בשילוב עם ביו-צביעת טכניקות, המאפשר רזולוציה של תאי תכונות. אלקטרונים מיקרוסקופים ו פלואורסצנטי מיקרוסקופים משמשים גם התבוננות חיידקים בפירוט רב יותר על מחקר.[28]

בדיקות ביוכימיות

מהר יחסית פשוטה בדיקות ביוכימיות יכול לשמש כדי לזהות מדבקים. חיידקים זיהוי, השימוש מטבולית או אנזימטי מאפיינים נפוצים בשל היכולת שלהם להתסיס פחמימות בדפוסים אופייניים שלהם הסוג ואת המינים. חומצות, אלכוהול וגזים הם בדרך כלל מזוהה המבחנים האלה כאשר חיידקים גדלים סלקטיבי נוזלי או מוצק התקשורת, כאמור לעיל. על מנת לבצע את הבדיקות הללו בהמוניהם, מכונות אוטומטיות משמשות. מכונות אלה לבצע מספר בדיקות ביוכימיות בו זמנית, באמצעות כרטיסי עם מספר בארות המכיל שונים מיובש כימיקלים. את החיידק של עניין יגיב עם כל חומר כימי באופן ספציפי, סיוע שלה זהות.

סרולוגית השיטות מאוד רגיש, ספציפי, לעתים קרובות מאוד מהירה בדיקות מעבדה משמשים כדי לזהות סוגים שונים של מיקרואורגניזמים. הבדיקות מבוססות על היכולת של נוגדנים כדי לאגד במיוחד של אנטיגן. אנטיגן (בדרך כלל חלבון או פחמימות שבוצעו על-ידי הסוכן זיהומיות) מחויב על ידי נוגדנים, מה שמאפשר סוג זה של בדיקה כדי לשמש עבור אורגניזמים אחרים מאשר חיידקים. זה מחייב ואז מפעיל שרשרת של אירועים יכול להיות בקלות ומוחלט שנצפו, בהתאם מבחן. מורכב יותר סרולוגית טכניקות ידועות כמו immunoassays. באמצעות בסיס קבוע כפי שתואר לעיל, immunoassays יכול לזהות או למדוד אנטיגנים משני זיהומיות סוכנים או חלבונים שנוצרו על ידי המארח נגוע בתגובה זיהום.

תגובת שרשרת של פולימראז

תגובת שרשרת של פולימראז (PCR) מבחני הנפוץ ביותר בשימוש מולקולרית טכניקה כדי לזהות וללמוד חיידקים.[29] לעומת שיטות אחרות, רצף וניתוח מוחלט, אמין, מדויק ומהיר.[30] היום, כמותית PCR הוא הטכניקה העיקרית בשימוש, גם שיטה זו מספקת נתונים מהירה יותר לעומת תקן ה-PCR assay. למשל, מסורתיים טכניקות PCR דורשים את השימוש של ג ' ל אלקטרופורזה כדי להמחיש מוגבר מולקולות ה-DNA אחרי התגובה סיים. כמותית PCR אינו מחייב את זה, כמו מערכת זיהוי משתמש הקרינה ואת בדיקות כדי לזהות את מולקולות ה-DNA כפי שהם להיות מוגבר.[31] בנוסף לכך, כמותית PCR גם מסיר את הסיכון של זיהום זה יכול להתרחש במהלך תקן ה-PCR הליכים (נושא על PCR המוצר לתוך הבאים PCRs). יתרון נוסף של שימוש PCR כדי לזהות וללמוד חיידקים זה רצף הדנ " א של שהתגלתה זיהומיות חיידקים או זנים יכול להיות בהשוואה לאלו שכבר רשום במאגר מידע, אשר בתורו, מסייע להגדיל את ההבנה של איזה אורגניזם הגורם מחלה זיהומית, ולכן מה שיטות אפשריות של טיפול יכול להיות בשימוש. טכניקה זו היא בתקן הנוכחי לגילוי זיהומים נגיפיים כגון איידס ו - צהבת.

טיפולים

פעם אחת זיהום אובחן וזיהה, מתאים אפשרויות הטיפול חייב להיות מוערך על ידי רופא, יעוץ רפואי מיקרוביולוגים. זיהומים מסוימים יכולים להיות מטופל על ידי הגוף עצמו של המערכת החיסונית, אבל זיהומים קשים יותר מטופלים עם מיקרוביאלית סמים. זיהומים חיידקיים מטופלים עם אנטיבקטריאליים (נקרא לעתים אנטיביוטיקה) ואילו פטרייתי ו - ויראלי זיהומים מטופלים עם טיפול אנטי פטרייתי ו ויראליים בהתאמה. בחורה בשיעור של תרופות המכונה antiparasitics משמשים לטיפול מחלות טפיליות.

רפואי מיקרוביולוגים לעתים קרובות להפוך את המלצות הטיפול של החולה לרופא מבוסס על זן של חיידק שלה אנטיביוטיקה ההתנגדויות, האתר של זיהום, פוטנציאל רעילות של תרופות מיקרוביאלית וכל אלרגיות תרופה לחולה יש.

עמידות לאנטיביוטיקה בדיקות: חיידקים בתרבות בצד שמאל רגישים לאנטיביוטיקה הכלול לבן, נייר דיסקים. חיידקים בתרבות מימין עמידים ביותר של אנטיביוטיקה.

בנוסף סמים להיות ספציפי לסוג מסוים של האורגניזם (חיידקים, פטריות, וכו'.), כמה תרופות ספציפיות מסוימת מין או מינים של האורגניזם, ולא לעבוד על אורגניזמים אחרים. בגלל זה הספציפיות, רפואי מיקרוביולוגים חייב לשקול את היעילות של כמה תרופות מיקרוביאלית בעת ביצוע המלצות. בנוסף, זנים של אורגניזם יכול להיות עמידים בפני מסוים סמים או מחלקה של סמים, אפילו כאשר הוא בדרך כלל יעיל נגד המינים. זנים אלה, שכונו זנים עמידים, להציג רציני על בריאות הציבור, הדאגה של גידול חשיבות התעשייה הרפואית כמו התפשטות של עמידות לאנטיביוטיקה מחמיר. מיקרוביאלית התנגדות הוא בעייתי יותר ויותר עניין זה מוביל מיליוני מקרי מוות בכל שנה.[32]

תוך עמידות לתרופות כוללת בדרך כלל חיידקים כימית inactivating מיקרוביאלית סמים או תא מכנית עוצר את ספיגת התרופה, צורה נוספת של התרופה ההתנגדות יכולה לנבוע היווצרות של biofilms. חיידקים מסוימים מסוגלים ליצור biofilms על ידי שמירה על משטחים להתקנים מושתלים כגון קטטרים ו תותבות ויצירת מטריצה חוץ-תאית , עבור תאים אחרים לדבוק.[33] זה מספק אותם עם סביבה יציבה שממנו החיידקים יכולים להתפזר, להדביק חלקים אחרים של המארח. בנוסף, המטריצה החוץ-תאית צפופה השכבה החיצונית של תאים חיידקיים יכולים להגן הפנימי חיידקים מתאי תרופות מיקרוביאלית.[34]

רפואי מיקרוביולוגיה היא לא רק על אבחון וטיפול במחלה, זה כרוך גם המחקר של חיידקים מועילים. חיידקים הוכחו להיות מועיל במאבק נגד מחלות זיהומיות, קידום בריאות. טיפולים יכולים להתפתח מחיידקים, כפי שהודגם על ידי אלכסנדר פלמינג גילוי הפניצילין כמו גם פיתוח חדש של אנטיביוטיקה מן חיידקי סוג Streptomyces בין רבים אחרים.[35] לא רק הם מיקרואורגניזמים מקור של אנטיביוטיקה אבל כמה יכול גם לפעול כמו פרוביוטיקה כדי לספק יתרונות בריאותיים המארח, כגון מתן יותר בריאות מערכת העיכול או עיכוב פתוגנים.[36]

ראה גם

הערות והפניות

תבנית:Reflist

  1. ^ http://jcm.asm.org/content/48/10/3465.full.pdf
  2. ^ Frank N. Egerton (2006). "A History of the Ecological Sciences, Part 19: Leeuwenhoek's Microscopic Natural History". Bulletin of the Ecological Society of America. 87: 47. doi:10.1890/0012-9623(2006)87[47:AHOTES]2.0.CO;2.
  3. ^ Madigan M; Martinko J, eds. (2006). Brock Biology of Microorganisms (13th ed.). Pearson Education. p. 1096. ISBN 0-321-73551-X.
  4. ^ Brock TD (1999). Robert Koch: a life in medicine and bacteriology. Washington DC: American Society of Microbiology Press. ISBN 1-55581-143-4.
  5. ^ Sanger F, Nicklen S, Coulson AR (1977) DNA sequencing with chain-terminating inhibitors" Proceedings of the National Academy of Sciences 74:5463-5467.
  6. ^ Fleischmann R, Adams M, White O, Clayton R, Kirkness E, Kerlavage A, Bult C, Tomb J, Dougherty B, Merrick J, al. e (1995) Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd" Science 269:496-512.
  7. ^ Prescott LM, Harley JP, Klein DA (2005) Microbiology: McGraw-Hill Higher Education.
  8. ^ Shaikh N; Leonard E; Martin JM (בספטמבר 2010). "Prevalence of streptococcal pharyngitis and streptococcal carriage in children: a meta-analysis". Pediatrics. 126 (3): 557–564. doi:10.1542/peds.2009-2648. PMID 20696723. {{cite journal}}: (עזרה)
  9. ^ Vos T (בדצמבר 2012). "Years lived with disability (YLDs) for 1160 sequelae of 289 diseases and injuries 1990–2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010". Lancet. 380: 2163–96. doi:10.1016/S0140-6736(12)61729-2. PMID 23245607. {{cite journal}}: (עזרה); פרמטר לא ידוע |displayauthors= (הצעה: |display-authors=) (עזרה)
  10. ^ "Typhoid Fever". World Health Organization. נבדק ב-2013-04-25.
  11. ^ Dennehy PH (2012). "Rotavirus infection: an update on management and prevention". Advances in Pediatrics. 59 (1): 47–74. doi:10.1016/j.yapd.2012.04.002. PMID 22789574.
  12. ^ "Hepatitis C". World Health Organization. נבדק ב-2013-04-25.
  13. ^ Dunne EF; Unger ER; Sternberg, M (בפברואר 2007). "Prevalence of HPV infection among females in the United States". Journal of the American Medical Association. 297 (8): 813–9. doi:10.1001/jama.297.8.813. PMID 17327523. {{cite journal}}: (עזרה)
  14. ^ "World Health Statistics 2012". World Health Organization. נבדק ב-2013-04-25.
  15. ^ Kappus KD; Lundgren RG, Jr.; Juranek DD; Roberts JM; Spencer HC (ביוני 1994). "Intestinal parasitism in the United States: update on a continuing problem". American Society of Tropical Medicine and Hygiene. 50 (6): 705–13. PMID 8024063. {{cite journal}}: (עזרה); פרמטר לא ידוע |displayauthors= (הצעה: |display-authors=) (עזרה)
  16. ^ "Toxoplasmosis". Centers for Disease Control and Prevention. נבדק ב-2013-04-25.
  17. ^ "Candidiasis". Centers for Disease Control and Prevention. נבדק ב-2013-04-25.
  18. ^ "Histoplasmosis". Centers for Disease Control and Prevention. נבדק ב-2013-04-25.
  19. ^ Washington, JA (1996). "10 Principles of Diagnosis". In Baron, S (ed.). Medical Microbiology (4th ed.). University of Texas Medical Branch at Galveston. ISBN 0-9631172-1-1.
  20. ^ Siebeling, RJ (1998). "Chapter 7 Principles of bacterial pathogenesis". In Bittar, Neville, E, B (ed.). Microbiology. Elsevier. p. 87. ISBN 1-55938-814-5.
  21. ^ Rhinehart E; Friedman M (1999). Infection control in home care. Jones & Bartlett Learning. p. 11. ISBN 0-8342-1143-2.
  22. ^ Roberts RJ, "Fish pathology, 3rd Edition" ,Elsevier Health Sciences, 2001.
  23. ^ Roizman, B (1996). "42 Multiplication". In Baron, S (ed.). Medical Microbiology (4th ed.). University of Texas Medical Branch at Galveston. ISBN 0-9631172-1-1.
  24. ^ Hilleman M (באוקטובר 2004). "Strategies and mechanisms for host and pathogen survival in acute and persistent viral infections". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101: 14560–14566. doi:10.1073/pnas.0404758101. PMC 521982. PMID 15297608. {{cite journal}}: (עזרה)
  25. ^ Greggs WM; Clouser CL; Patterson SE; Manksy LM (באפריל 2012). "Discovery of drugs that possess activity against feline leukemia virus". Journal of General Virology. 93 (4): 900–905. doi:10.1099/vir.0.039909-0. {{cite journal}}: (עזרה)
  26. ^ Nester E; Anderson D; Evans Roberts, C; Nester M (2009). Microbiology: A human perspective. McGraw Hill. pp. 336–337. ISBN 1-55938-814-5.
  27. ^ Møller M; El Maghrabi R; Olesen N; Thomsen VØ (בנובמבר 2004). "Safe inoculation of blood and bone marrow for liquid culture detection of mycobacteria". Occupational Medicine. 54 (8): 530–3. doi:10.1093/occmed/kqh106. PMID 15520021. {{cite journal}}: (עזרה)
  28. ^ Madigan MT (2009) Brock Biology of Microorganisms: Pearson/Benjamin Cummings.
  29. ^ Mackay I (2007). Real-time PCR in Microbiology: From Diagnosis to Characterisation. Horizon Scientific Press. pp. 1–25. ISBN 9781904455189.
  30. ^ Viljoen GJ; Nel LH; Crowther JR, eds. (2005). Molecular Diagnostic PCR Handbook. Springer. p. 58. ISBN 978-1-4020-3404-6.
  31. ^ Tang YW; Persing DH (2009). Encyclopedia of Microbiology. Oxford Academic Press. pp. 308–320. ISBN 978-0-12-373944-5.
  32. ^ WHO (באפריל 2014). "Antimicrobial resistance: global report on surveillance 2014". WHO. WHO. נבדק ב-9 במאי 2015. {{cite web}}: (עזרה)
  33. ^ Vickery K, Hu H, Jacombs AS, Bradshaw DA, Deva AK (2013) A review of bacterial biofilms and their role in device-associated infection.
  34. ^ Stewart PS; Costerton JW (ביולי 2001). "Antibiotic resistance of bacteria in biofilms". Lancet. 358 (9276): 135–8. doi:10.1016/S0140-6736(01)05321-1. PMID 11463434. {{cite journal}}: (עזרה)
  35. ^ Taguchi T, Yabe M, Odaki H, Shinozaki M, Metsä-Ketelä M, Arai T, Okamoto S, Ichinose K (2013) Biosynthetic Conclusions from the Functional Dissection of Oxygenases for Biosynthesis of Actinorhodin and Related Streptomyces Antibiotics.
  36. ^ Williams NT (2010) Probiotics.